test/jalview/datamodel/ColumnSelectionTest.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.9)
   3  * Copyright (C) 2015 The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
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  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package jalview.datamodel;
  22
  23 import static org.testng.AssertJUnit.assertEquals;
  24
  25 import java.util.List;
  26
  27 import org.testng.annotations.Test;
  28
  29 public class ColumnSelectionTest
  30 {
  31
  32   @Test(groups = { "Functional" })
  33   public void testAddElement()
  34   {
  35     ColumnSelection cs = new ColumnSelection();
  36     cs.addElement(2);
  37     cs.addElement(5);
  38     List<Integer> sel = cs.getSelected();
  39     assertEquals(2, sel.size());
  40     assertEquals(new Integer(2), sel.get(0));
  41     assertEquals(new Integer(5), sel.get(1));
  42   }
  43
  44   /**
  45    * Test the remove method - in particular to verify that remove(int i) removes
  46    * the element whose value is i, _NOT_ the i'th element.
  47    */
  48   @Test(groups = { "Functional" })
  49   public void testRemoveElement()
  50   {
  51     ColumnSelection cs = new ColumnSelection();
  52     cs.addElement(2);
  53     cs.addElement(5);
  54
  55     // removing elements not in the list has no effect
  56     cs.removeElement(0);
  57     cs.removeElement(1);
  58     List<Integer> sel = cs.getSelected();
  59     assertEquals(2, sel.size());
  60     assertEquals(new Integer(2), sel.get(0));
  61     assertEquals(new Integer(5), sel.get(1));
  62
  63     // removing an element in the list removes it
  64     cs.removeElement(2);
  65     assertEquals(1, sel.size());
  66     assertEquals(new Integer(5), sel.get(0));
  67   }
  68
  69   /**
  70    * Test the method that finds the visible column position of an alignment
  71    * column, allowing for hidden columns.
  72    */
  73   @Test(groups = { "Functional" })
  74   public void testFindColumnPosition()
  75   {
  76     ColumnSelection cs = new ColumnSelection();
  77     assertEquals(5, cs.findColumnPosition(5));
  78
  79     // hiding column 6 makes no difference
  80     cs.hideColumns(6, 6);
  81     assertEquals(5, cs.findColumnPosition(5));
  82
  83     // hiding column 5 makes no difference
  84     cs.hideColumns(5, 5);
  85     assertEquals(5, cs.findColumnPosition(5));
  86
  87     // hiding column 4 moves column 5 to column 4
  88     cs.hideColumns(4, 4);
  89     assertEquals(4, cs.findColumnPosition(5));
  90
  91     // hiding columns 1 and 2 moves column 5 to column 2
  92     cs.hideColumns(1, 2);
  93     assertEquals(2, cs.findColumnPosition(5));
  94   }
  95 }