src/uk/ac/ebi/picr/model/UPEntry.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.7)\r
   3  * Copyright (C) 2011 J Procter, AM Waterhouse, J Engelhardt, LM Lui, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  * \r
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   6  * \r
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  15  * \r
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  17  */\r
  18 package uk.ac.ebi.picr.model;\r
  19 \r
  20 public class UPEntry implements java.io.Serializable\r
  21 {\r
  22   private java.lang.String CRC64;\r
  23 \r
  24   private java.lang.String UPI;\r
  25 \r
  26   private uk.ac.ebi.picr.model.CrossReference[] identicalCrossReferences;\r
  27 \r
  28   private uk.ac.ebi.picr.model.CrossReference[] logicalCrossReferences;\r
  29 \r
  30   private java.lang.String sequence;\r
  31 \r
  32   private java.util.Calendar timestamp;\r
  33 \r
  34   public UPEntry()\r
  35   {\r
  36   }\r
  37 \r
  38   public UPEntry(java.lang.String CRC64, java.lang.String UPI,\r
  39           uk.ac.ebi.picr.model.CrossReference[] identicalCrossReferences,\r
  40           uk.ac.ebi.picr.model.CrossReference[] logicalCrossReferences,\r
  41           java.lang.String sequence, java.util.Calendar timestamp)\r
  42   {\r
  43     this.CRC64 = CRC64;\r
  44     this.UPI = UPI;\r
  45     this.identicalCrossReferences = identicalCrossReferences;\r
  46     this.logicalCrossReferences = logicalCrossReferences;\r
  47     this.sequence = sequence;\r
  48     this.timestamp = timestamp;\r
  49   }\r
  50 \r
  51   /**\r
  52    * Gets the CRC64 value for this UPEntry.\r
  53    * \r
  54    * @return CRC64\r
  55    */\r
  56   public java.lang.String getCRC64()\r
  57   {\r
  58     return CRC64;\r
  59   }\r
  60 \r
  61   /**\r
  62    * Sets the CRC64 value for this UPEntry.\r
  63    * \r
  64    * @param CRC64\r
  65    */\r
  66   public void setCRC64(java.lang.String CRC64)\r
  67   {\r
  68     this.CRC64 = CRC64;\r
  69   }\r
  70 \r
  71   /**\r
  72    * Gets the UPI value for this UPEntry.\r
  73    * \r
  74    * @return UPI\r
  75    */\r
  76   public java.lang.String getUPI()\r
  77   {\r
  78     return UPI;\r
  79   }\r
  80 \r
  81   /**\r
  82    * Sets the UPI value for this UPEntry.\r
  83    * \r
  84    * @param UPI\r
  85    */\r
  86   public void setUPI(java.lang.String UPI)\r
  87   {\r
  88     this.UPI = UPI;\r
  89   }\r
  90 \r
  91   /**\r
  92    * Gets the identicalCrossReferences value for this UPEntry.\r
  93    * \r
  94    * @return identicalCrossReferences\r
  95    */\r
  96   public uk.ac.ebi.picr.model.CrossReference[] getIdenticalCrossReferences()\r
  97   {\r
  98     return identicalCrossReferences;\r
  99   }\r
 100 \r
 101   /**\r
 102    * Sets the identicalCrossReferences value for this UPEntry.\r
 103    * \r
 104    * @param identicalCrossReferences\r
 105    */\r
 106   public void setIdenticalCrossReferences(\r
 107           uk.ac.ebi.picr.model.CrossReference[] identicalCrossReferences)\r
 108   {\r
 109     this.identicalCrossReferences = identicalCrossReferences;\r
 110   }\r
 111 \r
 112   public uk.ac.ebi.picr.model.CrossReference getIdenticalCrossReferences(\r
 113           int i)\r
 114   {\r
 115     return this.identicalCrossReferences[i];\r
 116   }\r
 117 \r
 118   public void setIdenticalCrossReferences(int i,\r
 119           uk.ac.ebi.picr.model.CrossReference _value)\r
 120   {\r
 121     this.identicalCrossReferences[i] = _value;\r
 122   }\r
 123 \r
 124   /**\r
 125    * Gets the logicalCrossReferences value for this UPEntry.\r
 126    * \r
 127    * @return logicalCrossReferences\r
 128    */\r
 129   public uk.ac.ebi.picr.model.CrossReference[] getLogicalCrossReferences()\r
 130   {\r
 131     return logicalCrossReferences;\r
 132   }\r
 133 \r
 134   /**\r
 135    * Sets the logicalCrossReferences value for this UPEntry.\r
 136    * \r
 137    * @param logicalCrossReferences\r
 138    */\r
 139   public void setLogicalCrossReferences(\r
 140           uk.ac.ebi.picr.model.CrossReference[] logicalCrossReferences)\r
 141   {\r
 142     this.logicalCrossReferences = logicalCrossReferences;\r
 143   }\r
 144 \r
 145   public uk.ac.ebi.picr.model.CrossReference getLogicalCrossReferences(int i)\r
 146   {\r
 147     return this.logicalCrossReferences[i];\r
 148   }\r
 149 \r
 150   public void setLogicalCrossReferences(int i,\r
 151           uk.ac.ebi.picr.model.CrossReference _value)\r
 152   {\r
 153     this.logicalCrossReferences[i] = _value;\r
 154   }\r
 155 \r
 156   /**\r
 157    * Gets the sequence value for this UPEntry.\r
 158    * \r
 159    * @return sequence\r
 160    */\r
 161   public java.lang.String getSequence()\r
 162   {\r
 163     return sequence;\r
 164   }\r
 165 \r
 166   /**\r
 167    * Sets the sequence value for this UPEntry.\r
 168    * \r
 169    * @param sequence\r
 170    */\r
 171   public void setSequence(java.lang.String sequence)\r
 172   {\r
 173     this.sequence = sequence;\r
 174   }\r
 175 \r
 176   /**\r
 177    * Gets the timestamp value for this UPEntry.\r
 178    * \r
 179    * @return timestamp\r
 180    */\r
 181   public java.util.Calendar getTimestamp()\r
 182   {\r
 183     return timestamp;\r
 184   }\r
 185 \r
 186   /**\r
 187    * Sets the timestamp value for this UPEntry.\r
 188    * \r
 189    * @param timestamp\r
 190    */\r
 191   public void setTimestamp(java.util.Calendar timestamp)\r
 192   {\r
 193     this.timestamp = timestamp;\r
 194   }\r
 195 \r
 196   private java.lang.Object __equalsCalc = null;\r
 197 \r
 198   public synchronized boolean equals(java.lang.Object obj)\r
 199   {\r
 200     if (!(obj instanceof UPEntry))\r
 201       return false;\r
 202     UPEntry other = (UPEntry) obj;\r
 203     if (obj == null)\r
 204       return false;\r
 205     if (this == obj)\r
 206       return true;\r
 207     if (__equalsCalc != null)\r
 208     {\r
 209       return (__equalsCalc == obj);\r
 210     }\r
 211     __equalsCalc = obj;\r
 212     boolean _equals;\r
 213     _equals = true\r
 214             && ((this.CRC64 == null && other.getCRC64() == null) || (this.CRC64 != null && this.CRC64\r
 215                     .equals(other.getCRC64())))\r
 216             && ((this.UPI == null && other.getUPI() == null) || (this.UPI != null && this.UPI\r
 217                     .equals(other.getUPI())))\r
 218             && ((this.identicalCrossReferences == null && other\r
 219                     .getIdenticalCrossReferences() == null) || (this.identicalCrossReferences != null && java.util.Arrays\r
 220                     .equals(this.identicalCrossReferences,\r
 221                             other.getIdenticalCrossReferences())))\r
 222             && ((this.logicalCrossReferences == null && other\r
 223                     .getLogicalCrossReferences() == null) || (this.logicalCrossReferences != null && java.util.Arrays\r
 224                     .equals(this.logicalCrossReferences,\r
 225                             other.getLogicalCrossReferences())))\r
 226             && ((this.sequence == null && other.getSequence() == null) || (this.sequence != null && this.sequence\r
 227                     .equals(other.getSequence())))\r
 228             && ((this.timestamp == null && other.getTimestamp() == null) || (this.timestamp != null && this.timestamp\r
 229                     .equals(other.getTimestamp())));\r
 230     __equalsCalc = null;\r
 231     return _equals;\r
 232   }\r
 233 \r
 234   private boolean __hashCodeCalc = false;\r
 235 \r
 236   public synchronized int hashCode()\r
 237   {\r
 238     if (__hashCodeCalc)\r
 239     {\r
 240       return 0;\r
 241     }\r
 242     __hashCodeCalc = true;\r
 243     int _hashCode = 1;\r
 244     if (getCRC64() != null)\r
 245     {\r
 246       _hashCode += getCRC64().hashCode();\r
 247     }\r
 248     if (getUPI() != null)\r
 249     {\r
 250       _hashCode += getUPI().hashCode();\r
 251     }\r
 252     if (getIdenticalCrossReferences() != null)\r
 253     {\r
 254       for (int i = 0; i < java.lang.reflect.Array\r
 255               .getLength(getIdenticalCrossReferences()); i++)\r
 256       {\r
 257         java.lang.Object obj = java.lang.reflect.Array.get(\r
 258                 getIdenticalCrossReferences(), i);\r
 259         if (obj != null && !obj.getClass().isArray())\r
 260         {\r
 261           _hashCode += obj.hashCode();\r
 262         }\r
 263       }\r
 264     }\r
 265     if (getLogicalCrossReferences() != null)\r
 266     {\r
 267       for (int i = 0; i < java.lang.reflect.Array\r
 268               .getLength(getLogicalCrossReferences()); i++)\r
 269       {\r
 270         java.lang.Object obj = java.lang.reflect.Array.get(\r
 271                 getLogicalCrossReferences(), i);\r
 272         if (obj != null && !obj.getClass().isArray())\r
 273         {\r
 274           _hashCode += obj.hashCode();\r
 275         }\r
 276       }\r
 277     }\r
 278     if (getSequence() != null)\r
 279     {\r
 280       _hashCode += getSequence().hashCode();\r
 281     }\r
 282     if (getTimestamp() != null)\r
 283     {\r
 284       _hashCode += getTimestamp().hashCode();\r
 285     }\r
 286     __hashCodeCalc = false;\r
 287     return _hashCode;\r
 288   }\r
 289 \r
 290 }\r