src/jalview/xml/binding/jalview/PcaDataType.java

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   7
   8 package jalview.xml.binding.jalview;
   9
  10 import javax.xml.bind.annotation.XmlAccessType;
  11 import javax.xml.bind.annotation.XmlAccessorType;
  12 import javax.xml.bind.annotation.XmlElement;
  13 import javax.xml.bind.annotation.XmlType;
  14
  15 /**
  16  *
  17  * The results of a PCA calculation
  18  *
  19  *
  20  * <p>
  21  * Java class for PcaDataType complex type.
  22  *
  23  * <p>
  24  * The following schema fragment specifies the expected content contained within
  25  * this class.
  26  *
  27  * <pre>
  28  * &lt;complexType name="PcaDataType">
  29  *   &lt;complexContent>
  30  *     &lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType">
  31  *       &lt;sequence>
  32  *         &lt;element name="pairwiseMatrix" type="{www.jalview.org}DoubleMatrix"/>
  33  *         &lt;element name="tridiagonalMatrix" type="{www.jalview.org}DoubleMatrix"/>
  34  *         &lt;element name="eigenMatrix" type="{www.jalview.org}DoubleMatrix"/>
  35  *       &lt;/sequence>
  36  *     &lt;/restriction>
  37  *   &lt;/complexContent>
  38  * &lt;/complexType>
  39  * </pre>
  40  *
  41  *
  42  */
  43 @XmlAccessorType(XmlAccessType.FIELD)
  44 @XmlType(
  45   name = "PcaDataType",
  46   namespace = "www.jalview.org",
  47   propOrder =
  48   { "pairwiseMatrix", "tridiagonalMatrix", "eigenMatrix" })
  49 public class PcaDataType
  50 {
  51
  52   @XmlElement(required = true)
  53   protected DoubleMatrix pairwiseMatrix;
  54
  55   @XmlElement(required = true)
  56   protected DoubleMatrix tridiagonalMatrix;
  57
  58   @XmlElement(required = true)
  59   protected DoubleMatrix eigenMatrix;
  60
  61   /**
  62    * Gets the value of the pairwiseMatrix property.
  63    *
  64    * @return possible object is {@link DoubleMatrix }
  65    *
  66    */
  67   public DoubleMatrix getPairwiseMatrix()
  68   {
  69     return pairwiseMatrix;
  70   }
  71
  72   /**
  73    * Sets the value of the pairwiseMatrix property.
  74    *
  75    * @param value
  76    *          allowed object is {@link DoubleMatrix }
  77    *
  78    */
  79   public void setPairwiseMatrix(DoubleMatrix value)
  80   {
  81     this.pairwiseMatrix = value;
  82   }
  83
  84   /**
  85    * Gets the value of the tridiagonalMatrix property.
  86    *
  87    * @return possible object is {@link DoubleMatrix }
  88    *
  89    */
  90   public DoubleMatrix getTridiagonalMatrix()
  91   {
  92     return tridiagonalMatrix;
  93   }
  94
  95   /**
  96    * Sets the value of the tridiagonalMatrix property.
  97    *
  98    * @param value
  99    *          allowed object is {@link DoubleMatrix }
 100    *
 101    */
 102   public void setTridiagonalMatrix(DoubleMatrix value)
 103   {
 104     this.tridiagonalMatrix = value;
 105   }
 106
 107   /**
 108    * Gets the value of the eigenMatrix property.
 109    *
 110    * @return possible object is {@link DoubleMatrix }
 111    *
 112    */
 113   public DoubleMatrix getEigenMatrix()
 114   {
 115     return eigenMatrix;
 116   }
 117
 118   /**
 119    * Sets the value of the eigenMatrix property.
 120    *
 121    * @param value
 122    *          allowed object is {@link DoubleMatrix }
 123    *
 124    */
 125   public void setEigenMatrix(DoubleMatrix value)
 126   {
 127     this.eigenMatrix = value;
 128   }
 129
 130 }