test/jalview/ws/jabaws/JalviewJabawsTestUtils.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
  12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package jalview.ws.jabaws;
  22
  23 import static org.junit.Assert.assertTrue;
  24 import static org.junit.Assert.fail;
  25
  26 import java.util.Vector;
  27
  28 import org.junit.AfterClass;
  29 import org.junit.BeforeClass;
  30 import org.junit.Ignore;
  31 import org.junit.Test;
  32
  33 import jalview.ws.jws2.Jws2Discoverer;
  34
  35 public class JalviewJabawsTestUtils
  36 {
  37
  38   @BeforeClass
  39   public static void setUpBeforeClass() throws Exception
  40   {
  41   }
  42
  43   @AfterClass
  44   public static void tearDownAfterClass() throws Exception
  45   {
  46   }
  47
  48   /**
  49    * test servers
  50    */
  51   private static String[] serviceUrls = new String[]
  52   { "http://localhost:8080/jabaws",
  53       "http://www.compbio.dundee.ac.uk/jabaws" };
  54
  55   @Test
  56   @Ignore
  57   public void testAnnotExport()
  58   {
  59     fail("Not yet implemented");
  60   }
  61
  62   public static jalview.ws.jws2.Jws2Discoverer getJabawsDiscoverer()
  63   {
  64     return getJabawsDiscoverer(true);
  65   }
  66   public static Jws2Discoverer getJabawsDiscoverer(boolean localhost)
  67   {
  68     jalview.ws.jws2.Jws2Discoverer disc = jalview.ws.jws2.Jws2Discoverer
  69             .getDiscoverer();
  70     String svcurls = "";
  71     if (localhost)
  72     {
  73       int p = 0;
  74       Vector<String> services = new Vector<String>();
  75       for (String url : JalviewJabawsTestUtils.serviceUrls)
  76       {
  77         svcurls += url + "; ";
  78         services.add(url);
  79       }
  80       ;
  81       Jws2Discoverer.getDiscoverer().setServiceUrls(services);
  82     }
  83     try
  84     {
  85       disc.run();
  86     } catch (Exception e)
  87     {
  88       e.printStackTrace();
  89       fail("Aborting. Problem discovering services. Tried " + svcurls);
  90     }
  91     assertTrue("Failed to discover any services at ", disc.getServices()
  92             .size() > 0);
  93     return disc;
  94   }
  95
  96
  97 }