test/jalview/datamodel/ContactRangeTest.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
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   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
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  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
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  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package jalview.datamodel;
  22
  23 import org.testng.Assert;
  24 import org.testng.annotations.Test;
  25
  26 public class ContactRangeTest
  27 {
  28
  29   @Test
  30   public void testContactRangeBean()
  31   {
  32     ContactRange cr = new ContactRange();
  33     cr.update(5, 15, 6, 0.2, 12, 1.5, 3.7);
  34     Assert.assertEquals(5, cr.getFrom_column());
  35     Assert.assertEquals(15, cr.getTo_column());
  36     Assert.assertEquals(6, cr.getMinPos());
  37     Assert.assertEquals(0.2, cr.getMin());
  38     Assert.assertEquals(12, cr.getMaxPos());
  39     Assert.assertEquals(1.5, cr.getMax());
  40     Assert.assertEquals(3.7, cr.getMean());
  41     cr.setFrom_column(6);
  42     Assert.assertEquals(6, cr.getFrom_column());
  43     cr.setTo_column(16);
  44     Assert.assertEquals(16, cr.getTo_column());
  45     cr.setMinPos(7);
  46     Assert.assertEquals(7, cr.getMinPos());
  47     cr.setMin(0.4);
  48     Assert.assertEquals(0.4, cr.getMin());
  49     cr.setMaxPos(13);
  50     Assert.assertEquals(13, cr.getMaxPos());
  51     cr.setMax(2.5);
  52     Assert.assertEquals(2.5, cr.getMax());
  53     cr.setMean(3.7);
  54     Assert.assertEquals(3.7, cr.getMean());
  55   }
  56 }