test/jalview/datamodel/HiddenColumnsCursorTest.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
  12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package jalview.datamodel;
  22
  23 import static org.testng.Assert.assertNull;
  24 import static org.testng.AssertJUnit.assertEquals;
  25
  26 import java.util.ArrayList;
  27 import java.util.List;
  28
  29 import org.testng.annotations.Test;
  30
  31 public class HiddenColumnsCursorTest
  32 {
  33
  34   @Test(groups = { "Functional" })
  35   public void testConstructor()
  36   {
  37     HiddenColumnsCursor cursor = new HiddenColumnsCursor();
  38     assertNull(cursor.findRegionForColumn(0, false));
  39
  40     List<int[]> hlist = new ArrayList<>();
  41     cursor = new HiddenColumnsCursor(hlist);
  42     assertNull(cursor.findRegionForColumn(0, false));
  43
  44     cursor = new HiddenColumnsCursor(hlist, 3, 12);
  45     assertNull(cursor.findRegionForColumn(0, false));
  46
  47     hlist.add(new int[] { 3, 7 });
  48     hlist.add(new int[] { 15, 25 });
  49     cursor = new HiddenColumnsCursor(hlist);
  50     HiddenCursorPosition p = cursor.findRegionForColumn(8, false);
  51     assertEquals(1, p.getRegionIndex());
  52
  53     cursor = new HiddenColumnsCursor(hlist, 1, 5);
  54     p = cursor.findRegionForColumn(8, false);
  55     assertEquals(1, p.getRegionIndex());
  56   }
  57
  58   /**
  59    * Test the method which finds the corresponding region given a column
  60    */
  61   @Test(groups = { "Functional" })
  62   public void testFindRegionForColumn()
  63   {
  64     HiddenColumnsCursor cursor = new HiddenColumnsCursor();
  65
  66     HiddenCursorPosition pos = cursor.findRegionForColumn(20, false);
  67     assertNull(pos);
  68
  69     List<int[]> hidden = new ArrayList<>();
  70     hidden.add(new int[] { 53, 76 });
  71     hidden.add(new int[] { 104, 125 });
  72
  73     cursor = new HiddenColumnsCursor(hidden);
  74
  75     int regionIndex = cursor.findRegionForColumn(126, false).getRegionIndex();
  76     assertEquals(2, regionIndex);
  77
  78     regionIndex = cursor.findRegionForColumn(125, false).getRegionIndex();
  79     assertEquals(1, regionIndex);
  80
  81     regionIndex = cursor.findRegionForColumn(108, false).getRegionIndex();
  82     assertEquals(1, regionIndex);
  83
  84     regionIndex = cursor.findRegionForColumn(104, false).getRegionIndex();
  85     assertEquals(1, regionIndex);
  86
  87     regionIndex = cursor.findRegionForColumn(103, false).getRegionIndex();
  88     assertEquals(1, regionIndex);
  89
  90     regionIndex = cursor.findRegionForColumn(77, false).getRegionIndex();
  91     assertEquals(1, regionIndex);
  92
  93     regionIndex = cursor.findRegionForColumn(76, false).getRegionIndex();
  94     assertEquals(0, regionIndex);
  95
  96     regionIndex = cursor.findRegionForColumn(53, false).getRegionIndex();
  97     assertEquals(0, regionIndex);
  98
  99     regionIndex = cursor.findRegionForColumn(52, false).getRegionIndex();
 100     assertEquals(0, regionIndex);
 101
 102     regionIndex = cursor.findRegionForColumn(0, false).getRegionIndex();
 103     assertEquals(0, regionIndex);
 104
 105     hidden.add(new int[] { 138, 155 });
 106
 107     cursor = new HiddenColumnsCursor(hidden);
 108
 109     regionIndex = cursor.findRegionForColumn(160, false).getRegionIndex();
 110     assertEquals(3, regionIndex);
 111
 112     regionIndex = cursor.findRegionForColumn(100, false).getRegionIndex();
 113     assertEquals(1, regionIndex);
 114   }
 115
 116   /**
 117    * Test the method which counts the number of hidden columns before a column
 118    */
 119   @Test(groups = { "Functional" })
 120   public void testFindRegionForColumn_Visible()
 121   {
 122     HiddenColumnsCursor cursor = new HiddenColumnsCursor();
 123
 124     HiddenCursorPosition pos = cursor.findRegionForColumn(20, true);
 125     assertNull(pos);
 126
 127     List<int[]> hidden = new ArrayList<>();
 128     hidden.add(new int[] { 53, 76 });
 129     hidden.add(new int[] { 104, 125 });
 130
 131     cursor = new HiddenColumnsCursor(hidden);
 132
 133     int offset = cursor.findRegionForColumn(80, true).getHiddenSoFar();
 134     assertEquals(46, offset);
 135
 136     offset = cursor.findRegionForColumn(79, true).getHiddenSoFar();
 137     assertEquals(24, offset);
 138
 139     offset = cursor.findRegionForColumn(53, true).getHiddenSoFar();
 140     assertEquals(24, offset);
 141
 142     offset = cursor.findRegionForColumn(52, true).getHiddenSoFar();
 143     assertEquals(0, offset);
 144
 145     offset = cursor.findRegionForColumn(10, true).getHiddenSoFar();
 146     assertEquals(0, offset);
 147
 148     offset = cursor.findRegionForColumn(0, true).getHiddenSoFar();
 149     assertEquals(0, offset);
 150
 151     offset = cursor.findRegionForColumn(79, true).getHiddenSoFar();
 152     assertEquals(24, offset);
 153
 154     offset = cursor.findRegionForColumn(80, true).getHiddenSoFar();
 155     assertEquals(46, offset);
 156   }
 157 }