src/jalview/ws/rest/AlignmentProcessor.java

   1 package jalview.ws.rest;
   2
   3 import jalview.datamodel.AlignmentI;
   4
   5 public interface AlignmentProcessor {
   6   /**
   7    * prepare the context alignment for this input
   8    * @param al - alignment to be processed
   9    * @return al or a new alignment with appropriate attributes/order for input
  10    */
  11   public AlignmentI prepareAlignment(AlignmentI al);
  12 }