src/jalview/ws/jws2/JabaPreset.java

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  17  */
  18 package jalview.ws.jws2;
  19
  20 import jalview.ws.jws2.Jws2Discoverer.Jws2Instance;
  21 import jalview.ws.params.ArgumentI;
  22 import jalview.ws.params.WsParamSetI;
  23
  24 import java.util.List;
  25
  26 import compbio.metadata.Preset;
  27
  28 public class JabaPreset implements WsParamSetI
  29 {
  30   Preset p = null;
  31
  32   Jws2Instance service;
  33
  34   public JabaPreset(Jws2Instance svc, Preset preset)
  35   {
  36     service = svc;
  37     p = preset;
  38   }
  39
  40   @Override
  41   public String getName()
  42   {
  43     return p.getName();
  44   }
  45
  46   @Override
  47   public String getDescription()
  48   {
  49     return p.getDescription();
  50   }
  51
  52   @Override
  53   public String[] getApplicableUrls()
  54   {
  55     return new String[]
  56     { service.getUri() };
  57   }
  58
  59   @Override
  60   public String getSourceFile()
  61   {
  62     return null;
  63   }
  64
  65   @Override
  66   public boolean isModifiable()
  67   {
  68     return false;
  69   }
  70
  71   @Override
  72   public void setSourceFile(String newfile)
  73   {
  74     throw new Error("Cannot set source file for " + getClass());
  75   }
  76
  77   @Override
  78   public List<ArgumentI> getArguments()
  79   {
  80     try
  81     {
  82       return JabaParamStore.getJwsArgsfromJaba(p.getArguments(service
  83               .getRunnerConfig()));
  84     } catch (Exception e)
  85     {
  86       e.printStackTrace();
  87       throw new Error(
  88               "Probable mismatch between service instance and preset!");
  89     }
  90   }
  91
  92   @Override
  93   public void setArguments(List<ArgumentI> args)
  94   {
  95     throw new Error("Cannot set Parameters for a Jaba Web service's preset");
  96   }
  97 }