JAL-1620 version bump and release notes
[jalview.git] / help / html / features / hiddenRegions.html
index 046a326..b482b3b 100644 (file)
@@ -1,21 +1,24 @@
 <html>
 <!--
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.6.1)
- * Copyright (C) 2010 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8.2b1)
+ * Copyright (C) 2014 The Jalview Authors
  * 
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- * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
- * 
+ * as published by the Free Software Foundation, either version 3
+ * of the License, or (at your option) any later version.
+ *  
  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
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  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  * 
- * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
--->
+ * You should have received a copy of the GNU General Public License
+ * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+ * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
+ -->
 <head>
 <title>Hidden Regions</title>
 </head>
@@ -38,7 +41,7 @@ web service alignments performed on visible sequences.</p>
 A more advanced hide involves a right-mouse click on a sequence, then
 selecting <strong>&quot;SequenceID -&gt; Represent Group with
 SequenceId&quot;</strong>. Using this method of hiding sequences, any edits
-performed on the visible group representative will be propogated to all
+performed on the visible group representative will be propagated to all
 the sequences in that group. <br>
 The hidden representative sequences will not be used in any calculations
 or web service alignments (<em>nb. this may change in the future</em>).
@@ -75,7 +78,7 @@ constraints apply:
        alignment</a></strong> and <strong><a href="../calculations/pca.html">PCA</a></strong>
        calculations will only be performed using the <em>visible</em> parts of
        the alignment.</li>
-       <li><a href="../webservices/msaclient.html">Multiple Sequence
+       <li><a href="../webServices/msaclient.html">Multiple Sequence
        Alignments</a> are performed locally on on each visible chunk of the input,
        and concatenated with the hidden regions to form the final result.
 </p>