src/jalview/xml/binding/jalview/PcaDataType.java

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   9 package jalview.xml.binding.jalview;
  10
  11 import javax.xml.bind.annotation.XmlAccessType;
  12 import javax.xml.bind.annotation.XmlAccessorType;
  13 import javax.xml.bind.annotation.XmlElement;
  14 import javax.xml.bind.annotation.XmlType;
  15
  16
  17 /**
  18  *
  19  *                              The results of a PCA calculation
  20  *
  21  *
  22  * &lt;p&gt;Java class for PcaDataType complex type.
  23  *
  24  * &lt;p&gt;The following schema fragment specifies the expected content contained within this class.
  25  *
  26  * &lt;pre&gt;
  27  * &amp;lt;complexType name="PcaDataType"&amp;gt;
  28  *   &amp;lt;complexContent&amp;gt;
  29  *     &amp;lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType"&amp;gt;
  30  *       &amp;lt;sequence&amp;gt;
  31  *         &amp;lt;element name="pairwiseMatrix" type="{www.jalview.org}DoubleMatrix"/&amp;gt;
  32  *         &amp;lt;element name="tridiagonalMatrix" type="{www.jalview.org}DoubleMatrix"/&amp;gt;
  33  *         &amp;lt;element name="eigenMatrix" type="{www.jalview.org}DoubleMatrix"/&amp;gt;
  34  *       &amp;lt;/sequence&amp;gt;
  35  *     &amp;lt;/restriction&amp;gt;
  36  *   &amp;lt;/complexContent&amp;gt;
  37  * &amp;lt;/complexType&amp;gt;
  38  * &lt;/pre&gt;
  39  *
  40  *
  41  */
  42 @XmlAccessorType(XmlAccessType.FIELD)
  43 @XmlType(name = "PcaDataType", namespace = "www.jalview.org", propOrder = {
  44     "pairwiseMatrix",
  45     "tridiagonalMatrix",
  46     "eigenMatrix"
  47 })
  48 public class PcaDataType {
  49
  50     @XmlElement(required = true)
  51     protected DoubleMatrix pairwiseMatrix;
  52     @XmlElement(required = true)
  53     protected DoubleMatrix tridiagonalMatrix;
  54     @XmlElement(required = true)
  55     protected DoubleMatrix eigenMatrix;
  56
  57     /**
  58      * Gets the value of the pairwiseMatrix property.
  59      *
  60      * @return
  61      *     possible object is
  62      *     {@link DoubleMatrix }
  63      *
  64      */
  65     public DoubleMatrix getPairwiseMatrix() {
  66         return pairwiseMatrix;
  67     }
  68
  69     /**
  70      * Sets the value of the pairwiseMatrix property.
  71      *
  72      * @param value
  73      *     allowed object is
  74      *     {@link DoubleMatrix }
  75      *
  76      */
  77     public void setPairwiseMatrix(DoubleMatrix value) {
  78         this.pairwiseMatrix = value;
  79     }
  80
  81     /**
  82      * Gets the value of the tridiagonalMatrix property.
  83      *
  84      * @return
  85      *     possible object is
  86      *     {@link DoubleMatrix }
  87      *
  88      */
  89     public DoubleMatrix getTridiagonalMatrix() {
  90         return tridiagonalMatrix;
  91     }
  92
  93     /**
  94      * Sets the value of the tridiagonalMatrix property.
  95      *
  96      * @param value
  97      *     allowed object is
  98      *     {@link DoubleMatrix }
  99      *
 100      */
 101     public void setTridiagonalMatrix(DoubleMatrix value) {
 102         this.tridiagonalMatrix = value;
 103     }
 104
 105     /**
 106      * Gets the value of the eigenMatrix property.
 107      *
 108      * @return
 109      *     possible object is
 110      *     {@link DoubleMatrix }
 111      *
 112      */
 113     public DoubleMatrix getEigenMatrix() {
 114         return eigenMatrix;
 115     }
 116
 117     /**
 118      * Sets the value of the eigenMatrix property.
 119      *
 120      * @param value
 121      *     allowed object is
 122      *     {@link DoubleMatrix }
 123      *
 124      */
 125     public void setEigenMatrix(DoubleMatrix value) {
 126         this.eigenMatrix = value;
 127     }
 128
 129 }