src/vamsas/objects/simple/SeqSearchResult.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.7)\r
   3  * Copyright (C) 2011 J Procter, AM Waterhouse, J Engelhardt, LM Lui, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  * \r
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   6  * \r
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  10  * \r
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  15  * \r
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  17  */\r
  18 package vamsas.objects.simple;\r
  19 \r
  20 public class SeqSearchResult extends vamsas.objects.simple.Result implements\r
  21         java.io.Serializable\r
  22 {\r
  23   private vamsas.objects.simple.Alignment alignment;\r
  24 \r
  25   private java.lang.String annotation;\r
  26 \r
  27   private java.lang.String features;\r
  28 \r
  29   private java.lang.String newickTree;\r
  30 \r
  31   public SeqSearchResult()\r
  32   {\r
  33   }\r
  34 \r
  35   public SeqSearchResult(vamsas.objects.simple.Alignment alignment,\r
  36           java.lang.String annotation, java.lang.String features,\r
  37           java.lang.String newickTree)\r
  38   {\r
  39     this.alignment = alignment;\r
  40     this.annotation = annotation;\r
  41     this.features = features;\r
  42     this.newickTree = newickTree;\r
  43   }\r
  44 \r
  45   /**\r
  46    * Gets the alignment value for this SeqSearchResult.\r
  47    * \r
  48    * @return alignment\r
  49    */\r
  50   public vamsas.objects.simple.Alignment getAlignment()\r
  51   {\r
  52     return alignment;\r
  53   }\r
  54 \r
  55   /**\r
  56    * Sets the alignment value for this SeqSearchResult.\r
  57    * \r
  58    * @param alignment\r
  59    */\r
  60   public void setAlignment(vamsas.objects.simple.Alignment alignment)\r
  61   {\r
  62     this.alignment = alignment;\r
  63   }\r
  64 \r
  65   /**\r
  66    * Gets the annotation value for this SeqSearchResult.\r
  67    * \r
  68    * @return annotation\r
  69    */\r
  70   public java.lang.String getAnnotation()\r
  71   {\r
  72     return annotation;\r
  73   }\r
  74 \r
  75   /**\r
  76    * Sets the annotation value for this SeqSearchResult.\r
  77    * \r
  78    * @param annotation\r
  79    */\r
  80   public void setAnnotation(java.lang.String annotation)\r
  81   {\r
  82     this.annotation = annotation;\r
  83   }\r
  84 \r
  85   /**\r
  86    * Gets the features value for this SeqSearchResult.\r
  87    * \r
  88    * @return features\r
  89    */\r
  90   public java.lang.String getFeatures()\r
  91   {\r
  92     return features;\r
  93   }\r
  94 \r
  95   /**\r
  96    * Sets the features value for this SeqSearchResult.\r
  97    * \r
  98    * @param features\r
  99    */\r
 100   public void setFeatures(java.lang.String features)\r
 101   {\r
 102     this.features = features;\r
 103   }\r
 104 \r
 105   /**\r
 106    * Gets the newickTree value for this SeqSearchResult.\r
 107    * \r
 108    * @return newickTree\r
 109    */\r
 110   public java.lang.String getNewickTree()\r
 111   {\r
 112     return newickTree;\r
 113   }\r
 114 \r
 115   /**\r
 116    * Sets the newickTree value for this SeqSearchResult.\r
 117    * \r
 118    * @param newickTree\r
 119    */\r
 120   public void setNewickTree(java.lang.String newickTree)\r
 121   {\r
 122     this.newickTree = newickTree;\r
 123   }\r
 124 \r
 125   private java.lang.Object __equalsCalc = null;\r
 126 \r
 127   public synchronized boolean equals(java.lang.Object obj)\r
 128   {\r
 129     if (!(obj instanceof SeqSearchResult))\r
 130       return false;\r
 131     SeqSearchResult other = (SeqSearchResult) obj;\r
 132     if (obj == null)\r
 133       return false;\r
 134     if (this == obj)\r
 135       return true;\r
 136     if (__equalsCalc != null)\r
 137     {\r
 138       return (__equalsCalc == obj);\r
 139     }\r
 140     __equalsCalc = obj;\r
 141     boolean _equals;\r
 142     _equals = super.equals(obj)\r
 143             && ((this.alignment == null && other.getAlignment() == null) || (this.alignment != null && this.alignment\r
 144                     .equals(other.getAlignment())))\r
 145             && ((this.annotation == null && other.getAnnotation() == null) || (this.annotation != null && this.annotation\r
 146                     .equals(other.getAnnotation())))\r
 147             && ((this.features == null && other.getFeatures() == null) || (this.features != null && this.features\r
 148                     .equals(other.getFeatures())))\r
 149             && ((this.newickTree == null && other.getNewickTree() == null) || (this.newickTree != null && this.newickTree\r
 150                     .equals(other.getNewickTree())));\r
 151     __equalsCalc = null;\r
 152     return _equals;\r
 153   }\r
 154 \r
 155   private boolean __hashCodeCalc = false;\r
 156 \r
 157   public synchronized int hashCode()\r
 158   {\r
 159     if (__hashCodeCalc)\r
 160     {\r
 161       return 0;\r
 162     }\r
 163     __hashCodeCalc = true;\r
 164     int _hashCode = super.hashCode();\r
 165     if (getAlignment() != null)\r
 166     {\r
 167       _hashCode += getAlignment().hashCode();\r
 168     }\r
 169     if (getAnnotation() != null)\r
 170     {\r
 171       _hashCode += getAnnotation().hashCode();\r
 172     }\r
 173     if (getFeatures() != null)\r
 174     {\r
 175       _hashCode += getFeatures().hashCode();\r
 176     }\r
 177     if (getNewickTree() != null)\r
 178     {\r
 179       _hashCode += getNewickTree().hashCode();\r
 180     }\r
 181     __hashCodeCalc = false;\r
 182     return _hashCode;\r
 183   }\r
 184 \r
 185 }\r