2835e1c3d906fdffb4f3951b874380ae4fb48bf8
[jalview.git] / src / jalview / ws / params / AutoCalcSetting.java
1 /*
2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8)
3  * Copyright (C) 2012 J Procter, AM Waterhouse, LM Lui, J Engelhardt, G Barton, M Clamp, S Searle
4  * 
5  * This file is part of Jalview.
6  * 
7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
8  * modify it under the terms of the GNU General Public License 
9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
10  *  
11  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
12  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
13  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
14  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
15  * 
16  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
17  */
18 package jalview.ws.params;
19
20 import java.util.List;
21
22 public abstract class AutoCalcSetting
23 {
24
25   protected boolean autoUpdate;
26
27   protected WsParamSetI preset;
28
29   protected List<ArgumentI> jobArgset;
30
31   public AutoCalcSetting(WsParamSetI preset2, List<ArgumentI> jobArgset2,
32           boolean autoUpdate2)
33   {
34     autoUpdate = autoUpdate2;
35     preset = preset2;
36     jobArgset = jobArgset2;
37   }
38
39   public boolean isAutoUpdate()
40   {
41     return autoUpdate;
42   }
43
44   public void setAutoUpdate(boolean autoUpdate)
45   {
46     this.autoUpdate = autoUpdate;
47   }
48
49   public WsParamSetI getPreset()
50   {
51     return preset;
52   }
53
54   public void setPreset(WsParamSetI preset)
55   {
56     // TODO: test if service URL is in presets
57     this.preset = preset;
58   }
59
60   public List<ArgumentI> getArgumentSet()
61   {
62     return jobArgset;
63   }
64
65   /**
66    * 
67    * @return characteristic URI for this service. The URI should reflect the
68    *         type and version of this service, enabling the service client code
69    *         to recover the correct client for this calculation.
70    */
71   public abstract String getServiceURI();
72
73   /**
74    * return any concrete service endpoints associated with this calculation.
75    * built in services should return a zero length array
76    * 
77    * @return
78    */
79   public abstract String[] getServiceURLs();
80
81   /**
82    * 
83    * @return stringified representation of the parameters for this setting
84    */
85   public abstract String getWsParamFile();
86
87 }