src/jalview/xml/binding/uniprot/LocationType.java

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   8
   9 package jalview.xml.binding.uniprot;
  10
  11 import javax.xml.bind.annotation.XmlAccessType;
  12 import javax.xml.bind.annotation.XmlAccessorType;
  13 import javax.xml.bind.annotation.XmlAttribute;
  14 import javax.xml.bind.annotation.XmlType;
  15
  16
  17 /**
  18  * Describes a sequence location as either a range with a begin and end or as a position. The 'sequence' attribute is only used when the location is not on the canonical sequence displayed in the current entry.
  19  *
  20  * <p>Java class for locationType complex type.
  21  *
  22  * <p>The following schema fragment specifies the expected content contained within this class.
  23  *
  24  * <pre>
  25  * &lt;complexType name="locationType">
  26  *   &lt;complexContent>
  27  *     &lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType">
  28  *       &lt;choice>
  29  *         &lt;sequence>
  30  *           &lt;element name="begin" type="{http://uniprot.org/uniprot}positionType"/>
  31  *           &lt;element name="end" type="{http://uniprot.org/uniprot}positionType"/>
  32  *         &lt;/sequence>
  33  *         &lt;element name="position" type="{http://uniprot.org/uniprot}positionType"/>
  34  *       &lt;/choice>
  35  *       &lt;attribute name="sequence" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" />
  36  *     &lt;/restriction>
  37  *   &lt;/complexContent>
  38  * &lt;/complexType>
  39  * </pre>
  40  *
  41  *
  42  */
  43 @XmlAccessorType(XmlAccessType.FIELD)
  44 @XmlType(name = "locationType", propOrder = {
  45     "begin",
  46     "end",
  47     "position"
  48 })
  49 public class LocationType {
  50
  51     protected PositionType begin;
  52     protected PositionType end;
  53     protected PositionType position;
  54     @XmlAttribute(name = "sequence")
  55     protected String sequence;
  56
  57     /**
  58      * Gets the value of the begin property.
  59      *
  60      * @return
  61      *     possible object is
  62      *     {@link PositionType }
  63      *
  64      */
  65     public PositionType getBegin() {
  66         return begin;
  67     }
  68
  69     /**
  70      * Sets the value of the begin property.
  71      *
  72      * @param value
  73      *     allowed object is
  74      *     {@link PositionType }
  75      *
  76      */
  77     public void setBegin(PositionType value) {
  78         this.begin = value;
  79     }
  80
  81     /**
  82      * Gets the value of the end property.
  83      *
  84      * @return
  85      *     possible object is
  86      *     {@link PositionType }
  87      *
  88      */
  89     public PositionType getEnd() {
  90         return end;
  91     }
  92
  93     /**
  94      * Sets the value of the end property.
  95      *
  96      * @param value
  97      *     allowed object is
  98      *     {@link PositionType }
  99      *
 100      */
 101     public void setEnd(PositionType value) {
 102         this.end = value;
 103     }
 104
 105     /**
 106      * Gets the value of the position property.
 107      *
 108      * @return
 109      *     possible object is
 110      *     {@link PositionType }
 111      *
 112      */
 113     public PositionType getPosition() {
 114         return position;
 115     }
 116
 117     /**
 118      * Sets the value of the position property.
 119      *
 120      * @param value
 121      *     allowed object is
 122      *     {@link PositionType }
 123      *
 124      */
 125     public void setPosition(PositionType value) {
 126         this.position = value;
 127     }
 128
 129     /**
 130      * Gets the value of the sequence property.
 131      *
 132      * @return
 133      *     possible object is
 134      *     {@link String }
 135      *
 136      */
 137     public String getSequence() {
 138         return sequence;
 139     }
 140
 141     /**
 142      * Sets the value of the sequence property.
 143      *
 144      * @param value
 145      *     allowed object is
 146      *     {@link String }
 147      *
 148      */
 149     public void setSequence(String value) {
 150         this.sequence = value;
 151     }
 152
 153 }