test/jalview/schemes/ScoreMatrixPrinter.java

   1 /*
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  18  */
  19 package jalview.schemes;
  20
  21 import java.util.Map;
  22
  23 import org.junit.Test;
  24
  25
  26 public class ScoreMatrixPrinter
  27 {
  28   @Test
  29   public void printAllMatrices()
  30   {
  31     for (Map.Entry<String,ScoreMatrix> sm:((Map<String, ScoreMatrix>) ResidueProperties.scoreMatrices).entrySet())
  32     {
  33       System.out.println("Matrix "+sm.getKey());
  34       System.out.println(sm.getValue().toString());
  35     }
  36   }
  37   @Test
  38   public void printHTMLMatrices()
  39   {
  40     for (Map.Entry<String,ScoreMatrix> sm:((Map<String, ScoreMatrix>) ResidueProperties.scoreMatrices).entrySet())
  41     {
  42       System.out.println("Matrix "+sm.getKey());
  43       System.out.println(sm.getValue().outputMatrix(true));
  44     }
  45   }
  46
  47 }