utils/getdown/bin/jalview.ps1

   1 #!/usr/bin/env pwsh
   2
   3 # save args and first parameter
   4 $myArgs = $args.Clone()
   5 $myArg1 = $args[0]
   6
   7 # setup for powershell version < 6.0
   8 [bool] $myIsWindows = 0
   9 [bool] $myIsMacOS = 0
  10 if ( $IsWindows -eq $null ) {
  11   # for powershell version < 6.0 let's assume Windows
  12   $myIsWindows = 1
  13   $myIsMacOS = 0
  14 } else {
  15   $myIsWindows = $IsWindows
  16   $myIsMacOS = $IsMacOS
  17 }
  18
  19 # parent dir of this script (should be the getdown app dir). Follow symlinks.
  20 $TARGET = ( Get-Item $MyInvocation.MyCommand.Path ).Target
  21 $DIR = If ( $TARGET -eq $null -or $TARGET.LinkType -ne "SymbolicLink" ) { Split-Path -Path $MyInvocation.MyCommand.Path -Parent } Else { Split-Path -Path $TARGET -Parent }
  22
  23 # set the "-open" parameter if myArg1 is non-zero-length, and not "open" or starts with a "-"
  24 $OPEN = ""
  25 if ( $myArg1.length -gt 0 -and ( -not $myArg1.StartsWith("-") ) -and $myArg1 -cne "open" ) {
  26   $OPEN = "-open"
  27 }
  28
  29 $APPDIR = If ( ( Split-Path -Path $DIR -Leaf ) -eq "bin" ) { Split-Path -Path $DIR -Parent } Else { $DIR }
  30 $JAVAEXE = If ( $myIsWindows ) { "java.exe" } Else { "java" }
  31 $JAVA = Join-Path -Path $APPDIR -ChildPath ( "jre/" + $( If ( $myIsMacOS ) { "Contents/Home/" } Else { "" } ) + "bin/${JAVAEXE}" )
  32 $GETDOWNTXT = Join-Path -Path $APPDIR -ChildPath "getdown.txt"
  33
  34 # look for getdown.txt -- needed to create classpath
  35 if ( -not ( Test-Path -Path "${GETDOWNTXT}" ) ) {
  36   throw "Cannot find getdown.txt"
  37 }
  38
  39 # look for bundled JRE. Might not be there if unix installer used in which case just invoke "java"
  40 if ( -not ( Test-Path -Path "${JAVA}" ) ) {
  41   Write-Host "Cannot find bundled ${JAVAEXE}. Using system ${JAVAEXE} and hoping for the best!"
  42   $JAVA = $JAVAEXE
  43 }
  44
  45 $CLASSPATH = ( Select-String -Path "${GETDOWNTXT}" -AllMatches -Pattern "code\s*=\s*(.*)$" | foreach { Join-Path -Path $APPDIR -ChildPath $($_.Matches.Groups[1].Value ) } ) -join $( If ( $myIsWindows ) { ";" } Else { ":" } )
  46
  47 # quote the args and the command (in case of spaces) with escape chars (`) and precede with & to indicate command not string
  48 $myArgsString = '"' + $($myArgs -join '" "') + '"'
  49 Invoke-Expression -Command "& `"${JAVA}`" -cp `"${CLASSPATH}`" jalview.bin.Launcher ${OPEN} ${myArgsString}"
  50