test/jalview/ext/ensembl/EnsemblSpeciesDemo.java

   1 package jalview.ext.ensembl;
   2
   3 import jalview.ext.ensembl.EnsemblSpecies.EnsemblTaxon;
   4
   5 import java.awt.Dimension;
   6 import java.awt.FlowLayout;
   7 import java.util.Arrays;
   8 import java.util.List;
   9
  10 import javax.swing.DefaultComboBoxModel;
  11 import javax.swing.JComboBox;
  12 import javax.swing.JComponent;
  13 import javax.swing.JFrame;
  14 import javax.swing.JLabel;
  15 import javax.swing.JPanel;
  16 import javax.swing.event.DocumentEvent;
  17 import javax.swing.event.DocumentListener;
  18 import javax.swing.text.AbstractDocument;
  19 import javax.swing.text.JTextComponent;
  20
  21 public class EnsemblSpeciesDemo
  22 {
  23   /**
  24    * Main method may be run interactively to explore a dynamic drop-down list that
  25    * populates with matches of Ensembl taxon ids, names or aliases
  26    *
  27    * @param args
  28    */
  29   public static void main(String[] args)
  30   {
  31     // Schedule a job for the event dispatch thread:
  32     // creating and showing this application's GUI.
  33     javax.swing.SwingUtilities.invokeLater(new Runnable()
  34     {
  35       @Override
  36       public void run()
  37       {
  38         createAndShowGUI();
  39       }
  40     });
  41   }
  42
  43   /**
  44    * Create the GUI and show it. For thread safety, this method should be invoked
  45    * from the event dispatch thread.
  46    */
  47   private static void createAndShowGUI()
  48   {
  49     JFrame frame = new JFrame("Taxon drop-down demo");
  50     frame.setDefaultCloseOperation(JFrame.DISPOSE_ON_CLOSE);
  51
  52     JComponent newContentPane = new JPanel(new FlowLayout());
  53     newContentPane.setOpaque(true);
  54     newContentPane.setPreferredSize(new Dimension(400, 300));
  55     frame.setContentPane(newContentPane);
  56
  57     JLabel label = new JLabel("Taxon:");
  58     newContentPane.add(label);
  59
  60     JComboBox<String> combo = new JComboBox<>();
  61     combo.setEditable(true);
  62     combo.setPreferredSize(new Dimension(200, 20));
  63     newContentPane.add(combo);
  64     AbstractDocument document = (AbstractDocument) ((JTextComponent) combo
  65             .getEditor().getEditorComponent()).getDocument();
  66     document.addDocumentListener(new DocumentListener()
  67     {
  68       @Override
  69       public void insertUpdate(DocumentEvent e)
  70       {
  71         refreshComboList(combo, document);
  72       }
  73
  74       @Override
  75       public void removeUpdate(DocumentEvent e)
  76       {
  77         refreshComboList(combo, document);
  78       }
  79
  80       @Override
  81       public void changedUpdate(DocumentEvent e)
  82       {
  83       }
  84     });
  85
  86     frame.pack();
  87     frame.setVisible(true);
  88   }
  89
  90   /**
  91    * Refreshes the combo box list to contain what the user has typed, plus any
  92    * matches for Ensembl taxon id, name or alias
  93    *
  94    * @param combo
  95    * @param document
  96    */
  97   protected static void refreshComboList(JComboBox<String> combo, AbstractDocument document)
  98   {
  99     String typed = (String) combo.getEditor().getItem();
 100     if (typed.length() > 1)
 101     {
 102       List<EnsemblTaxon> matches = EnsemblSpecies.getSpecies(true)
 103               .getNameMatches(typed);
 104       String[] items = new String[matches.size()];
 105       int i = 0;
 106       for (EnsemblTaxon m : matches)
 107       {
 108         items[i++] = String.format("%s (%s)", m.displayName, m.ncbiId);
 109       }
 110       Arrays.sort(items, String.CASE_INSENSITIVE_ORDER);
 111       combo.setModel(new DefaultComboBoxModel<>(items));
 112     }
 113   }
 114 }