src/jalview/xml/binding/uniprot/CofactorType.java

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   7
   8
   9 package jalview.xml.binding.uniprot;
  10
  11 import java.util.ArrayList;
  12 import java.util.List;
  13 import javax.xml.bind.annotation.XmlAccessType;
  14 import javax.xml.bind.annotation.XmlAccessorType;
  15 import javax.xml.bind.annotation.XmlAttribute;
  16 import javax.xml.bind.annotation.XmlElement;
  17 import javax.xml.bind.annotation.XmlType;
  18
  19
  20 /**
  21  * Describes a cofactor.
  22  *
  23  * <p>Java class for cofactorType complex type.
  24  *
  25  * <p>The following schema fragment specifies the expected content contained within this class.
  26  *
  27  * <pre>
  28  * &lt;complexType name="cofactorType">
  29  *   &lt;complexContent>
  30  *     &lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType">
  31  *       &lt;sequence>
  32  *         &lt;element name="name" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string"/>
  33  *         &lt;element name="dbReference" type="{http://uniprot.org/uniprot}dbReferenceType"/>
  34  *       &lt;/sequence>
  35  *       &lt;attribute name="evidence" type="{http://uniprot.org/uniprot}intListType" />
  36  *     &lt;/restriction>
  37  *   &lt;/complexContent>
  38  * &lt;/complexType>
  39  * </pre>
  40  *
  41  *
  42  */
  43 @XmlAccessorType(XmlAccessType.FIELD)
  44 @XmlType(name = "cofactorType", propOrder = {
  45     "name",
  46     "dbReference"
  47 })
  48 public class CofactorType {
  49
  50     @XmlElement(required = true)
  51     protected String name;
  52     @XmlElement(required = true)
  53     protected DbReferenceType dbReference;
  54     @XmlAttribute(name = "evidence")
  55     protected List<Integer> evidence;
  56
  57     /**
  58      * Gets the value of the name property.
  59      *
  60      * @return
  61      *     possible object is
  62      *     {@link String }
  63      *
  64      */
  65     public String getName() {
  66         return name;
  67     }
  68
  69     /**
  70      * Sets the value of the name property.
  71      *
  72      * @param value
  73      *     allowed object is
  74      *     {@link String }
  75      *
  76      */
  77     public void setName(String value) {
  78         this.name = value;
  79     }
  80
  81     /**
  82      * Gets the value of the dbReference property.
  83      *
  84      * @return
  85      *     possible object is
  86      *     {@link DbReferenceType }
  87      *
  88      */
  89     public DbReferenceType getDbReference() {
  90         return dbReference;
  91     }
  92
  93     /**
  94      * Sets the value of the dbReference property.
  95      *
  96      * @param value
  97      *     allowed object is
  98      *     {@link DbReferenceType }
  99      *
 100      */
 101     public void setDbReference(DbReferenceType value) {
 102         this.dbReference = value;
 103     }
 104
 105     /**
 106      * Gets the value of the evidence property.
 107      *
 108      * <p>
 109      * This accessor method returns a reference to the live list,
 110      * not a snapshot. Therefore any modification you make to the
 111      * returned list will be present inside the JAXB object.
 112      * This is why there is not a <CODE>set</CODE> method for the evidence property.
 113      *
 114      * <p>
 115      * For example, to add a new item, do as follows:
 116      * <pre>
 117      *    getEvidence().add(newItem);
 118      * </pre>
 119      *
 120      *
 121      * <p>
 122      * Objects of the following type(s) are allowed in the list
 123      * {@link Integer }
 124      *
 125      *
 126      */
 127     public List<Integer> getEvidence() {
 128         if (evidence == null) {
 129             evidence = new ArrayList<Integer>();
 130         }
 131         return this.evidence;
 132     }
 133
 134 }