src/jalview/ws/sifts/MappingOutputPojo.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
  12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package jalview.ws.sifts;
  22
  23 public class MappingOutputPojo
  24 {
  25   private String seqName;
  26
  27   private String seqResidue;
  28
  29   private int seqStart;
  30
  31   private int seqEnd;
  32
  33   private String strName;
  34
  35   private String strResidue;
  36
  37   private int strStart;
  38
  39   private int strEnd;
  40
  41   private String type;
  42
  43   private static final int MAX_ID_LENGTH = 30;
  44
  45   public String getSeqName()
  46   {
  47     return seqName;
  48   }
  49
  50   public void setSeqName(String seqName)
  51   {
  52     this.seqName = (seqName.length() > MAX_ID_LENGTH) ? seqName.substring(
  53             0, MAX_ID_LENGTH) : seqName;
  54   }
  55
  56   public String getSeqResidue()
  57   {
  58     return seqResidue;
  59   }
  60
  61   public void setSeqResidue(String seqResidue)
  62   {
  63     this.seqResidue = seqResidue;
  64   }
  65
  66   public int getSeqStart()
  67   {
  68     return seqStart;
  69   }
  70
  71   public void setSeqStart(int seqStart)
  72   {
  73     this.seqStart = seqStart;
  74   }
  75
  76   public int getSeqEnd()
  77   {
  78     return seqEnd;
  79   }
  80
  81   public void setSeqEnd(int seqEnd)
  82   {
  83     this.seqEnd = seqEnd;
  84   }
  85
  86   public String getStrName()
  87   {
  88     return strName;
  89   }
  90
  91   public void setStrName(String strName)
  92   {
  93     this.strName = (strName.length() > MAX_ID_LENGTH) ? strName.substring(
  94             0, MAX_ID_LENGTH) : strName;
  95   }
  96
  97   public String getStrResidue()
  98   {
  99     return strResidue;
 100   }
 101
 102   public void setStrResidue(String strResidue)
 103   {
 104     this.strResidue = strResidue;
 105   }
 106
 107   public int getStrStart()
 108   {
 109     return strStart;
 110   }
 111
 112   public void setStrStart(int strStart)
 113   {
 114     this.strStart = strStart;
 115   }
 116
 117   public int getStrEnd()
 118   {
 119     return strEnd;
 120   }
 121
 122   public void setStrEnd(int strEnd)
 123   {
 124     this.strEnd = strEnd;
 125   }
 126
 127   public String getType()
 128   {
 129     return type;
 130   }
 131
 132   public void setType(String type)
 133   {
 134     this.type = type;
 135   }
 136
 137 }