srcjar/fr/orsay/lri/varna/components/BaseTableModel.java

   1 /*
   2  VARNA is a tool for the automated drawing, visualization and annotation of the secondary structure of RNA, designed as a companion software for web servers and databases.
   3  Copyright (C) 2008  Kevin Darty, Alain Denise and Yann Ponty.
   4  electronic mail : Yann.Ponty@lri.fr
   5  paper mail : LRI, bat 490 Université Paris-Sud 91405 Orsay Cedex France
   6
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  10
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  12  without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.
  13  See the GNU General Public License for more details.
  14
  15  You should have received a copy of the GNU General Public License along with VARNA version 3.1.
  16  If not, see http://www.gnu.org/licenses.
  17  */
  18 package fr.orsay.lri.varna.components;
  19
  20 import java.awt.Color;
  21 import java.util.ArrayList;
  22
  23 import javax.swing.table.AbstractTableModel;
  24
  25 import fr.orsay.lri.varna.models.BaseList;
  26 import fr.orsay.lri.varna.models.VARNAConfig;
  27 import fr.orsay.lri.varna.models.rna.ModeleBase;
  28 import fr.orsay.lri.varna.models.rna.ModelBaseStyle;
  29
  30
  31 public class BaseTableModel extends AbstractTableModel {
  32         /**
  33          *
  34          */
  35         private static final long serialVersionUID = 1L;
  36
  37         private String[] columnNames = { "Numbers", "Base", "Outline Color", "Inner Color",
  38                         "Name Color", "Number Color" };
  39         private ArrayList<ArrayList<Object>> data = new ArrayList<ArrayList<Object>>();
  40         private ArrayList<BaseList> _bases;
  41         private boolean _singleBases = true;
  42
  43         public BaseTableModel(ArrayList<BaseList> bases) {
  44                 _bases = bases;
  45                 ArrayList<Object> ligne;
  46                 for (int i = 0; i < bases.size(); i++) {
  47                         ligne = new ArrayList<Object>();
  48                         BaseList bl  = bases.get(i);
  49                         if (bl.size()!=1)
  50                         {
  51                                 _singleBases = false;
  52                         }
  53                         ligne.add(bl.getNumbers());
  54                         ligne.add(bl.getContents());
  55                         ligne.add(bl.getAverageOutlineColor());
  56                         ligne.add(bl.getAverageInnerColor());
  57                         ligne.add(bl.getAverageNameColor());
  58                         ligne.add(bl.getAverageNumberColor());
  59                         this.data.add(ligne);
  60                 }
  61
  62         }
  63
  64         public int getColumnCount() {
  65                 return columnNames.length;
  66         }
  67
  68         public int getRowCount() {
  69                 return data.size();
  70         }
  71
  72         public String getColumnName(int col) {
  73                 return columnNames[col];
  74         }
  75
  76         public Object getValueAt(int row, int col) {
  77                 return data.get(row).get(col);
  78         }
  79
  80         /*
  81          * JTable uses this method to determine the default renderer/ editor for
  82          * each cell. If we didn't implement this method, then the last column would
  83          * contain text ("true"/"false"), rather than a check box.
  84          */
  85         @SuppressWarnings("unchecked")
  86         public Class getColumnClass(int c) {
  87                 return getValueAt(0, c).getClass();
  88         }
  89
  90         public boolean isCellEditable(int row, int col) {
  91                 // Note that the data/cell address is constant,
  92                 // no matter where the cell appears onscreen.
  93                 if (col < 1) {
  94                         return false;
  95                 } else {
  96                         return true;
  97                 }
  98         }
  99
 100         public void setValueAt(Object value, int row, int col) {
 101                 data.get(row).set(col, value);
 102                 if (col == 1 && _singleBases)
 103                 {
 104                         ModeleBase mb = _bases.get(row).getBases().get(0);
 105                         mb.setContent(value.toString());
 106                 }
 107                 fireTableCellUpdated(row, col);
 108
 109         }
 110 }