src/jalview/xml/binding/jalview/VAMSAS.java

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   9 package jalview.xml.binding.jalview;
  10
  11 import java.util.ArrayList;
  12 import java.util.List;
  13 import javax.xml.bind.annotation.XmlAccessType;
  14 import javax.xml.bind.annotation.XmlAccessorType;
  15 import javax.xml.bind.annotation.XmlElement;
  16 import javax.xml.bind.annotation.XmlType;
  17
  18
  19 /**
  20  * &lt;p&gt;Java class for VAMSAS complex type.
  21  *
  22  * &lt;p&gt;The following schema fragment specifies the expected content contained within this class.
  23  *
  24  * &lt;pre&gt;
  25  * &amp;lt;complexType name="VAMSAS"&amp;gt;
  26  *   &amp;lt;complexContent&amp;gt;
  27  *     &amp;lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType"&amp;gt;
  28  *       &amp;lt;sequence&amp;gt;
  29  *         &amp;lt;element name="Tree" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" maxOccurs="unbounded" minOccurs="0"/&amp;gt;
  30  *         &amp;lt;element ref="{www.vamsas.ac.uk/jalview/version2}SequenceSet" maxOccurs="unbounded" minOccurs="0"/&amp;gt;
  31  *       &amp;lt;/sequence&amp;gt;
  32  *     &amp;lt;/restriction&amp;gt;
  33  *   &amp;lt;/complexContent&amp;gt;
  34  * &amp;lt;/complexType&amp;gt;
  35  * &lt;/pre&gt;
  36  *
  37  *
  38  */
  39 @XmlAccessorType(XmlAccessType.FIELD)
  40 @XmlType(name = "VAMSAS", propOrder = {
  41     "tree",
  42     "sequenceSet"
  43 })
  44 public class VAMSAS {
  45
  46     @XmlElement(name = "Tree")
  47     protected List<String> tree;
  48     @XmlElement(name = "SequenceSet")
  49     protected List<SequenceSet> sequenceSet;
  50
  51     /**
  52      * Gets the value of the tree property.
  53      *
  54      * &lt;p&gt;
  55      * This accessor method returns a reference to the live list,
  56      * not a snapshot. Therefore any modification you make to the
  57      * returned list will be present inside the JAXB object.
  58      * This is why there is not a &lt;CODE&gt;set&lt;/CODE&gt; method for the tree property.
  59      *
  60      * &lt;p&gt;
  61      * For example, to add a new item, do as follows:
  62      * &lt;pre&gt;
  63      *    getTree().add(newItem);
  64      * &lt;/pre&gt;
  65      *
  66      *
  67      * &lt;p&gt;
  68      * Objects of the following type(s) are allowed in the list
  69      * {@link String }
  70      *
  71      *
  72      */
  73     public List<String> getTree() {
  74         if (tree == null) {
  75             tree = new ArrayList<String>();
  76         }
  77         return this.tree;
  78     }
  79
  80     /**
  81      * Gets the value of the sequenceSet property.
  82      *
  83      * &lt;p&gt;
  84      * This accessor method returns a reference to the live list,
  85      * not a snapshot. Therefore any modification you make to the
  86      * returned list will be present inside the JAXB object.
  87      * This is why there is not a &lt;CODE&gt;set&lt;/CODE&gt; method for the sequenceSet property.
  88      *
  89      * &lt;p&gt;
  90      * For example, to add a new item, do as follows:
  91      * &lt;pre&gt;
  92      *    getSequenceSet().add(newItem);
  93      * &lt;/pre&gt;
  94      *
  95      *
  96      * &lt;p&gt;
  97      * Objects of the following type(s) are allowed in the list
  98      * {@link SequenceSet }
  99      *
 100      *
 101      */
 102     public List<SequenceSet> getSequenceSet() {
 103         if (sequenceSet == null) {
 104             sequenceSet = new ArrayList<SequenceSet>();
 105         }
 106         return this.sequenceSet;
 107     }
 108
 109 }