src/uk/ac/ebi/www/picr/AccessionMappingService/AccessionMapperBindingStub.java

   1 /*
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  18  */
  19 package uk.ac.ebi.www.picr.AccessionMappingService;
  20
  21 public class AccessionMapperBindingStub extends org.apache.axis.client.Stub
  22         implements
  23         uk.ac.ebi.www.picr.AccessionMappingService.AccessionMapperInterface
  24 {
  25   private java.util.Vector cachedSerClasses = new java.util.Vector();
  26
  27   private java.util.Vector cachedSerQNames = new java.util.Vector();
  28
  29   private java.util.Vector cachedSerFactories = new java.util.Vector();
  30
  31   private java.util.Vector cachedDeserFactories = new java.util.Vector();
  32
  33   static org.apache.axis.description.OperationDesc[] _operations;
  34
  35   static
  36   {
  37     _operations = new org.apache.axis.description.OperationDesc[3];
  38     _initOperationDesc1();
  39   }
  40
  41   private static void _initOperationDesc1()
  42   {
  43     org.apache.axis.description.OperationDesc oper;
  44     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();
  45     oper.setName("getUPIForSequence");
  46     oper.addParameter(
  47             new javax.xml.namespace.QName(
  48                     "http://www.ebi.ac.uk/picr/AccessionMappingService",
  49                     "sequence"), new javax.xml.namespace.QName(
  50                     "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"),
  51             java.lang.String.class,
  52             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
  53     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName(
  54             "http://www.ebi.ac.uk/picr/AccessionMappingService",
  55             "searchDatabases"), new javax.xml.namespace.QName(
  56             "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"),
  57             java.lang.String[].class,
  58             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
  59     oper.addParameter(
  60             new javax.xml.namespace.QName(
  61                     "http://www.ebi.ac.uk/picr/AccessionMappingService",
  62                     "taxonId"), new javax.xml.namespace.QName(
  63                     "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"),
  64             java.lang.String.class,
  65             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
  66     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName(
  67             "http://www.ebi.ac.uk/picr/AccessionMappingService",
  68             "onlyActive"), new javax.xml.namespace.QName(
  69             "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "boolean"), boolean.class,
  70             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
  71     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
  72             "http://model.picr.ebi.ac.uk", "UPEntry"));
  73     oper.setReturnClass(uk.ac.ebi.picr.model.UPEntry.class);
  74     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName(
  75             "http://www.ebi.ac.uk/picr/AccessionMappingService",
  76             "getUPIForSequenceReturn"));
  77     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.WRAPPED);
  78     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.LITERAL);
  79     _operations[0] = oper;
  80
  81     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();
  82     oper.setName("getUPIForAccession");
  83     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName(
  84             "http://www.ebi.ac.uk/picr/AccessionMappingService",
  85             "accession"), new javax.xml.namespace.QName(
  86             "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"),
  87             java.lang.String.class,
  88             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
  89     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName(
  90             "http://www.ebi.ac.uk/picr/AccessionMappingService",
  91             "ac_version"), new javax.xml.namespace.QName(
  92             "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"),
  93             java.lang.String.class,
  94             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
  95     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName(
  96             "http://www.ebi.ac.uk/picr/AccessionMappingService",
  97             "searchDatabases"), new javax.xml.namespace.QName(
  98             "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"),
  99             java.lang.String[].class,
 100             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
 101     oper.addParameter(
 102             new javax.xml.namespace.QName(
 103                     "http://www.ebi.ac.uk/picr/AccessionMappingService",
 104                     "taxonId"), new javax.xml.namespace.QName(
 105                     "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"),
 106             java.lang.String.class,
 107             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
 108     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName(
 109             "http://www.ebi.ac.uk/picr/AccessionMappingService",
 110             "onlyActive"), new javax.xml.namespace.QName(
 111             "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "boolean"), boolean.class,
 112             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
 113     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
 114             "http://model.picr.ebi.ac.uk", "UPEntry"));
 115     oper.setReturnClass(uk.ac.ebi.picr.model.UPEntry[].class);
 116     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName(
 117             "http://www.ebi.ac.uk/picr/AccessionMappingService",
 118             "getUPIForAccessionReturn"));
 119     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.WRAPPED);
 120     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.LITERAL);
 121     _operations[1] = oper;
 122
 123     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();
 124     oper.setName("getMappedDatabaseNames");
 125     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
 126             "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"));
 127     oper.setReturnClass(java.lang.String[].class);
 128     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName(
 129             "http://www.ebi.ac.uk/picr/AccessionMappingService",
 130             "mappedDatabases"));
 131     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.WRAPPED);
 132     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.LITERAL);
 133     _operations[2] = oper;
 134
 135   }
 136
 137   public AccessionMapperBindingStub() throws org.apache.axis.AxisFault
 138   {
 139     this(null);
 140   }
 141
 142   public AccessionMapperBindingStub(java.net.URL endpointURL,
 143           javax.xml.rpc.Service service) throws org.apache.axis.AxisFault
 144   {
 145     this(service);
 146     super.cachedEndpoint = endpointURL;
 147   }
 148
 149   public AccessionMapperBindingStub(javax.xml.rpc.Service service)
 150           throws org.apache.axis.AxisFault
 151   {
 152     if (service == null)
 153     {
 154       super.service = new org.apache.axis.client.Service();
 155     }
 156     else
 157     {
 158       super.service = service;
 159     }
 160     java.lang.Class cls;
 161     javax.xml.namespace.QName qName;
 162     java.lang.Class beansf = org.apache.axis.encoding.ser.BeanSerializerFactory.class;
 163     java.lang.Class beandf = org.apache.axis.encoding.ser.BeanDeserializerFactory.class;
 164     java.lang.Class enumsf = org.apache.axis.encoding.ser.EnumSerializerFactory.class;
 165     java.lang.Class enumdf = org.apache.axis.encoding.ser.EnumDeserializerFactory.class;
 166     java.lang.Class arraysf = org.apache.axis.encoding.ser.ArraySerializerFactory.class;
 167     java.lang.Class arraydf = org.apache.axis.encoding.ser.ArrayDeserializerFactory.class;
 168     java.lang.Class simplesf = org.apache.axis.encoding.ser.SimpleSerializerFactory.class;
 169     java.lang.Class simpledf = org.apache.axis.encoding.ser.SimpleDeserializerFactory.class;
 170     java.lang.Class simplelistsf = org.apache.axis.encoding.ser.SimpleListSerializerFactory.class;
 171     java.lang.Class simplelistdf = org.apache.axis.encoding.ser.SimpleListDeserializerFactory.class;
 172     qName = new javax.xml.namespace.QName("http://model.picr.ebi.ac.uk",
 173             "UPEntry");
 174     cachedSerQNames.add(qName);
 175     cls = uk.ac.ebi.picr.model.UPEntry.class;
 176     cachedSerClasses.add(cls);
 177     cachedSerFactories.add(beansf);
 178     cachedDeserFactories.add(beandf);
 179
 180     qName = new javax.xml.namespace.QName("http://model.picr.ebi.ac.uk",
 181             "CrossReference");
 182     cachedSerQNames.add(qName);
 183     cls = uk.ac.ebi.picr.model.CrossReference.class;
 184     cachedSerClasses.add(cls);
 185     cachedSerFactories.add(beansf);
 186     cachedDeserFactories.add(beandf);
 187
 188   }
 189
 190   protected org.apache.axis.client.Call createCall()
 191           throws java.rmi.RemoteException
 192   {
 193     try
 194     {
 195       org.apache.axis.client.Call _call = (org.apache.axis.client.Call) super.service
 196               .createCall();
 197       if (super.maintainSessionSet)
 198       {
 199         _call.setMaintainSession(super.maintainSession);
 200       }
 201       if (super.cachedUsername != null)
 202       {
 203         _call.setUsername(super.cachedUsername);
 204       }
 205       if (super.cachedPassword != null)
 206       {
 207         _call.setPassword(super.cachedPassword);
 208       }
 209       if (super.cachedEndpoint != null)
 210       {
 211         _call.setTargetEndpointAddress(super.cachedEndpoint);
 212       }
 213       if (super.cachedTimeout != null)
 214       {
 215         _call.setTimeout(super.cachedTimeout);
 216       }
 217       if (super.cachedPortName != null)
 218       {
 219         _call.setPortName(super.cachedPortName);
 220       }
 221       java.util.Enumeration keys = super.cachedProperties.keys();
 222       while (keys.hasMoreElements())
 223       {
 224         java.lang.String key = (java.lang.String) keys.nextElement();
 225         _call.setProperty(key, super.cachedProperties.get(key));
 226       }
 227       // All the type mapping information is registered
 228       // when the first call is made.
 229       // The type mapping information is actually registered in
 230       // the TypeMappingRegistry of the service, which
 231       // is the reason why registration is only needed for the first call.
 232       synchronized (this)
 233       {
 234         if (firstCall())
 235         {
 236           // must set encoding style before registering serializers
 237           _call.setEncodingStyle(null);
 238           for (int i = 0; i < cachedSerFactories.size(); ++i)
 239           {
 240             java.lang.Class cls = (java.lang.Class) cachedSerClasses.get(i);
 241             javax.xml.namespace.QName qName = (javax.xml.namespace.QName) cachedSerQNames
 242                     .get(i);
 243             java.lang.Class sf = (java.lang.Class) cachedSerFactories
 244                     .get(i);
 245             java.lang.Class df = (java.lang.Class) cachedDeserFactories
 246                     .get(i);
 247             _call.registerTypeMapping(cls, qName, sf, df, false);
 248           }
 249         }
 250       }
 251       return _call;
 252     } catch (java.lang.Throwable _t)
 253     {
 254       throw new org.apache.axis.AxisFault(
 255               "Failure trying to get the Call object", _t);
 256     }
 257   }
 258
 259   public uk.ac.ebi.picr.model.UPEntry getUPIForSequence(
 260           java.lang.String sequence, java.lang.String[] searchDatabases,
 261           java.lang.String taxonId, boolean onlyActive)
 262           throws java.rmi.RemoteException
 263   {
 264     if (super.cachedEndpoint == null)
 265     {
 266       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
 267     }
 268     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
 269     _call.setOperation(_operations[0]);
 270     _call.setUseSOAPAction(true);
 271     _call.setSOAPActionURI("getUPIForSequence");
 272     _call.setEncodingStyle(null);
 273     _call.setProperty(org.apache.axis.client.Call.SEND_TYPE_ATTR,
 274             Boolean.FALSE);
 275     _call.setProperty(org.apache.axis.AxisEngine.PROP_DOMULTIREFS,
 276             Boolean.FALSE);
 277     _call.setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
 278     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName(
 279             "http://www.ebi.ac.uk/picr/AccessionMappingService",
 280             "getUPIForSequence"));
 281
 282     setRequestHeaders(_call);
 283     setAttachments(_call);
 284     java.lang.Object _resp = _call
 285             .invoke(new java.lang.Object[]
 286             { sequence, searchDatabases, taxonId,
 287                 new java.lang.Boolean(onlyActive) });
 288
 289     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
 290     {
 291       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
 292     }
 293     else
 294     {
 295       extractAttachments(_call);
 296       try
 297       {
 298         return (uk.ac.ebi.picr.model.UPEntry) _resp;
 299       } catch (java.lang.Exception _exception)
 300       {
 301         return (uk.ac.ebi.picr.model.UPEntry) org.apache.axis.utils.JavaUtils
 302                 .convert(_resp, uk.ac.ebi.picr.model.UPEntry.class);
 303       }
 304     }
 305   }
 306
 307   public uk.ac.ebi.picr.model.UPEntry[] getUPIForAccession(
 308           java.lang.String accession, java.lang.String ac_version,
 309           java.lang.String[] searchDatabases, java.lang.String taxonId,
 310           boolean onlyActive) throws java.rmi.RemoteException
 311   {
 312     if (super.cachedEndpoint == null)
 313     {
 314       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
 315     }
 316     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
 317     _call.setOperation(_operations[1]);
 318     _call.setUseSOAPAction(true);
 319     _call.setSOAPActionURI("getUPIForAccession");
 320     _call.setEncodingStyle(null);
 321     _call.setProperty(org.apache.axis.client.Call.SEND_TYPE_ATTR,
 322             Boolean.FALSE);
 323     _call.setProperty(org.apache.axis.AxisEngine.PROP_DOMULTIREFS,
 324             Boolean.FALSE);
 325     _call.setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
 326     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName(
 327             "http://www.ebi.ac.uk/picr/AccessionMappingService",
 328             "getUPIForAccession"));
 329
 330     setRequestHeaders(_call);
 331     setAttachments(_call);
 332     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[]
 333     { accession, ac_version, searchDatabases, taxonId,
 334         new java.lang.Boolean(onlyActive) });
 335
 336     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
 337     {
 338       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
 339     }
 340     else
 341     {
 342       extractAttachments(_call);
 343       try
 344       {
 345         return (uk.ac.ebi.picr.model.UPEntry[]) _resp;
 346       } catch (java.lang.Exception _exception)
 347       {
 348         return (uk.ac.ebi.picr.model.UPEntry[]) org.apache.axis.utils.JavaUtils
 349                 .convert(_resp, uk.ac.ebi.picr.model.UPEntry[].class);
 350       }
 351     }
 352   }
 353
 354   public java.lang.String[] getMappedDatabaseNames()
 355           throws java.rmi.RemoteException
 356   {
 357     if (super.cachedEndpoint == null)
 358     {
 359       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
 360     }
 361     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
 362     _call.setOperation(_operations[2]);
 363     _call.setUseSOAPAction(true);
 364     _call.setSOAPActionURI("getMappedDatabaseNames");
 365     _call.setEncodingStyle(null);
 366     _call.setProperty(org.apache.axis.client.Call.SEND_TYPE_ATTR,
 367             Boolean.FALSE);
 368     _call.setProperty(org.apache.axis.AxisEngine.PROP_DOMULTIREFS,
 369             Boolean.FALSE);
 370     _call.setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
 371     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName(
 372             "http://www.ebi.ac.uk/picr/AccessionMappingService",
 373             "getMappedDatabaseNames"));
 374
 375     setRequestHeaders(_call);
 376     setAttachments(_call);
 377     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[]
 378     {});
 379
 380     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
 381     {
 382       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
 383     }
 384     else
 385     {
 386       extractAttachments(_call);
 387       try
 388       {
 389         return (java.lang.String[]) _resp;
 390       } catch (java.lang.Exception _exception)
 391       {
 392         return (java.lang.String[]) org.apache.axis.utils.JavaUtils
 393                 .convert(_resp, java.lang.String[].class);
 394       }
 395     }
 396   }
 397
 398 }