test/jalview/gui/SequenceRendererTest.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
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   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
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  11  *
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  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package jalview.gui;
  22
  23 import static org.testng.AssertJUnit.assertEquals;
  24
  25 import jalview.datamodel.Alignment;
  26 import jalview.datamodel.AlignmentI;
  27 import jalview.datamodel.Sequence;
  28 import jalview.datamodel.SequenceI;
  29 import jalview.schemes.ZappoColourScheme;
  30
  31 import java.awt.Color;
  32
  33 import org.testng.annotations.Test;
  34
  35 public class SequenceRendererTest
  36 {
  37
  38   @Test(groups = { "Functional" })
  39   public void testGetResidueBoxColour_zappo()
  40   {
  41     SequenceI seq = new Sequence("name", "MATVLGSPRAPAFF"); // FER1_MAIZE...
  42     AlignmentI al = new Alignment(new SequenceI[] { seq });
  43     final AlignViewport av = new AlignViewport(al);
  44     SequenceRenderer sr = new SequenceRenderer(av);
  45     av.setGlobalColourScheme(new ZappoColourScheme());
  46
  47     // @see ResidueProperties.zappo
  48     assertEquals(Color.pink, sr.getResidueColour(seq, 0, null)); // M
  49     assertEquals(Color.green, sr.getResidueColour(seq, 2, null)); // T
  50     assertEquals(Color.magenta, sr.getResidueColour(seq, 5, null)); // G
  51     assertEquals(Color.orange, sr.getResidueColour(seq, 12, null)); // F
  52   }
  53   // TODO more tests for getResidueBoxColour covering groups, feature rendering,
  54   // gaps, overview...
  55
  56 }