test/jalview/ws/jabaws/JalviewJabawsTestUtils.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
  12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package jalview.ws.jabaws;
  22
  23 import jalview.ws.jws2.Jws2Discoverer;
  24
  25 import java.util.Vector;
  26
  27 import org.testng.Assert;
  28 import org.testng.annotations.AfterClass;
  29 import org.testng.annotations.BeforeClass;
  30 import org.testng.annotations.Test;
  31
  32 public class JalviewJabawsTestUtils
  33 {
  34
  35   @BeforeClass(alwaysRun = true)
  36   public static void setUpBeforeClass() throws Exception
  37   {
  38   }
  39
  40   @AfterClass(alwaysRun = true)
  41   public static void tearDownAfterClass() throws Exception
  42   {
  43   }
  44
  45   /**
  46    * test servers
  47    */
  48   private static String[] serviceUrls = new String[] {
  49       "http://localhost:8080/jabaws",
  50       "http://www.compbio.dundee.ac.uk/jabaws" };
  51
  52   @Test(groups = { "Functional" }, enabled = false)
  53   public void testAnnotExport()
  54   {
  55     Assert.fail("Not yet implemented");
  56   }
  57
  58   public static jalview.ws.jws2.Jws2Discoverer getJabawsDiscoverer()
  59   {
  60     return getJabawsDiscoverer(true);
  61   }
  62
  63   /**
  64    * Returns a service discoverer that queries localhost and compbio urls.
  65    * <p>
  66    * If using this method, be sure to have read-only Jalview properties, to
  67    * avoid writing the test urls to .jalview_properties. This can be done by
  68    * either
  69    * <ul>
  70    * <li>running Jalview main with arguments -props propFileName</li>
  71    * <li>calling Cache.loadProperties(filename)</li>
  72    * <ul>
  73    *
  74    * @param localhost
  75    * @return
  76    */
  77   public static Jws2Discoverer getJabawsDiscoverer(boolean localhost)
  78   {
  79     jalview.ws.jws2.Jws2Discoverer disc = jalview.ws.jws2.Jws2Discoverer
  80             .getDiscoverer();
  81     String svcurls = "";
  82     if (localhost)
  83     {
  84       int p = 0;
  85       Vector<String> services = new Vector<String>();
  86       for (String url : JalviewJabawsTestUtils.serviceUrls)
  87       {
  88         svcurls += url + "; ";
  89         services.add(url);
  90       }
  91       ;
  92       Jws2Discoverer.getDiscoverer().setServiceUrls(services);
  93     }
  94     try
  95     {
  96       disc.run();
  97     } catch (Exception e)
  98     {
  99       e.printStackTrace();
 100       Assert.fail("Aborting. Problem discovering services. Tried "
 101               + svcurls);
 102     }
 103     Assert.assertTrue(disc.getServices().size() > 0,
 104             "Failed to discover any services at ");
 105     return disc;
 106   }
 107
 108 }