src/vamsas/objects/simple/Alignment_Helper.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.7)
   3  * Copyright (C) 2011 J Procter, AM Waterhouse, J Engelhardt, LM Lui, G Barton, M Clamp, S Searle
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
  10  *
  11  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  12  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  13  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  14  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  15  *
  16  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  17  */
  18 package vamsas.objects.simple;
  19
  20 public class Alignment_Helper
  21 {
  22   // Type metadata
  23   private static org.apache.axis.description.TypeDesc typeDesc = new org.apache.axis.description.TypeDesc(
  24           Alignment.class, true);
  25
  26   static
  27   {
  28     typeDesc.setXmlType(new javax.xml.namespace.QName(
  29             "simple.objects.vamsas", "Alignment"));
  30     org.apache.axis.description.ElementDesc elemField = new org.apache.axis.description.ElementDesc();
  31     elemField.setFieldName("gapchar");
  32     elemField.setXmlName(new javax.xml.namespace.QName("", "gapchar"));
  33     elemField.setXmlType(new javax.xml.namespace.QName(
  34             "http://schemas.xmlsoap.org/soap/encoding/", "string"));
  35     typeDesc.addFieldDesc(elemField);
  36     elemField = new org.apache.axis.description.ElementDesc();
  37     elemField.setFieldName("method");
  38     elemField.setXmlName(new javax.xml.namespace.QName("", "method"));
  39     elemField.setXmlType(new javax.xml.namespace.QName(
  40             "http://schemas.xmlsoap.org/soap/encoding/", "string"));
  41     typeDesc.addFieldDesc(elemField);
  42     elemField = new org.apache.axis.description.ElementDesc();
  43     elemField.setFieldName("seqs");
  44     elemField.setXmlName(new javax.xml.namespace.QName("", "seqs"));
  45     elemField.setXmlType(new javax.xml.namespace.QName(
  46             "simple.objects.vamsas", "SequenceSet"));
  47     typeDesc.addFieldDesc(elemField);
  48   }
  49
  50   /**
  51    * Return type metadata object
  52    */
  53   public static org.apache.axis.description.TypeDesc getTypeDesc()
  54   {
  55     return typeDesc;
  56   }
  57
  58   /**
  59    * Get Custom Serializer
  60    */
  61   public static org.apache.axis.encoding.Serializer getSerializer(
  62           java.lang.String mechType, java.lang.Class _javaType,
  63           javax.xml.namespace.QName _xmlType)
  64   {
  65     return new org.apache.axis.encoding.ser.BeanSerializer(_javaType,
  66             _xmlType, typeDesc);
  67   }
  68
  69   /**
  70    * Get Custom Deserializer
  71    */
  72   public static org.apache.axis.encoding.Deserializer getDeserializer(
  73           java.lang.String mechType, java.lang.Class _javaType,
  74           javax.xml.namespace.QName _xmlType)
  75   {
  76     return new org.apache.axis.encoding.ser.BeanDeserializer(_javaType,
  77             _xmlType, typeDesc);
  78   }
  79
  80 }