JAL-1620 version bump and release notes
[jalview.git] / help / html / features / pdbviewer.html
index 743f2a9..2bfaeb6 100755 (executable)
@@ -1,21 +1,24 @@
 <html>
 <!--
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.7)
- * Copyright (C) 2011 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8.2b1)
+ * Copyright (C) 2014 The Jalview Authors
  * 
  * This file is part of Jalview.
  * 
  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
  * modify it under the terms of the GNU General Public License 
- * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
- * 
+ * as published by the Free Software Foundation, either version 3
+ * of the License, or (at your option) any later version.
+ *  
  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  * 
- * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
--->
+ * You should have received a copy of the GNU General Public License
+ * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+ * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
+ -->
 <head>
 <title>PDB Viewer</title>
 </head>
@@ -28,9 +31,11 @@ PDB viewer, which is only used in situations where Jmol is unavailable
 or cannot operate.</p>
 <p><strong>The PDB Viewer Window</strong>
 <p>This interactive structure viewing window is opened by selecting
-the <strong>&quot;Sequence&#8594;View PDB entry:&quot;</strong> entry in
-the <a href="../menus/popupMenu.html">sequence id pop-up menu</a>. This
-can only be done for sequences which have an <a href="viewingpdbs.html">associated
+entries from the <strong>&quot;Structure&#8594;&quot;</strong> submenu
+               of the <a href="../menus/popupMenu.html">sequence
+                       id pop-up menu</a>. The internal PDB viewer is not able to show
+               superpositions, so no other options are provided. Structures can only
+               be viewed for sequences which have an <a href="viewingpdbs.html">associated
 PDB structure</a>, and the PDB Viewer will only be associated with the
 particular alignment view from which it was opened.</p>
 <p><strong>Controls</strong></p>