src/jalview/ws/jws2/JabaPreset.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.6)
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  17  */
  18 package jalview.ws.jws2;
  19
  20 import jalview.ws.jws2.Jws2Discoverer.Jws2Instance;
  21 import jalview.ws.params.ArgumentI;
  22 import jalview.ws.params.WsParamSetI;
  23
  24 import java.util.List;
  25
  26 import compbio.metadata.Preset;
  27
  28 public class JabaPreset implements WsParamSetI {
  29   Preset p=null;
  30   Jws2Instance service;
  31   public JabaPreset(Jws2Instance svc, Preset preset) {
  32     service=svc;
  33     p=preset;
  34   }
  35   @Override
  36   public String getName()
  37   {
  38     return p.getName();
  39   }
  40   @Override
  41   public String getDescription()
  42   {
  43     return p.getDescription();
  44   }
  45   @Override
  46   public String[] getApplicableUrls()
  47   {
  48     return new String[] { service.getUri()};
  49   }
  50   @Override
  51   public String getSourceFile()
  52   {
  53     return null;
  54   }
  55   @Override
  56   public boolean isModifiable()
  57   {
  58     return false;
  59   }
  60   @Override
  61   public void setSourceFile(String newfile)
  62   {
  63     throw new Error("Cannot set source file for "+getClass());
  64   }
  65   @Override
  66   public List<ArgumentI> getArguments()
  67   {
  68     try {
  69     return JabaParamStore.getJwsArgsfromJaba(p.getArguments(service.getRunnerConfig()));
  70     }
  71     catch (Exception e)
  72     {
  73       e.printStackTrace();
  74       throw new Error("Probable mismatch between service instance and preset!");
  75     }
  76   }
  77   @Override
  78   public void setArguments(List<ArgumentI> args)
  79   {
  80     throw new Error("Cannot set Parameters for a Jaba Web service's preset");
  81   }
  82 }