src/vamsas/objects/simple/MsaResult.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.7)
   3  * Copyright (C) 2011 J Procter, AM Waterhouse, J Engelhardt, LM Lui, G Barton, M Clamp, S Searle
   4  *
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   6  *
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   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
  10  *
  11  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  12  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  13  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  14  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  15  *
  16  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  17  */
  18 /*
  19  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer
  20  * Copyright (C) 2007 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle
  21  *
  22  * This program is free software; you can redistribute it and/or
  23  * modify it under the terms of the GNU General Public License
  24  * as published by the Free Software Foundation; either version 2
  25  * of the License, or (at your option) any later version.
  26  *
  27  * This program is distributed in the hope that it will be useful,
  28  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  29  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
  30  * GNU General Public License for more details.
  31  *
  32  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  33  * along with this program; if not, write to the Free Software
  34  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA
  35  */
  36 package vamsas.objects.simple;
  37
  38 public class MsaResult extends vamsas.objects.simple.Result implements
  39         java.io.Serializable
  40 {
  41   private vamsas.objects.simple.Alignment msa;
  42
  43   private java.lang.Object __equalsCalc = null;
  44
  45   private boolean __hashCodeCalc = false;
  46
  47   public MsaResult()
  48   {
  49   }
  50
  51   public MsaResult(vamsas.objects.simple.Alignment msa)
  52   {
  53     this.msa = msa;
  54   }
  55
  56   /**
  57    * Gets the msa value for this MsaResult.
  58    *
  59    * @return msa
  60    */
  61   public vamsas.objects.simple.Alignment getMsa()
  62   {
  63     return msa;
  64   }
  65
  66   /**
  67    * Sets the msa value for this MsaResult.
  68    *
  69    * @param msa
  70    */
  71   public void setMsa(vamsas.objects.simple.Alignment msa)
  72   {
  73     this.msa = msa;
  74   }
  75
  76   public synchronized boolean equals(java.lang.Object obj)
  77   {
  78     if (!(obj instanceof MsaResult))
  79     {
  80       return false;
  81     }
  82
  83     MsaResult other = (MsaResult) obj;
  84
  85     if (obj == null)
  86     {
  87       return false;
  88     }
  89
  90     if (this == obj)
  91     {
  92       return true;
  93     }
  94
  95     if (__equalsCalc != null)
  96     {
  97       return (__equalsCalc == obj);
  98     }
  99
 100     __equalsCalc = obj;
 101
 102     boolean _equals;
 103     _equals = super.equals(obj)
 104             && (((this.msa == null) && (other.getMsa() == null)) || ((this.msa != null) && this.msa
 105                     .equals(other.getMsa())));
 106     __equalsCalc = null;
 107
 108     return _equals;
 109   }
 110
 111   public synchronized int hashCode()
 112   {
 113     if (__hashCodeCalc)
 114     {
 115       return 0;
 116     }
 117
 118     __hashCodeCalc = true;
 119
 120     int _hashCode = super.hashCode();
 121
 122     if (getMsa() != null)
 123     {
 124       _hashCode += getMsa().hashCode();
 125     }
 126
 127     __hashCodeCalc = false;
 128
 129     return _hashCode;
 130   }
 131 }