JAL-3438 spotless for 2.11.2.0
[jalview.git] / src / jalview / datamodel / PDBEntry.java
index 741ef07..65ba18b 100755 (executable)
@@ -39,11 +39,14 @@ public class PDBEntry
   private static final int PDB_ID_LENGTH = 4;
 
   /**
-   * property set when id is a 'manufactured' identifier from the structure data's filename
+   * property set when id is a 'manufactured' identifier from the structure
+   * data's filename
    */
   private static final String FAKED_ID = "faked_pdbid";
+
   /**
-   * property set when the id is authoritative, and should be used in preference to any identifiers in the structure data
+   * property set when the id is authoritative, and should be used in preference
+   * to any identifiers in the structure data
    */
   private static final String AUTHORITATIVE_ID = "authoritative_pdbid";
 
@@ -57,7 +60,8 @@ public class PDBEntry
   {
     // TODO is FILE needed; if not is this enum needed, or can we
     // use FileFormatI for PDB, MMCIF?
-    PDB("pdb", "pdb"), MMCIF("mmcif", "cif"), BCIF("bcif","bcif"),FILE("?", "?");
+    PDB("pdb", "pdb"), MMCIF("mmcif", "cif"), BCIF("bcif", "bcif"),
+    FILE("?", "?");
 
     /*
      * file extension for cached structure file; must be one that
@@ -493,12 +497,12 @@ public class PDBEntry
     }
     return true;
   }
-  
+
   public void setAuthoritative(boolean isAuthoritative)
   {
     setProperty(AUTHORITATIVE_ID, Boolean.valueOf(isAuthoritative));
   }
-  
+
   /**
    * 
    * @return true if the identifier should be preferred over any identifiers
@@ -508,13 +512,14 @@ public class PDBEntry
   {
     if (_hasProperty(AUTHORITATIVE_ID))
     {
-      return ((Boolean)getProperty(AUTHORITATIVE_ID));
+      return ((Boolean) getProperty(AUTHORITATIVE_ID));
     }
     return false;
   }
 
   /**
    * set when Jalview has manufactured the ID using a local filename
+   * 
    * @return
    */
   public boolean fakedPDBId()
@@ -525,15 +530,17 @@ public class PDBEntry
     }
     return false;
   }
+
   public void setFakedPDBId(boolean faked)
   {
     if (faked)
     {
       setProperty(FAKED_ID, Boolean.TRUE);
     }
-    else 
+    else
     {
-      if (properties!=null) {
+      if (properties != null)
+      {
         properties.remove(FAKED_ID);
       }
     }