test/jalview/ext/rbvi/chimera/ChimeraConnect.java

   1 package jalview.ext.rbvi.chimera;
   2
   3 import static org.junit.Assert.assertTrue;
   4
   5 import java.util.Collection;
   6
   7 import org.junit.Test;
   8
   9 import ext.edu.ucsf.rbvi.strucviz2.ChimeraManager;
  10 import ext.edu.ucsf.rbvi.strucviz2.ChimeraModel;
  11 import ext.edu.ucsf.rbvi.strucviz2.StructureManager;
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  13 public class ChimeraConnect
  14 {
  15
  16   @Test
  17   public void test()
  18   {
  19     StructureManager csm;
  20             ext.edu.ucsf.rbvi.strucviz2.ChimeraManager cm = new ChimeraManager(csm = new ext.edu.ucsf.rbvi.strucviz2.StructureManager(true));
  21     assertTrue("Couldn't launch chimera",
  22             cm.launchChimera(StructureManager.getChimeraPaths()));
  23     int n=0;
  24     while (n++<100)
  25     {
  26       try {
  27         Thread.sleep(1000);
  28       } catch (Exception q)
  29       {
  30
  31       }
  32       Collection<ChimeraModel> cms = cm.getChimeraModels();
  33       for (ChimeraModel cmod :cms) {
  34         System.out.println(cmod.getModelName());
  35       }
  36     }
  37     cm.exitChimera();
  38   }
  39
  40 }