srcjar/fr/orsay/lri/varna/exceptions/ExceptionUnmatchedClosingParentheses.java

   1 /*
   2  VARNA is a tool for the automated drawing, visualization and annotation of the secondary structure of RNA, designed as a companion software for web servers and databases.
   3  Copyright (C) 2008  Kevin Darty, Alain Denise and Yann Ponty.
   4  electronic mail : Yann.Ponty@lri.fr
   5  paper mail : LRI, bat 490 Université Paris-Sud 91405 Orsay Cedex France
   6
   7  This file is part of VARNA version 3.1.
   8  VARNA version 3.1 is free software: you can redistribute it and/or modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
  10
  11  VARNA version 3.1 is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY WARRANTY;
  12  without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.
  13  See the GNU General Public License for more details.
  14
  15  You should have received a copy of the GNU General Public License along with VARNA version 3.1.
  16  If not, see http://www.gnu.org/licenses.
  17  */
  18 package fr.orsay.lri.varna.exceptions;
  19
  20 import java.text.ParseException;
  21
  22 /**
  23  * Exception used when a rna has not the same number of opening and clothing
  24  * parentheses
  25  *
  26  * @author darty
  27  *
  28  */
  29 public class ExceptionUnmatchedClosingParentheses extends ParseException {
  30         /**
  31          *
  32          */
  33         private static final long serialVersionUID = 1L;
  34
  35         public ExceptionUnmatchedClosingParentheses(String s, int errorOffset) {
  36                 super(s, errorOffset);
  37         }
  38
  39         public ExceptionUnmatchedClosingParentheses(int errorOffset) {
  40                 super("", errorOffset);
  41         }
  42
  43         public String getMessage() {
  44                 return "Unbalanced parentheses expression, cannot resolve secondary structure.\n"
  45                                 + "Bad secondary structure (DBN format):Unmatched closing parentheses ')' at "
  46                                 + getErrorOffset();
  47         }
  48 }