src/jalview/xml/binding/uniprot/ReactionType.java

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   9 package jalview.xml.binding.uniprot;
  10
  11 import java.util.ArrayList;
  12 import java.util.List;
  13 import javax.xml.bind.annotation.XmlAccessType;
  14 import javax.xml.bind.annotation.XmlAccessorType;
  15 import javax.xml.bind.annotation.XmlAttribute;
  16 import javax.xml.bind.annotation.XmlElement;
  17 import javax.xml.bind.annotation.XmlType;
  18
  19
  20 /**
  21  * Describes a chemical reaction.
  22  *
  23  * <p>Java class for reactionType complex type.
  24  *
  25  * <p>The following schema fragment specifies the expected content contained within this class.
  26  *
  27  * <pre>
  28  * &lt;complexType name="reactionType">
  29  *   &lt;complexContent>
  30  *     &lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType">
  31  *       &lt;sequence>
  32  *         &lt;element name="text" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string"/>
  33  *         &lt;element name="dbReference" type="{http://uniprot.org/uniprot}dbReferenceType" maxOccurs="unbounded"/>
  34  *       &lt;/sequence>
  35  *       &lt;attribute name="evidence" type="{http://uniprot.org/uniprot}intListType" />
  36  *     &lt;/restriction>
  37  *   &lt;/complexContent>
  38  * &lt;/complexType>
  39  * </pre>
  40  *
  41  *
  42  */
  43 @XmlAccessorType(XmlAccessType.FIELD)
  44 @XmlType(name = "reactionType", propOrder = {
  45     "text",
  46     "dbReference"
  47 })
  48 public class ReactionType {
  49
  50     @XmlElement(required = true)
  51     protected String text;
  52     @XmlElement(required = true)
  53     protected List<DbReferenceType> dbReference;
  54     @XmlAttribute(name = "evidence")
  55     protected List<Integer> evidence;
  56
  57     /**
  58      * Gets the value of the text property.
  59      *
  60      * @return
  61      *     possible object is
  62      *     {@link String }
  63      *
  64      */
  65     public String getText() {
  66         return text;
  67     }
  68
  69     /**
  70      * Sets the value of the text property.
  71      *
  72      * @param value
  73      *     allowed object is
  74      *     {@link String }
  75      *
  76      */
  77     public void setText(String value) {
  78         this.text = value;
  79     }
  80
  81     /**
  82      * Gets the value of the dbReference property.
  83      *
  84      * <p>
  85      * This accessor method returns a reference to the live list,
  86      * not a snapshot. Therefore any modification you make to the
  87      * returned list will be present inside the JAXB object.
  88      * This is why there is not a <CODE>set</CODE> method for the dbReference property.
  89      *
  90      * <p>
  91      * For example, to add a new item, do as follows:
  92      * <pre>
  93      *    getDbReference().add(newItem);
  94      * </pre>
  95      *
  96      *
  97      * <p>
  98      * Objects of the following type(s) are allowed in the list
  99      * {@link DbReferenceType }
 100      *
 101      *
 102      */
 103     public List<DbReferenceType> getDbReference() {
 104         if (dbReference == null) {
 105             dbReference = new ArrayList<DbReferenceType>();
 106         }
 107         return this.dbReference;
 108     }
 109
 110     /**
 111      * Gets the value of the evidence property.
 112      *
 113      * <p>
 114      * This accessor method returns a reference to the live list,
 115      * not a snapshot. Therefore any modification you make to the
 116      * returned list will be present inside the JAXB object.
 117      * This is why there is not a <CODE>set</CODE> method for the evidence property.
 118      *
 119      * <p>
 120      * For example, to add a new item, do as follows:
 121      * <pre>
 122      *    getEvidence().add(newItem);
 123      * </pre>
 124      *
 125      *
 126      * <p>
 127      * Objects of the following type(s) are allowed in the list
 128      * {@link Integer }
 129      *
 130      *
 131      */
 132     public List<Integer> getEvidence() {
 133         if (evidence == null) {
 134             evidence = new ArrayList<Integer>();
 135         }
 136         return this.evidence;
 137     }
 138
 139 }