test/jalview/util/matcher/KeyedMatcherSetTest.java

   1 package jalview.util.matcher;
   2
   3 import static org.testng.Assert.assertEquals;
   4 import static org.testng.Assert.assertFalse;
   5 import static org.testng.Assert.assertTrue;
   6
   7 import java.util.function.Function;
   8
   9 import org.testng.annotations.Test;
  10
  11 public class KeyedMatcherSetTest
  12 {
  13   @Test
  14   public void testMatches()
  15   {
  16     /*
  17      * a numeric matcher - MatcherTest covers more conditions
  18      */
  19     KeyedMatcherI km = new KeyedMatcher("AF", Condition.GE, -2F);
  20     KeyedMatcherSetI kms = new KeyedMatcherSet();
  21     kms.and(km);
  22     assertTrue(kms.matches(key -> "-2"));
  23     assertTrue(kms.matches(key -> "-1"));
  24     assertFalse(kms.matches(key -> "-3"));
  25     assertFalse(kms.matches(key -> ""));
  26     assertFalse(kms.matches(key -> "junk"));
  27     assertFalse(kms.matches(key -> null));
  28
  29     /*
  30      * a string pattern matcher
  31      */
  32     km = new KeyedMatcher("AF", Condition.Contains, "Cat");
  33     kms = new KeyedMatcherSet();
  34     kms.and(km);
  35     assertTrue(kms
  36             .matches(key -> "AF".equals(key) ? "raining cats and dogs"
  37             : "showers"));
  38   }
  39
  40   @Test
  41   public void testAnd()
  42   {
  43     // condition1: AF value contains "dog" (matches)
  44     KeyedMatcherI km1 = new KeyedMatcher("AF", Condition.Contains, "dog");
  45     // condition 2: CSQ value does not contain "how" (does not match)
  46     KeyedMatcherI km2 = new KeyedMatcher("CSQ", Condition.NotContains,
  47             "how");
  48
  49     Function<String, String> vp = key -> "AF".equals(key) ? "raining cats and dogs"
  50             : "showers";
  51     assertTrue(km1.matches(vp));
  52     assertFalse(km2.matches(vp));
  53
  54     KeyedMatcherSetI kms = new KeyedMatcherSet();
  55     assertTrue(kms.matches(vp)); // if no conditions, then 'all' pass
  56     kms.and(km1);
  57     assertTrue(kms.matches(vp));
  58     kms.and(km2);
  59     assertFalse(kms.matches(vp));
  60   }
  61
  62   @Test
  63   public void testToString()
  64   {
  65     KeyedMatcherI km1 = new KeyedMatcher("AF", Condition.LT, 1.2f);
  66     assertEquals(km1.toString(), "AF < 1.2");
  67
  68     KeyedMatcher km2 = new KeyedMatcher("CLIN_SIG", Condition.NotContains, "path");
  69     assertEquals(km2.toString(), "CLIN_SIG Does not contain PATH");
  70
  71     /*
  72      * AND them
  73      */
  74     KeyedMatcherSetI kms = new KeyedMatcherSet();
  75     assertEquals(kms.toString(), "");
  76     kms.and(km1);
  77     assertEquals(kms.toString(), "(AF < 1.2)");
  78     kms.and(km2);
  79     assertEquals(kms.toString(),
  80             "(AF < 1.2) AND (CLIN_SIG Does not contain PATH)");
  81
  82     /*
  83      * OR them
  84      */
  85     kms = new KeyedMatcherSet();
  86     assertEquals(kms.toString(), "");
  87     kms.or(km1);
  88     assertEquals(kms.toString(), "(AF < 1.2)");
  89     kms.or(km2);
  90     assertEquals(kms.toString(),
  91             "(AF < 1.2) OR (CLIN_SIG Does not contain PATH)");
  92   }
  93
  94   @Test
  95   public void testOr()
  96   {
  97     // condition1: AF value contains "dog" (matches)
  98     KeyedMatcherI km1 = new KeyedMatcher("AF", Condition.Contains, "dog");
  99     // condition 2: CSQ value does not contain "how" (does not match)
 100     KeyedMatcherI km2 = new KeyedMatcher("CSQ", Condition.NotContains,
 101             "how");
 102
 103     Function<String, String> vp = key -> "AF".equals(key) ? "raining cats and dogs"
 104             : "showers";
 105     assertTrue(km1.matches(vp));
 106     assertFalse(km2.matches(vp));
 107
 108     KeyedMatcherSetI kms = new KeyedMatcherSet();
 109     kms.or(km2);
 110     assertFalse(kms.matches(vp));
 111     kms.or(km1);
 112     assertTrue(kms.matches(vp));
 113   }
 114
 115   @Test
 116   public void testIsEmpty()
 117   {
 118     KeyedMatcherI km = new KeyedMatcher("AF", Condition.GE, -2F);
 119     KeyedMatcherSetI kms = new KeyedMatcherSet();
 120     assertTrue(kms.isEmpty());
 121     kms.and(km);
 122     assertFalse(kms.isEmpty());
 123   }
 124 }