test/jalview/ext/rbvi/chimera/ChimeraConnect.java

   1 package jalview.ext.rbvi.chimera;
   2
   3 import static org.junit.Assert.*;
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   5 import java.util.Arrays;
   6 import java.util.Collection;
   7
   8 import org.junit.Test;
   9
  10 import ext.edu.ucsf.rbvi.strucviz2.*;
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  12 public class ChimeraConnect
  13 {
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  15   @Test
  16   public void test()
  17   {
  18     StructureManager csm;
  19             ext.edu.ucsf.rbvi.strucviz2.ChimeraManager cm = new ChimeraManager(csm = new ext.edu.ucsf.rbvi.strucviz2.StructureManager(true));
  20     assertTrue("Couldn't launch chimera",cm.launchChimera(csm.getChimeraPaths()));
  21     int n=0;
  22     while (n++<100)
  23     {
  24       try {
  25         Thread.sleep(1000);
  26       } catch (Exception q)
  27       {
  28
  29       }
  30       Collection<ChimeraModel> cms = cm.getChimeraModels();
  31       for (ChimeraModel cmod :cms) {
  32         System.out.println(cmod.getModelName());
  33       }
  34     }
  35     cm.exitChimera();
  36   }
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  38 }