src/vamsas/objects/simple/MsaResult.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8.0b1)
   3  * Copyright (C) 2014 The Jalview Authors
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   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
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  11  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  12  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  13  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
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  18  */
  19 /*
  20  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer
  21  * Copyright (C) 2007 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle
  22  *
  23  * This program is free software; you can redistribute it and/or
  24  * modify it under the terms of the GNU General Public License
  25  * as published by the Free Software Foundation; either version 2
  26  * of the License, or (at your option) any later version.
  27  *
  28  * This program is distributed in the hope that it will be useful,
  29  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  30  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
  31  * GNU General Public License for more details.
  32  *
  33  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  34  * along with this program; if not, write to the Free Software
  35  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA
  36  */
  37 package vamsas.objects.simple;
  38
  39 public class MsaResult extends vamsas.objects.simple.Result implements
  40         java.io.Serializable
  41 {
  42   private vamsas.objects.simple.Alignment msa;
  43
  44   private java.lang.Object __equalsCalc = null;
  45
  46   private boolean __hashCodeCalc = false;
  47
  48   public MsaResult()
  49   {
  50   }
  51
  52   public MsaResult(vamsas.objects.simple.Alignment msa)
  53   {
  54     this.msa = msa;
  55   }
  56
  57   /**
  58    * Gets the msa value for this MsaResult.
  59    *
  60    * @return msa
  61    */
  62   public vamsas.objects.simple.Alignment getMsa()
  63   {
  64     return msa;
  65   }
  66
  67   /**
  68    * Sets the msa value for this MsaResult.
  69    *
  70    * @param msa
  71    */
  72   public void setMsa(vamsas.objects.simple.Alignment msa)
  73   {
  74     this.msa = msa;
  75   }
  76
  77   public synchronized boolean equals(java.lang.Object obj)
  78   {
  79     if (!(obj instanceof MsaResult))
  80     {
  81       return false;
  82     }
  83
  84     MsaResult other = (MsaResult) obj;
  85
  86     if (obj == null)
  87     {
  88       return false;
  89     }
  90
  91     if (this == obj)
  92     {
  93       return true;
  94     }
  95
  96     if (__equalsCalc != null)
  97     {
  98       return (__equalsCalc == obj);
  99     }
 100
 101     __equalsCalc = obj;
 102
 103     boolean _equals;
 104     _equals = super.equals(obj)
 105             && (((this.msa == null) && (other.getMsa() == null)) || ((this.msa != null) && this.msa
 106                     .equals(other.getMsa())));
 107     __equalsCalc = null;
 108
 109     return _equals;
 110   }
 111
 112   public synchronized int hashCode()
 113   {
 114     if (__hashCodeCalc)
 115     {
 116       return 0;
 117     }
 118
 119     __hashCodeCalc = true;
 120
 121     int _hashCode = super.hashCode();
 122
 123     if (getMsa() != null)
 124     {
 125       _hashCode += getMsa().hashCode();
 126     }
 127
 128     __hashCodeCalc = false;
 129
 130     return _hashCode;
 131   }
 132 }