src/jalview/xml/binding/uniprot/ReferenceType.java

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   2 // This file was generated by the JavaTM Architecture for XML Binding(JAXB) Reference Implementation, v2.2.8-b130911.1802
   3 // See <a href="http://java.sun.com/xml/jaxb">http://java.sun.com/xml/jaxb</a>
   4 // Any modifications to this file will be lost upon recompilation of the source schema.
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   7
   8
   9 package jalview.xml.binding.uniprot;
  10
  11 import java.util.ArrayList;
  12 import java.util.List;
  13 import javax.xml.bind.annotation.XmlAccessType;
  14 import javax.xml.bind.annotation.XmlAccessorType;
  15 import javax.xml.bind.annotation.XmlAttribute;
  16 import javax.xml.bind.annotation.XmlElement;
  17 import javax.xml.bind.annotation.XmlType;
  18
  19
  20 /**
  21  * Describes a citation and a summary of its content.
  22  *             Equivalent to the flat file RN-, RP-, RC-, RX-, RG-, RA-, RT- and RL-lines.
  23  *
  24  * <p>Java class for referenceType complex type.
  25  *
  26  * <p>The following schema fragment specifies the expected content contained within this class.
  27  *
  28  * <pre>
  29  * &lt;complexType name="referenceType">
  30  *   &lt;complexContent>
  31  *     &lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType">
  32  *       &lt;sequence>
  33  *         &lt;element name="citation" type="{http://uniprot.org/uniprot}citationType"/>
  34  *         &lt;group ref="{http://uniprot.org/uniprot}sptrCitationGroup"/>
  35  *       &lt;/sequence>
  36  *       &lt;attribute name="evidence" type="{http://uniprot.org/uniprot}intListType" />
  37  *       &lt;attribute name="key" use="required" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" />
  38  *     &lt;/restriction>
  39  *   &lt;/complexContent>
  40  * &lt;/complexType>
  41  * </pre>
  42  *
  43  *
  44  */
  45 @XmlAccessorType(XmlAccessType.FIELD)
  46 @XmlType(name = "referenceType", propOrder = {
  47     "citation",
  48     "scope",
  49     "source"
  50 })
  51 public class ReferenceType {
  52
  53     @XmlElement(required = true)
  54     protected CitationType citation;
  55     @XmlElement(required = true)
  56     protected List<String> scope;
  57     protected SourceDataType source;
  58     @XmlAttribute(name = "evidence")
  59     protected List<Integer> evidence;
  60     @XmlAttribute(name = "key", required = true)
  61     protected String key;
  62
  63     /**
  64      * Gets the value of the citation property.
  65      *
  66      * @return
  67      *     possible object is
  68      *     {@link CitationType }
  69      *
  70      */
  71     public CitationType getCitation() {
  72         return citation;
  73     }
  74
  75     /**
  76      * Sets the value of the citation property.
  77      *
  78      * @param value
  79      *     allowed object is
  80      *     {@link CitationType }
  81      *
  82      */
  83     public void setCitation(CitationType value) {
  84         this.citation = value;
  85     }
  86
  87     /**
  88      * Gets the value of the scope property.
  89      *
  90      * <p>
  91      * This accessor method returns a reference to the live list,
  92      * not a snapshot. Therefore any modification you make to the
  93      * returned list will be present inside the JAXB object.
  94      * This is why there is not a <CODE>set</CODE> method for the scope property.
  95      *
  96      * <p>
  97      * For example, to add a new item, do as follows:
  98      * <pre>
  99      *    getScope().add(newItem);
 100      * </pre>
 101      *
 102      *
 103      * <p>
 104      * Objects of the following type(s) are allowed in the list
 105      * {@link String }
 106      *
 107      *
 108      */
 109     public List<String> getScope() {
 110         if (scope == null) {
 111             scope = new ArrayList<String>();
 112         }
 113         return this.scope;
 114     }
 115
 116     /**
 117      * Gets the value of the source property.
 118      *
 119      * @return
 120      *     possible object is
 121      *     {@link SourceDataType }
 122      *
 123      */
 124     public SourceDataType getSource() {
 125         return source;
 126     }
 127
 128     /**
 129      * Sets the value of the source property.
 130      *
 131      * @param value
 132      *     allowed object is
 133      *     {@link SourceDataType }
 134      *
 135      */
 136     public void setSource(SourceDataType value) {
 137         this.source = value;
 138     }
 139
 140     /**
 141      * Gets the value of the evidence property.
 142      *
 143      * <p>
 144      * This accessor method returns a reference to the live list,
 145      * not a snapshot. Therefore any modification you make to the
 146      * returned list will be present inside the JAXB object.
 147      * This is why there is not a <CODE>set</CODE> method for the evidence property.
 148      *
 149      * <p>
 150      * For example, to add a new item, do as follows:
 151      * <pre>
 152      *    getEvidence().add(newItem);
 153      * </pre>
 154      *
 155      *
 156      * <p>
 157      * Objects of the following type(s) are allowed in the list
 158      * {@link Integer }
 159      *
 160      *
 161      */
 162     public List<Integer> getEvidence() {
 163         if (evidence == null) {
 164             evidence = new ArrayList<Integer>();
 165         }
 166         return this.evidence;
 167     }
 168
 169     /**
 170      * Gets the value of the key property.
 171      *
 172      * @return
 173      *     possible object is
 174      *     {@link String }
 175      *
 176      */
 177     public String getKey() {
 178         return key;
 179     }
 180
 181     /**
 182      * Sets the value of the key property.
 183      *
 184      * @param value
 185      *     allowed object is
 186      *     {@link String }
 187      *
 188      */
 189     public void setKey(String value) {
 190         this.key = value;
 191     }
 192
 193 }