src/jalview/xml/binding/jalview/AnnotationColourScheme.java

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   7
   8 package jalview.xml.binding.jalview;
   9
  10 import javax.xml.bind.annotation.XmlAccessType;
  11 import javax.xml.bind.annotation.XmlAccessorType;
  12 import javax.xml.bind.annotation.XmlAttribute;
  13 import javax.xml.bind.annotation.XmlType;
  14
  15 /**
  16  * <p>
  17  * Java class for AnnotationColourScheme complex type.
  18  *
  19  * <p>
  20  * The following schema fragment specifies the expected content contained within
  21  * this class.
  22  *
  23  * <pre>
  24  * &lt;complexType name="AnnotationColourScheme">
  25  *   &lt;complexContent>
  26  *     &lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType">
  27  *       &lt;attribute name="aboveThreshold" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}int" />
  28  *       &lt;attribute name="annotation" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" />
  29  *       &lt;attribute name="minColour" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}int" />
  30  *       &lt;attribute name="maxColour" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}int" />
  31  *       &lt;attribute name="colourScheme" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" />
  32  *       &lt;attribute name="threshold" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}float" />
  33  *       &lt;attribute name="perSequence" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}boolean" />
  34  *       &lt;attribute name="predefinedColours" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}boolean" />
  35  *     &lt;/restriction>
  36  *   &lt;/complexContent>
  37  * &lt;/complexType>
  38  * </pre>
  39  *
  40  *
  41  */
  42 @XmlAccessorType(XmlAccessType.FIELD)
  43 @XmlType(name = "AnnotationColourScheme", namespace = "www.jalview.org")
  44 public class AnnotationColourScheme
  45 {
  46
  47   @XmlAttribute(name = "aboveThreshold")
  48   protected Integer aboveThreshold;
  49
  50   @XmlAttribute(name = "annotation")
  51   protected String annotation;
  52
  53   @XmlAttribute(name = "minColour")
  54   protected Integer minColour;
  55
  56   @XmlAttribute(name = "maxColour")
  57   protected Integer maxColour;
  58
  59   @XmlAttribute(name = "colourScheme")
  60   protected String colourScheme;
  61
  62   @XmlAttribute(name = "threshold")
  63   protected Float threshold;
  64
  65   @XmlAttribute(name = "perSequence")
  66   protected Boolean perSequence;
  67
  68   @XmlAttribute(name = "predefinedColours")
  69   protected Boolean predefinedColours;
  70
  71   /**
  72    * Gets the value of the aboveThreshold property.
  73    *
  74    * @return possible object is {@link Integer }
  75    *
  76    */
  77   public Integer getAboveThreshold()
  78   {
  79     return aboveThreshold;
  80   }
  81
  82   /**
  83    * Sets the value of the aboveThreshold property.
  84    *
  85    * @param value
  86    *          allowed object is {@link Integer }
  87    *
  88    */
  89   public void setAboveThreshold(Integer value)
  90   {
  91     this.aboveThreshold = value;
  92   }
  93
  94   /**
  95    * Gets the value of the annotation property.
  96    *
  97    * @return possible object is {@link String }
  98    *
  99    */
 100   public String getAnnotation()
 101   {
 102     return annotation;
 103   }
 104
 105   /**
 106    * Sets the value of the annotation property.
 107    *
 108    * @param value
 109    *          allowed object is {@link String }
 110    *
 111    */
 112   public void setAnnotation(String value)
 113   {
 114     this.annotation = value;
 115   }
 116
 117   /**
 118    * Gets the value of the minColour property.
 119    *
 120    * @return possible object is {@link Integer }
 121    *
 122    */
 123   public Integer getMinColour()
 124   {
 125     return minColour;
 126   }
 127
 128   /**
 129    * Sets the value of the minColour property.
 130    *
 131    * @param value
 132    *          allowed object is {@link Integer }
 133    *
 134    */
 135   public void setMinColour(Integer value)
 136   {
 137     this.minColour = value;
 138   }
 139
 140   /**
 141    * Gets the value of the maxColour property.
 142    *
 143    * @return possible object is {@link Integer }
 144    *
 145    */
 146   public Integer getMaxColour()
 147   {
 148     return maxColour;
 149   }
 150
 151   /**
 152    * Sets the value of the maxColour property.
 153    *
 154    * @param value
 155    *          allowed object is {@link Integer }
 156    *
 157    */
 158   public void setMaxColour(Integer value)
 159   {
 160     this.maxColour = value;
 161   }
 162
 163   /**
 164    * Gets the value of the colourScheme property.
 165    *
 166    * @return possible object is {@link String }
 167    *
 168    */
 169   public String getColourScheme()
 170   {
 171     return colourScheme;
 172   }
 173
 174   /**
 175    * Sets the value of the colourScheme property.
 176    *
 177    * @param value
 178    *          allowed object is {@link String }
 179    *
 180    */
 181   public void setColourScheme(String value)
 182   {
 183     this.colourScheme = value;
 184   }
 185
 186   /**
 187    * Gets the value of the threshold property.
 188    *
 189    * @return possible object is {@link Float }
 190    *
 191    */
 192   public Float getThreshold()
 193   {
 194     return threshold;
 195   }
 196
 197   /**
 198    * Sets the value of the threshold property.
 199    *
 200    * @param value
 201    *          allowed object is {@link Float }
 202    *
 203    */
 204   public void setThreshold(Float value)
 205   {
 206     this.threshold = value;
 207   }
 208
 209   /**
 210    * Gets the value of the perSequence property.
 211    *
 212    * @return possible object is {@link Boolean }
 213    *
 214    */
 215   public Boolean isPerSequence()
 216   {
 217     return perSequence;
 218   }
 219
 220   /**
 221    * Sets the value of the perSequence property.
 222    *
 223    * @param value
 224    *          allowed object is {@link Boolean }
 225    *
 226    */
 227   public void setPerSequence(Boolean value)
 228   {
 229     this.perSequence = value;
 230   }
 231
 232   /**
 233    * Gets the value of the predefinedColours property.
 234    *
 235    * @return possible object is {@link Boolean }
 236    *
 237    */
 238   public Boolean isPredefinedColours()
 239   {
 240     return predefinedColours;
 241   }
 242
 243   /**
 244    * Sets the value of the predefinedColours property.
 245    *
 246    * @param value
 247    *          allowed object is {@link Boolean }
 248    *
 249    */
 250   public void setPredefinedColours(Boolean value)
 251   {
 252     this.predefinedColours = value;
 253   }
 254
 255 }