src/jalview/ws/sifts/MappingOutputPojo.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
  12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package jalview.ws.sifts;
  22
  23 public class MappingOutputPojo
  24 {
  25   private String seqName;
  26
  27   private String seqResidue;
  28
  29   private int seqStart;
  30
  31   private int seqEnd;
  32
  33   private String strName;
  34
  35   private String strResidue;
  36
  37   private int strStart;
  38
  39   private int strEnd;
  40
  41   private String type;
  42
  43   private static final int MAX_ID_LENGTH = 30;
  44
  45   public String getSeqName()
  46   {
  47     return seqName;
  48   }
  49
  50   public void setSeqName(String seqName)
  51   {
  52     this.seqName = (seqName.length() > MAX_ID_LENGTH)
  53             ? seqName.substring(0, MAX_ID_LENGTH)
  54             : seqName;
  55   }
  56
  57   public String getSeqResidue()
  58   {
  59     return seqResidue;
  60   }
  61
  62   public void setSeqResidue(String seqResidue)
  63   {
  64     this.seqResidue = seqResidue;
  65   }
  66
  67   public int getSeqStart()
  68   {
  69     return seqStart;
  70   }
  71
  72   public void setSeqStart(int seqStart)
  73   {
  74     this.seqStart = seqStart;
  75   }
  76
  77   public int getSeqEnd()
  78   {
  79     return seqEnd;
  80   }
  81
  82   public void setSeqEnd(int seqEnd)
  83   {
  84     this.seqEnd = seqEnd;
  85   }
  86
  87   public String getStrName()
  88   {
  89     return strName;
  90   }
  91
  92   public void setStrName(String strName)
  93   {
  94     this.strName = (strName.length() > MAX_ID_LENGTH)
  95             ? strName.substring(0, MAX_ID_LENGTH)
  96             : strName;
  97   }
  98
  99   public String getStrResidue()
 100   {
 101     return strResidue;
 102   }
 103
 104   public void setStrResidue(String strResidue)
 105   {
 106     this.strResidue = strResidue;
 107   }
 108
 109   public int getStrStart()
 110   {
 111     return strStart;
 112   }
 113
 114   public void setStrStart(int strStart)
 115   {
 116     this.strStart = strStart;
 117   }
 118
 119   public int getStrEnd()
 120   {
 121     return strEnd;
 122   }
 123
 124   public void setStrEnd(int strEnd)
 125   {
 126     this.strEnd = strEnd;
 127   }
 128
 129   public String getType()
 130   {
 131     return type;
 132   }
 133
 134   public void setType(String type)
 135   {
 136     this.type = type;
 137   }
 138
 139 }