JAL-1620 version bump and release notes
[jalview.git] / help / html / menus / alwedit.html
index 488e2f0..933a1bf 100755 (executable)
@@ -1,21 +1,24 @@
 <html>
 <!--
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.7)
- * Copyright (C) 2011 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8.2b1)
+ * Copyright (C) 2014 The Jalview Authors
  * 
  * This file is part of Jalview.
  * 
  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
  * modify it under the terms of the GNU General Public License 
- * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
- * 
+ * as published by the Free Software Foundation, either version 3
+ * of the License, or (at your option) any later version.
+ *  
  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  * 
- * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
--->
+ * You should have received a copy of the GNU General Public License
+ * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+ * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
+ -->
 <head>
 <title>Alignment Window Menus</title>
 </head>
@@ -88,8 +91,8 @@
        undo the last redundancy deletion.</em></li>
        <li><strong>Pad Gaps<br>
        </strong><em>When selected, the alignment will be kept at minimal width (so
-       there no empty columns before or after the first or last aligned
-       residue) and all sequences will be padded with gap characters to the
+       there are no empty columns before or after the first or last aligned
+       residue) and all sequences will be padded with gap characters 
        before and after their terminating residues.<br>
        This switch is useful when making a tree using unaligned sequences and
        when working with alignment analysis programs which require 'properly