test/jalview/bin/ArgParserTest.java

   1 package jalview.bin;
   2
   3 import java.io.File;
   4 import java.io.IOException;
   5 import java.util.List;
   6 import java.util.Properties;
   7
   8 import org.testng.Assert;
   9 import org.testng.annotations.DataProvider;
  10 import org.testng.annotations.Test;
  11
  12 import jalview.bin.ArgParser.Arg;
  13 import jalview.bin.ArgParser.BootstrapArgs;
  14
  15 public class ArgParserTest
  16 {
  17
  18   @Test(groups = "Functional", dataProvider = "argLines")
  19   public void parseArgsAndSubValsTest(String commandLineArgs, Arg a,
  20           String other)
  21   {
  22     String[] args = commandLineArgs.split("\\s*");
  23     ArgParser argparser = new ArgParser(args);
  24   }
  25
  26   @Test(groups = "Functional", dataProvider = "argLines")
  27   public void bootstrapArgsTest(String commandLineArgs, Arg a, String other)
  28   {
  29     String[] args = commandLineArgs.split("\\s+");
  30     BootstrapArgs b = BootstrapArgs.getBootstrapArgs(args);
  31
  32     Assert.assertTrue(b.contains(a));
  33     if (a == Arg.PROPS)
  34     {
  35       Properties bP = Cache.bootstrapProperties(b.get(Arg.PROPS));
  36       Assert.assertTrue(other.equals(bP.get(Cache.BOOTSTRAP_TEST)));
  37       Assert.assertFalse(bP.contains("NOT" + Cache.BOOTSTRAP_TEST));
  38     }
  39     else if (a == Arg.ARGFILE)
  40     {
  41       List<String> filenames = b.getList(a);
  42       boolean found = false;
  43       for (String s : filenames)
  44       {
  45         File f = new File(s);
  46         File fo = new File(other);
  47         try
  48         {
  49           if (fo.getCanonicalPath().equals(f.getCanonicalPath()))
  50           {
  51             found = true;
  52             break;
  53           }
  54         } catch (IOException e)
  55         {
  56         }
  57       }
  58       Assert.assertTrue(found,
  59               "File '" + other + "' not found in shell expanded glob '"
  60                       + commandLineArgs + "'");
  61     }
  62
  63   }
  64
  65   @Test(groups = "Functional", dataProvider = "argFiles")
  66   public void argFilesTest(String commandLineArgs, Arg a, String other)
  67   {
  68     String[] args = commandLineArgs.split("\\s+");
  69     BootstrapArgs b = BootstrapArgs.getBootstrapArgs(args);
  70
  71     Assert.assertTrue(b.contains(a));
  72     Assert.assertFalse(b.contains(Arg.OPEN));
  73     if (a == Arg.PROPS)
  74     {
  75       Properties bP = Cache.bootstrapProperties(b.get(Arg.PROPS));
  76       Assert.assertTrue("true".equals(bP.get(Cache.BOOTSTRAP_TEST)));
  77     }
  78   }
  79
  80   @DataProvider(name = "argLinesTest")
  81   public Object[][] argLinesTest()
  82   {
  83     return new Object[][] {
  84         // can't use this one yet as it doesn't get shell expanded
  85         { "--argfile test/jalview/bin/argparser/argfile*.txt", Arg.ARGFILE,
  86             "test/jalview/bin/argparser/argfile0.txt" }, };
  87   }
  88
  89   @DataProvider(name = "argLines")
  90   public Object[][] argLines()
  91   {
  92     return new Object[][] {
  93         { "--debug --open=test/jalview/bin/argparser/test1.fa", Arg.DEBUG,
  94             null },
  95         { "--open=test/jalview/bin/argparser/test1.fa --headless",
  96             Arg.HEADLESS, null },
  97         { "--open=test/jalview/bin/argparser/test1.fa --props=test/jalview/bin/argparser/testProps.jvprops",
  98             Arg.PROPS, "true" },
  99         { "--argfile=test/jalview/bin/argparser/argfile*.txt", Arg.ARGFILE,
 100             "test/jalview/bin/argparser/argfile0.txt" },
 101         { "--argfile=test/jalview/bin/argparser/argfile*.txt", Arg.ARGFILE,
 102             "test/jalview/bin/argparser/argfile1.txt" },
 103         { "--argfile=test/jalview/bin/argparser/argfile*.txt", Arg.ARGFILE,
 104             "test/jalview/bin/argparser/argfile2.txt" } };
 105   }
 106
 107   @DataProvider(name = "argFiles")
 108   public Object[][] argFiles()
 109   {
 110     return new Object[][] { {
 111         "--argfile=test/jalview/bin/argparser/argfile0.txt --open=shouldntbeabootstrap",
 112         Arg.ARGFILE, "test/jalview/bin/argfiles/test1.fa" } };
 113   }
 114 }