test/jalview/ext/rbvi/chimera/ChimeraConnect.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
  12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package jalview.ext.rbvi.chimera;
  22
  23 import static org.testng.AssertJUnit.assertFalse;
  24 import static org.testng.AssertJUnit.assertTrue;
  25
  26 import org.testng.annotations.Test;
  27
  28 import ext.edu.ucsf.rbvi.strucviz2.ChimeraManager;
  29 import ext.edu.ucsf.rbvi.strucviz2.StructureManager;
  30
  31 public class ChimeraConnect
  32 {
  33
  34   @Test(groups = { "Functional" })
  35   public void testLaunchAndExit()
  36   {
  37     final StructureManager structureManager = new StructureManager(true);
  38     ChimeraManager cm = new ChimeraManager(structureManager);
  39     assertTrue("Couldn't launch chimera",
  40             cm.launchChimera(StructureManager.getChimeraPaths()));
  41     assertTrue(cm.isChimeraLaunched()); // Chimera process is alive
  42     // int n=0;
  43     // not sure of the point of this is unless the tester is loading models
  44     // manually?
  45     // while (n++ < 100)
  46     // {
  47     // try {
  48     // Thread.sleep(1000);
  49     // } catch (Exception q)
  50     // {
  51     //
  52     // }
  53     // Collection<ChimeraModel> cms = cm.getChimeraModels();
  54     // for (ChimeraModel cmod :cms) {
  55     // System.out.println(cmod.getModelName());
  56     // }
  57     // }
  58     cm.exitChimera();
  59     assertFalse(cm.isChimeraLaunched()); // Chimera process has ended
  60   }
  61
  62 }