src/jalview/ws2/actions/secstructpred/SecStructPredJob.java

   1 package jalview.ws2.actions.secstructpred;
   2
   3 import java.util.List;
   4 import java.util.Map;
   5
   6 import jalview.analysis.SeqsetUtils.SequenceInfo;
   7 import jalview.datamodel.SequenceI;
   8 import jalview.ws2.actions.BaseJob;
   9
  10 public class SecStructPredJob extends BaseJob
  11 {
  12   private final int[] delMap;
  13
  14   private final SequenceI refSeq;
  15
  16   final Map<String, SequenceInfo> seqNames;
  17
  18   SecStructPredJob(List<SequenceI> sequences, SequenceI refSeq, int[] delMap,
  19       Map<String, SequenceInfo> seqNames)
  20   {
  21     super(sequences);
  22     this.refSeq = refSeq;
  23     this.delMap = delMap;
  24     this.seqNames = seqNames;
  25   }
  26
  27   @Override
  28   public boolean isInputValid()
  29   {
  30     return true;
  31   }
  32
  33   public int[] getDelMap()
  34   {
  35     return this.delMap;
  36   }
  37 }