src/jalview/xml/binding/jalview/VAMSAS.java

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   8 package jalview.xml.binding.jalview;
   9
  10 import java.util.ArrayList;
  11 import java.util.List;
  12 import javax.xml.bind.annotation.XmlAccessType;
  13 import javax.xml.bind.annotation.XmlAccessorType;
  14 import javax.xml.bind.annotation.XmlElement;
  15 import javax.xml.bind.annotation.XmlType;
  16
  17 /**
  18  * <p>
  19  * Java class for VAMSAS complex type.
  20  *
  21  * <p>
  22  * The following schema fragment specifies the expected content contained within
  23  * this class.
  24  *
  25  * <pre>
  26  * &lt;complexType name="VAMSAS">
  27  *   &lt;complexContent>
  28  *     &lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType">
  29  *       &lt;sequence>
  30  *         &lt;element name="Tree" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" maxOccurs="unbounded" minOccurs="0"/>
  31  *         &lt;element ref="{www.vamsas.ac.uk/jalview/version2}SequenceSet" maxOccurs="unbounded" minOccurs="0"/>
  32  *       &lt;/sequence>
  33  *     &lt;/restriction>
  34  *   &lt;/complexContent>
  35  * &lt;/complexType>
  36  * </pre>
  37  *
  38  *
  39  */
  40 @XmlAccessorType(XmlAccessType.FIELD)
  41 @XmlType(name = "VAMSAS", propOrder = { "tree", "sequenceSet" })
  42 public class VAMSAS
  43 {
  44
  45   @XmlElement(name = "Tree")
  46   protected List<String> tree;
  47
  48   @XmlElement(name = "SequenceSet")
  49   protected List<SequenceSet> sequenceSet;
  50
  51   /**
  52    * Gets the value of the tree property.
  53    *
  54    * <p>
  55    * This accessor method returns a reference to the live list, not a snapshot.
  56    * Therefore any modification you make to the returned list will be present
  57    * inside the JAXB object. This is why there is not a <CODE>set</CODE> method
  58    * for the tree property.
  59    *
  60    * <p>
  61    * For example, to add a new item, do as follows:
  62    *
  63    * <pre>
  64    * getTree().add(newItem);
  65    * </pre>
  66    *
  67    *
  68    * <p>
  69    * Objects of the following type(s) are allowed in the list {@link String }
  70    *
  71    *
  72    */
  73   public List<String> getTree()
  74   {
  75     if (tree == null)
  76     {
  77       tree = new ArrayList<String>();
  78     }
  79     return this.tree;
  80   }
  81
  82   /**
  83    * Gets the value of the sequenceSet property.
  84    *
  85    * <p>
  86    * This accessor method returns a reference to the live list, not a snapshot.
  87    * Therefore any modification you make to the returned list will be present
  88    * inside the JAXB object. This is why there is not a <CODE>set</CODE> method
  89    * for the sequenceSet property.
  90    *
  91    * <p>
  92    * For example, to add a new item, do as follows:
  93    *
  94    * <pre>
  95    * getSequenceSet().add(newItem);
  96    * </pre>
  97    *
  98    *
  99    * <p>
 100    * Objects of the following type(s) are allowed in the list {@link SequenceSet
 101    * }
 102    *
 103    *
 104    */
 105   public List<SequenceSet> getSequenceSet()
 106   {
 107     if (sequenceSet == null)
 108     {
 109       sequenceSet = new ArrayList<SequenceSet>();
 110     }
 111     return this.sequenceSet;
 112   }
 113
 114 }