src/jalview/ws/slivkaws/SlivkaParamSet.java

   1 package jalview.ws.slivkaws;
   2
   3 import jalview.ws.params.ArgumentI;
   4 import jalview.ws.params.WsParamSetI;
   5 import jalview.ws.params.simple.BooleanOption;
   6 import jalview.ws.params.simple.DoubleParameter;
   7 import jalview.ws.params.simple.IntegerParameter;
   8 import jalview.ws.params.simple.StringParameter;
   9
  10 import java.io.IOException;
  11 import java.util.ArrayList;
  12 import java.util.List;
  13
  14 import uk.ac.dundee.compbio.slivkaclient.BooleanField;
  15 import uk.ac.dundee.compbio.slivkaclient.ChoiceField;
  16 import uk.ac.dundee.compbio.slivkaclient.DecimalField;
  17 import uk.ac.dundee.compbio.slivkaclient.FormField;
  18 import uk.ac.dundee.compbio.slivkaclient.IntegerField;
  19 import uk.ac.dundee.compbio.slivkaclient.SlivkaForm;
  20 import uk.ac.dundee.compbio.slivkaclient.SlivkaService;
  21 import uk.ac.dundee.compbio.slivkaclient.TextField;
  22
  23
  24
  25 public class SlivkaParamSet implements WsParamSetI
  26 {
  27   private SlivkaService service;
  28   private List<ArgumentI> args = new ArrayList<>();
  29
  30   SlivkaParamSet(SlivkaService service) throws IOException {
  31     this.service = service;
  32     SlivkaForm form = service.getForm();
  33     for (FormField field : form.getFields())
  34     {
  35       switch (field.getType()) {
  36       case BOOLEAN:
  37         BooleanField boolField = (BooleanField) field;
  38         args.add(new BooleanOption(
  39             field.getName(), field.getDescription(), field.getLabel(),
  40             field.isRequired(), boolField.getDefault(), null
  41         ));
  42         break;
  43       case TEXT:
  44         TextField textField = (TextField) field;
  45         args.add(new StringParameter(
  46             field.getName(), field.getDescription(), field.isRequired(),
  47             textField.getDefault(), textField.getDefault()
  48         ));
  49         break;
  50       case INTEGER:
  51         IntegerField intField = (IntegerField) field;
  52         args.add(new IntegerParameter(
  53             field.getName(), field.getDescription(), field.isRequired(),
  54             intField.getDefault(), intField.getMin(), intField.getMax()
  55         ));
  56         break;
  57       case DECIMAL:
  58         DecimalField doubleField = (DecimalField) field;
  59         args.add(new DoubleParameter(
  60             field.getName(), field.getDescription(), field.isRequired(),
  61             doubleField.getDefault(), doubleField.getMin(),
  62             doubleField.getMax()
  63         ));
  64         break;
  65       case CHOICE:
  66         ChoiceField choiceField = (ChoiceField) field;
  67         List<String> choices = new ArrayList<>(choiceField.getChoices());
  68         if (field.hasMultipleValues()) {
  69           int counter = 0;
  70           for (String choice : choices) {
  71             args.add(new BooleanOption(
  72                 String.format("%s$%d", field.getName(), counter++),
  73                 field.getDescription(), choice, field.isRequired(),
  74                 choice.equals(choiceField.getDefault()), choice,
  75                 null
  76             ));
  77           }
  78         }
  79         else
  80         {
  81           args.add(new StringParameter(
  82               field.getName(), field.getDescription(),
  83               field.isRequired(), choiceField.getDefault(), choiceField.getDefault(),
  84               choices, choices
  85           ));
  86         }
  87         break;
  88       case FILE:
  89       default:
  90         continue;
  91       }
  92     }
  93   }
  94
  95   @Override
  96   public String getName()
  97   {
  98     return "Default";
  99   }
 100
 101   @Override
 102   public String getDescription()
 103   {
 104     return "";
 105   }
 106
 107   @Override
 108   public String[] getApplicableUrls()
 109   {
 110     return new String[] { service.getURL().toString() };
 111   }
 112
 113   @Override
 114   public String getSourceFile()
 115   {
 116     return null;
 117   }
 118
 119   @Override
 120   public void setSourceFile(String newfile)
 121   {
 122   }
 123
 124   @Override
 125   public boolean isModifiable()
 126   {
 127     return true;
 128   }
 129
 130   @Override
 131   public List<ArgumentI> getArguments()
 132   {
 133     return args;
 134   }
 135
 136   @Override
 137   public void setArguments(List<ArgumentI> args)
 138   {
 139     throw new RuntimeException();
 140   }
 141
 142 }