JAL-1517 update copyright to version 2.8.2
[jalview.git] / src / jalview / util / BrowserLauncher.java
index 12d6f02..2e4a262 100755 (executable)
 /*
-* Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer
-* Copyright (C) 2005 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle
-*
-* This program is free software; you can redistribute it and/or
-* modify it under the terms of the GNU General Public License
-* as published by the Free Software Foundation; either version 2
-* of the License, or (at your option) any later version.
-*
-* This program is distributed in the hope that it will be useful,
-* but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
-* MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
-* GNU General Public License for more details.
-*
-* You should have received a copy of the GNU General Public License
-* along with this program; if not, write to the Free Software
-* Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA
-*/\r
-package jalview.util;\r
-\r
-import java.io.File;\r
-import java.io.IOException;\r
-\r
-import java.lang.reflect.Constructor;\r
-import java.lang.reflect.Field;\r
-import java.lang.reflect.InvocationTargetException;\r
-import java.lang.reflect.Method;\r
-\r
-\r
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8.2)
+ * Copyright (C) 2014 The Jalview Authors
+ * 
+ * This file is part of Jalview.
+ * 
+ * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
+ * modify it under the terms of the GNU General Public License 
+ * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
+ *  
+ * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
+ * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
+ * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
+ * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
+ * 
+ * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+ * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
+ */
+package jalview.util;
+
+import java.io.*;
+import java.lang.reflect.*;
+
 /**
- * BrowserLauncher is a class that provides one static method, openURL, which opens the default
- * web browser for the current user of the system to the given URL.  It may support other
- * protocols depending on the system -- mailto, ftp, etc. -- but that has not been rigorously
- * tested and is not guaranteed to work.
+ * BrowserLauncher is a class that provides one static method, openURL, which
+ * opens the default web browser for the current user of the system to the given
+ * URL. It may support other protocols depending on the system -- mailto, ftp,
+ * etc. -- but that has not been rigorously tested and is not guaranteed to
+ * work.
  * <p>
- * Yes, this is platform-specific code, and yes, it may rely on classes on certain platforms
- * that are not part of the standard JDK.  What we're trying to do, though, is to take something
- * that's frequently desirable but inherently platform-specific -- opening a default browser --
- * and allow programmers (you, for example) to do so without worrying about dropping into native
- * code or doing anything else similarly evil.
+ * Yes, this is platform-specific code, and yes, it may rely on classes on
+ * certain platforms that are not part of the standard JDK. What we're trying to
+ * do, though, is to take something that's frequently desirable but inherently
+ * platform-specific -- opening a default browser -- and allow programmers (you,
+ * for example) to do so without worrying about dropping into native code or
+ * doing anything else similarly evil.
  * <p>
- * Anyway, this code is completely in Java and will run on all JDK 1.1-compliant systems without
- * modification or a need for additional libraries.  All classes that are required on certain
- * platforms to allow this to run are dynamically loaded at runtime via reflection and, if not
- * found, will not cause this to do anything other than returning an error when opening the
- * browser.
+ * Anyway, this code is completely in Java and will run on all JDK 1.1-compliant
+ * systems without modification or a need for additional libraries. All classes
+ * that are required on certain platforms to allow this to run are dynamically
+ * loaded at runtime via reflection and, if not found, will not cause this to do
+ * anything other than returning an error when opening the browser.
  * <p>
- * There are certain system requirements for this class, as it's running through Runtime.exec(),
- * which is Java's way of making a native system call.  Currently, this requires that a Macintosh
- * have a Finder which supports the GURL event, which is true for Mac OS 8.0 and 8.1 systems that
- * have the Internet Scripting AppleScript dictionary installed in the Scripting Additions folder
- * in the Extensions folder (which is installed by default as far as I know under Mac OS 8.0 and
- * 8.1), and for all Mac OS 8.5 and later systems.  On Windows, it only runs under Win32 systems
- * (Windows 95, 98, and NT 4.0, as well as later versions of all).  On other systems, this drops
- * back from the inherently platform-sensitive concept of a default browser and simply attempts
- * to launch Netscape via a shell command.
+ * There are certain system requirements for this class, as it's running through
+ * Runtime.exec(), which is Java's way of making a native system call.
+ * Currently, this requires that a Macintosh have a Finder which supports the
+ * GURL event, which is true for Mac OS 8.0 and 8.1 systems that have the
+ * Internet Scripting AppleScript dictionary installed in the Scripting
+ * Additions folder in the Extensions folder (which is installed by default as
+ * far as I know under Mac OS 8.0 and 8.1), and for all Mac OS 8.5 and later
+ * systems. On Windows, it only runs under Win32 systems (Windows 95, 98, and NT
+ * 4.0, as well as later versions of all). On other systems, this drops back
+ * from the inherently platform-sensitive concept of a default browser and
+ * simply attempts to launch Netscape via a shell command.
  * <p>
- * This code is Copyright 1999-2001 by Eric Albert (ejalbert\@cs.stanford.edu) and may be
- * redistributed or modified in any form without restrictions as long as the portion of this
- * comment from this paragraph through the end of the comment is not removed.  The author
- * requests that he be notified of any application, applet, or other binary that makes use of
- * this code, but that's more out of curiosity than anything and is not required.  This software
- * includes no warranty.  The author is not repsonsible for any loss of data or functionality
- * or any adverse or unexpected effects of using this software.
+ * This code is Copyright 1999-2001 by Eric Albert (ejalbert\@cs.stanford.edu)
+ * and may be redistributed or modified in any form without restrictions as long
+ * as the portion of this comment from this paragraph through the end of the
+ * comment is not removed. The author requests that he be notified of any
+ * application, applet, or other binary that makes use of this code, but that's
+ * more out of curiosity than anything and is not required. This software
+ * includes no warranty. The author is not repsonsible for any loss of data or
+ * functionality or any adverse or unexpected effects of using this software.
  * <p>
- * Credits:
- * <br>Steven Spencer, JavaWorld magazine (<a href="http://www.javaworld.com/javaworld/javatips/jw-javatip66.html">Java Tip 66</a>)
- * <br>Thanks also to Ron B. Yeh, Eric Shapiro, Ben Engber, Paul Teitlebaum, Andrea Cantatore,
- * Larry Barowski, Trevor Bedzek, Frank Miedrich, and Ron Rabakukk
- *
- * @author Eric Albert (<a href="mailto:ejalbert@cs.stanford.edu">ejalbert@cs.stanford.edu</a>)
+ * Credits: <br>
+ * Steven Spencer, JavaWorld magazine (<a
+ * href="http://www.javaworld.com/javaworld/javatips/jw-javatip66.html">Java Tip
+ * 66</a>) <br>
+ * Thanks also to Ron B. Yeh, Eric Shapiro, Ben Engber, Paul Teitlebaum, Andrea
+ * Cantatore, Larry Barowski, Trevor Bedzek, Frank Miedrich, and Ron Rabakukk
+ * 
+ * @author Eric Albert (<a
+ *         href="mailto:ejalbert@cs.stanford.edu">ejalbert@cs.stanford.edu</a>)
  * @version 1.4b1 (Released June 20, 2001)
- */\r
-public class BrowserLauncher {\r
-    /**
- * The Java virtual machine that we are running on.  Actually, in most cases we only care
- * about the operating system, but some operating systems require us to switch on the VM. */\r
-    private static int jvm;\r
-\r
-    /** The browser for the system */\r
-    private static Object browser;\r
-\r
-    /**
- * Caches whether any classes, methods, and fields that are not part of the JDK and need to
- * be dynamically loaded at runtime loaded successfully.
- * <p>
- * Note that if this is <code>false</code>, <code>openURL()</code> will always return an
- * IOException.
- */\r
-    private static boolean loadedWithoutErrors;\r
-\r
-    /** The com.apple.mrj.MRJFileUtils class */\r
-    private static Class mrjFileUtilsClass;\r
-\r
-    /** The com.apple.mrj.MRJOSType class */\r
-    private static Class mrjOSTypeClass;\r
-\r
-    /** The com.apple.MacOS.AEDesc class */\r
-    private static Class aeDescClass;\r
-\r
-    /** The &lt;init&gt;(int) method of com.apple.MacOS.AETarget */\r
-    private static Constructor aeTargetConstructor;\r
-\r
-    /** The &lt;init&gt;(int, int, int) method of com.apple.MacOS.AppleEvent */\r
-    private static Constructor appleEventConstructor;\r
-\r
-    /** The &lt;init&gt;(String) method of com.apple.MacOS.AEDesc */\r
-    private static Constructor aeDescConstructor;\r
-\r
-    /** The findFolder method of com.apple.mrj.MRJFileUtils */\r
-    private static Method findFolder;\r
-\r
-    /** The getFileCreator method of com.apple.mrj.MRJFileUtils */\r
-    private static Method getFileCreator;\r
-\r
-    /** The getFileType method of com.apple.mrj.MRJFileUtils */\r
-    private static Method getFileType;\r
-\r
-    /** The openURL method of com.apple.mrj.MRJFileUtils */\r
-    private static Method openURL;\r
-\r
-    /** The makeOSType method of com.apple.MacOS.OSUtils */\r
-    private static Method makeOSType;\r
-\r
-    /** The putParameter method of com.apple.MacOS.AppleEvent */\r
-    private static Method putParameter;\r
-\r
-    /** The sendNoReply method of com.apple.MacOS.AppleEvent */\r
-    private static Method sendNoReply;\r
-\r
-    /** Actually an MRJOSType pointing to the System Folder on a Macintosh */\r
-    private static Object kSystemFolderType;\r
-\r
-    /** The keyDirectObject AppleEvent parameter type */\r
-    private static Integer keyDirectObject;\r
-\r
-    /** The kAutoGenerateReturnID AppleEvent code */\r
-    private static Integer kAutoGenerateReturnID;\r
-\r
-    /** The kAnyTransactionID AppleEvent code */\r
-    private static Integer kAnyTransactionID;\r
-\r
-    /** The linkage object required for JDirect 3 on Mac OS X. */\r
-    private static Object linkage;\r
-\r
-    /** The framework to reference on Mac OS X */\r
-    private static final String JDirect_MacOSX = "/System/Library/Frameworks/Carbon.framework/Frameworks/HIToolbox.framework/HIToolbox";\r
-\r
-    /** JVM constant for MRJ 2.0 */\r
-    private static final int MRJ_2_0 = 0;\r
-\r
-    /** JVM constant for MRJ 2.1 or later */\r
-    private static final int MRJ_2_1 = 1;\r
-\r
-    /** JVM constant for Java on Mac OS X 10.0 (MRJ 3.0) */\r
-    private static final int MRJ_3_0 = 3;\r
-\r
-    /** JVM constant for MRJ 3.1 */\r
-    private static final int MRJ_3_1 = 4;\r
-\r
-    /** JVM constant for any Windows NT JVM */\r
-    private static final int WINDOWS_NT = 5;\r
-\r
-    /** JVM constant for any Windows 9x JVM */\r
-    private static final int WINDOWS_9x = 6;\r
-\r
-    /** JVM constant for any other platform */\r
-    private static final int OTHER = -1;\r
-\r
-    /**
- * The file type of the Finder on a Macintosh.  Hardcoding "Finder" would keep non-U.S. English
- * systems from working properly.
- */\r
-    private static final String FINDER_TYPE = "FNDR";\r
-\r
-    /**
- * The creator code of the Finder on a Macintosh, which is needed to send AppleEvents to the
- * application.
- */\r
-    private static final String FINDER_CREATOR = "MACS";\r
-\r
-    /** The name for the AppleEvent type corresponding to a GetURL event. */\r
-    private static final String GURL_EVENT = "GURL";\r
-\r
-    /**
- * The first parameter that needs to be passed into Runtime.exec() to open the default web
- * browser on Windows.
- */\r
-    private static final String FIRST_WINDOWS_PARAMETER = "/c";\r
-\r
-    /** The second parameter for Runtime.exec() on Windows. */\r
-    private static final String SECOND_WINDOWS_PARAMETER = "start";\r
-\r
-    /**
- * The third parameter for Runtime.exec() on Windows.  This is a "title"
- * parameter that the command line expects.  Setting this parameter allows
- * URLs containing spaces to work.
- */\r
-    private static final String THIRD_WINDOWS_PARAMETER = "\"\"";\r
-\r
-    /**
- * The shell parameters for Netscape that opens a given URL in an already-open copy of Netscape
- * on many command-line systems.
- */\r
-    private static final String NETSCAPE_REMOTE_PARAMETER = "-remote";\r
-    private static final String NETSCAPE_OPEN_PARAMETER_START = "openURL(";\r
-    private static final String NETSCAPE_OPEN_NEW_WINDOW = ", new-window";\r
-    private static final String NETSCAPE_OPEN_PARAMETER_END = ")";\r
-\r
-    /**
- * The message from any exception thrown throughout the initialization process.
- */\r
-    private static String errorMessage;\r
-\r
-    /**
- * An initialization block that determines the operating system and loads the necessary
- * runtime data.
- */\r
-    static {\r
-        loadedWithoutErrors = true;\r
-\r
-        String osName = System.getProperty("os.name");\r
-\r
-        if (osName.startsWith("Mac OS")) {\r
-            String mrjVersion = System.getProperty("mrj.version");\r
-            String majorMRJVersion = mrjVersion.substring(0, 3);\r
-\r
-            try {\r
-                double version = Double.valueOf(majorMRJVersion).doubleValue();\r
-\r
-                if (version == 2) {\r
-                    jvm = MRJ_2_0;\r
-                } else if ((version >= 2.1) && (version < 3)) {\r
-                    // Assume that all 2.x versions of MRJ work the same.  MRJ 2.1 actually\r
-                    // works via Runtime.exec() and 2.2 supports that but has an openURL() method\r
-                    // as well that we currently ignore.\r
-                    jvm = MRJ_2_1;\r
-                } else if (version == 3.0) {\r
-                    jvm = MRJ_3_0;\r
-                } else if (version >= 3.1) {\r
-                    // Assume that all 3.1 and later versions of MRJ work the same.\r
-                    jvm = MRJ_3_1;\r
-                } else {\r
-                    loadedWithoutErrors = false;\r
-                    errorMessage = "Unsupported MRJ version: " + version;\r
-                }\r
-            } catch (NumberFormatException nfe) {\r
-                loadedWithoutErrors = false;\r
-                errorMessage = "Invalid MRJ version: " + mrjVersion;\r
-            }\r
-        } else if (osName.startsWith("Windows")) {\r
-            if (osName.indexOf("9") != -1) {\r
-                jvm = WINDOWS_9x;\r
-            } else {\r
-                jvm = WINDOWS_NT;\r
-            }\r
-        } else {\r
-            jvm = OTHER;\r
-        }\r
-\r
-        if (loadedWithoutErrors) { // if we haven't hit any errors yet\r
-            loadedWithoutErrors = loadClasses();\r
-        }\r
-    }\r
-\r
-    /**
- * This class should be never be instantiated; this just ensures so.
- */\r
-    private BrowserLauncher() {\r
-    }\r
-\r
-    /**
- * Called by a static initializer to load any classes, fields, and methods required at runtime
- * to locate the user's web browser.
- * @return <code>true</code> if all intialization succeeded
- *                        <code>false</code> if any portion of the initialization failed
- */\r
-    private static boolean loadClasses() {\r
-        switch (jvm) {\r
-        case MRJ_2_0:\r
-\r
-            try {\r
-                Class aeTargetClass = Class.forName("com.apple.MacOS.AETarget");\r
-                Class osUtilsClass = Class.forName("com.apple.MacOS.OSUtils");\r
-                Class appleEventClass = Class.forName(\r
-                        "com.apple.MacOS.AppleEvent");\r
-                Class aeClass = Class.forName("com.apple.MacOS.ae");\r
-                aeDescClass = Class.forName("com.apple.MacOS.AEDesc");\r
-\r
-                aeTargetConstructor = aeTargetClass.getDeclaredConstructor(new Class[] {\r
-                            int.class\r
-                        });\r
-                appleEventConstructor = appleEventClass.getDeclaredConstructor(new Class[] {\r
-                            int.class, int.class, aeTargetClass, int.class,\r
-                            int.class\r
-                        });\r
-                aeDescConstructor = aeDescClass.getDeclaredConstructor(new Class[] {\r
-                            String.class\r
-                        });\r
-\r
-                makeOSType = osUtilsClass.getDeclaredMethod("makeOSType",\r
-                        new Class[] { String.class });\r
-                putParameter = appleEventClass.getDeclaredMethod("putParameter",\r
-                        new Class[] { int.class, aeDescClass });\r
-                sendNoReply = appleEventClass.getDeclaredMethod("sendNoReply",\r
-                        new Class[] {  });\r
-\r
-                Field keyDirectObjectField = aeClass.getDeclaredField(\r
-                        "keyDirectObject");\r
-                keyDirectObject = (Integer) keyDirectObjectField.get(null);\r
-\r
-                Field autoGenerateReturnIDField = appleEventClass.getDeclaredField(\r
-                        "kAutoGenerateReturnID");\r
-                kAutoGenerateReturnID = (Integer) autoGenerateReturnIDField.get(null);\r
-\r
-                Field anyTransactionIDField = appleEventClass.getDeclaredField(\r
-                        "kAnyTransactionID");\r
-                kAnyTransactionID = (Integer) anyTransactionIDField.get(null);\r
-            } catch (ClassNotFoundException cnfe) {\r
-                errorMessage = cnfe.getMessage();\r
-\r
-                return false;\r
-            } catch (NoSuchMethodException nsme) {\r
-                errorMessage = nsme.getMessage();\r
-\r
-                return false;\r
-            } catch (NoSuchFieldException nsfe) {\r
-                errorMessage = nsfe.getMessage();\r
-\r
-                return false;\r
-            } catch (IllegalAccessException iae) {\r
-                errorMessage = iae.getMessage();\r
-\r
-                return false;\r
-            }\r
-\r
-            break;\r
-\r
-        case MRJ_2_1:\r
-\r
-            try {\r
-                mrjFileUtilsClass = Class.forName("com.apple.mrj.MRJFileUtils");\r
-                mrjOSTypeClass = Class.forName("com.apple.mrj.MRJOSType");\r
-\r
-                Field systemFolderField = mrjFileUtilsClass.getDeclaredField(\r
-                        "kSystemFolderType");\r
-                kSystemFolderType = systemFolderField.get(null);\r
-                findFolder = mrjFileUtilsClass.getDeclaredMethod("findFolder",\r
-                        new Class[] { mrjOSTypeClass });\r
-                getFileCreator = mrjFileUtilsClass.getDeclaredMethod("getFileCreator",\r
-                        new Class[] { File.class });\r
-                getFileType = mrjFileUtilsClass.getDeclaredMethod("getFileType",\r
-                        new Class[] { File.class });\r
-            } catch (ClassNotFoundException cnfe) {\r
-                errorMessage = cnfe.getMessage();\r
-\r
-                return false;\r
-            } catch (NoSuchFieldException nsfe) {\r
-                errorMessage = nsfe.getMessage();\r
-\r
-                return false;\r
-            } catch (NoSuchMethodException nsme) {\r
-                errorMessage = nsme.getMessage();\r
-\r
-                return false;\r
-            } catch (SecurityException se) {\r
-                errorMessage = se.getMessage();\r
-\r
-                return false;\r
-            } catch (IllegalAccessException iae) {\r
-                errorMessage = iae.getMessage();\r
-\r
-                return false;\r
-            }\r
-\r
-            break;\r
-\r
-        case MRJ_3_0:\r
-\r
-            try {\r
-                Class linker = Class.forName("com.apple.mrj.jdirect.Linker");\r
-                Constructor constructor = linker.getConstructor(new Class[] {\r
-                            Class.class\r
-                        });\r
-                linkage = constructor.newInstance(new Object[] {\r
-                            BrowserLauncher.class\r
-                        });\r
-            } catch (ClassNotFoundException cnfe) {\r
-                errorMessage = cnfe.getMessage();\r
-\r
-                return false;\r
-            } catch (NoSuchMethodException nsme) {\r
-                errorMessage = nsme.getMessage();\r
-\r
-                return false;\r
-            } catch (InvocationTargetException ite) {\r
-                errorMessage = ite.getMessage();\r
-\r
-                return false;\r
-            } catch (InstantiationException ie) {\r
-                errorMessage = ie.getMessage();\r
-\r
-                return false;\r
-            } catch (IllegalAccessException iae) {\r
-                errorMessage = iae.getMessage();\r
-\r
-                return false;\r
-            }\r
-\r
-            break;\r
-\r
-        case MRJ_3_1:\r
-\r
-            try {\r
-                mrjFileUtilsClass = Class.forName("com.apple.mrj.MRJFileUtils");\r
-                openURL = mrjFileUtilsClass.getDeclaredMethod("openURL",\r
-                        new Class[] { String.class });\r
-            } catch (ClassNotFoundException cnfe) {\r
-                errorMessage = cnfe.getMessage();\r
-\r
-                return false;\r
-            } catch (NoSuchMethodException nsme) {\r
-                errorMessage = nsme.getMessage();\r
-\r
-                return false;\r
-            }\r
-\r
-            break;\r
-\r
-        default:\r
-            break;\r
-        }\r
-\r
-        return true;\r
-    }\r
-\r
-    /**
- * Attempts to locate the default web browser on the local system.  Caches results so it
- * only locates the browser once for each use of this class per JVM instance.
- * @return The browser for the system.  Note that this may not be what you would consider
- *                        to be a standard web browser; instead, it's the application that gets called to
- *                        open the default web browser.  In some cases, this will be a non-String object
- *                        that provides the means of calling the default browser.
- */\r
-    private static Object locateBrowser() {\r
-        if (browser != null) {\r
-            return browser;\r
-        }\r
-\r
-        switch (jvm) {\r
-        case MRJ_2_0:\r
-\r
-            try {\r
-                Integer finderCreatorCode = (Integer) makeOSType.invoke(null,\r
-                        new Object[] { FINDER_CREATOR });\r
-                Object aeTarget = aeTargetConstructor.newInstance(new Object[] {\r
-                            finderCreatorCode\r
-                        });\r
-                Integer gurlType = (Integer) makeOSType.invoke(null,\r
-                        new Object[] { GURL_EVENT });\r
-                Object appleEvent = appleEventConstructor.newInstance(new Object[] {\r
-                            gurlType, gurlType, aeTarget, kAutoGenerateReturnID,\r
-                            kAnyTransactionID\r
-                        });\r
-\r
-                // Don't set browser = appleEvent because then the next time we call\r
-                // locateBrowser(), we'll get the same AppleEvent, to which we'll already have\r
-                // added the relevant parameter. Instead, regenerate the AppleEvent every time.\r
-                // There's probably a way to do this better; if any has any ideas, please let\r
-                // me know.\r
-                return appleEvent;\r
-            } catch (IllegalAccessException iae) {\r
-                browser = null;\r
-                errorMessage = iae.getMessage();\r
-\r
-                return browser;\r
-            } catch (InstantiationException ie) {\r
-                browser = null;\r
-                errorMessage = ie.getMessage();\r
-\r
-                return browser;\r
-            } catch (InvocationTargetException ite) {\r
-                browser = null;\r
-                errorMessage = ite.getMessage();\r
-\r
-                return browser;\r
-            }\r
-\r
-        case MRJ_2_1:\r
-\r
-            File systemFolder;\r
-\r
-            try {\r
-                systemFolder = (File) findFolder.invoke(null,\r
-                        new Object[] { kSystemFolderType });\r
-            } catch (IllegalArgumentException iare) {\r
-                browser = null;\r
-                errorMessage = iare.getMessage();\r
-\r
-                return browser;\r
-            } catch (IllegalAccessException iae) {\r
-                browser = null;\r
-                errorMessage = iae.getMessage();\r
-\r
-                return browser;\r
-            } catch (InvocationTargetException ite) {\r
-                browser = null;\r
-                errorMessage = ite.getTargetException().getClass() + ": " +\r
-                    ite.getTargetException().getMessage();\r
-\r
-                return browser;\r
-            }\r
-\r
-            String[] systemFolderFiles = systemFolder.list();\r
-\r
-            // Avoid a FilenameFilter because that can't be stopped mid-list\r
-            for (int i = 0; i < systemFolderFiles.length; i++) {\r
-                try {\r
-                    File file = new File(systemFolder, systemFolderFiles[i]);\r
-\r
-                    if (!file.isFile()) {\r
-                        continue;\r
-                    }\r
-\r
-                    // We're looking for a file with a creator code of 'MACS' and\r
-                    // a type of 'FNDR'.  Only requiring the type results in non-Finder\r
-                    // applications being picked up on certain Mac OS 9 systems,\r
-                    // especially German ones, and sending a GURL event to those\r
-                    // applications results in a logout under Multiple Users.\r
-                    Object fileType = getFileType.invoke(null,\r
-                            new Object[] { file });\r
-\r
-                    if (FINDER_TYPE.equals(fileType.toString())) {\r
-                        Object fileCreator = getFileCreator.invoke(null,\r
-                                new Object[] { file });\r
-\r
-                        if (FINDER_CREATOR.equals(fileCreator.toString())) {\r
-                            browser = file.toString(); // Actually the Finder, but that's OK\r
-\r
-                            return browser;\r
-                        }\r
-                    }\r
-                } catch (IllegalArgumentException iare) {\r
-                    browser = browser;\r
-                    errorMessage = iare.getMessage();\r
-\r
-                    return null;\r
-                } catch (IllegalAccessException iae) {\r
-                    browser = null;\r
-                    errorMessage = iae.getMessage();\r
-\r
-                    return browser;\r
-                } catch (InvocationTargetException ite) {\r
-                    browser = null;\r
-                    errorMessage = ite.getTargetException().getClass() + ": " +\r
-                        ite.getTargetException().getMessage();\r
-\r
-                    return browser;\r
-                }\r
-            }\r
-\r
-            browser = null;\r
-\r
-            break;\r
-\r
-        case MRJ_3_0:\r
-        case MRJ_3_1:\r
-            browser = ""; // Return something non-null\r
-\r
-            break;\r
-\r
-        case WINDOWS_NT:\r
-            browser = "cmd.exe";\r
-\r
-            break;\r
-\r
-        case WINDOWS_9x:\r
-            browser = "command.com";\r
-\r
-            break;\r
-\r
-        case OTHER:default:\r
-            browser = jalview.bin.Cache.applicationProperties.getProperty(\r
-                    "jalview.browser");\r
-\r
-            if (browser == null) {\r
-                // hope firefox exists :-/\r
-                browser = "firefox";\r
-            }\r
-\r
-            break;\r
-        }\r
-\r
-        return browser;\r
-    }\r
-\r
-    /**
- * Attempts to open the default web browser to the given URL.
- * @param url The URL to open
- * @throws IOException If the web browser could not be located or does not run
- */\r
-    public static void openURL(String url) throws IOException {\r
-        if (!loadedWithoutErrors) {\r
-            throw new IOException("Exception in finding browser: " +\r
-                errorMessage);\r
-        }\r
-\r
-        Object browser = locateBrowser();\r
-\r
-        if (browser == null) {\r
-            throw new IOException("Unable to locate browser: " + errorMessage);\r
-        }\r
-\r
-        switch (jvm) {\r
-        case MRJ_2_0:\r
-\r
-            Object aeDesc = null;\r
-\r
-            try {\r
-                aeDesc = aeDescConstructor.newInstance(new Object[] { url });\r
-                putParameter.invoke(browser,\r
-                    new Object[] { keyDirectObject, aeDesc });\r
-                sendNoReply.invoke(browser, new Object[] {  });\r
-            } catch (InvocationTargetException ite) {\r
-                throw new IOException(\r
-                    "InvocationTargetException while creating AEDesc: " +\r
-                    ite.getMessage());\r
-            } catch (IllegalAccessException iae) {\r
-                throw new IOException(\r
-                    "IllegalAccessException while building AppleEvent: " +\r
-                    iae.getMessage());\r
-            } catch (InstantiationException ie) {\r
-                throw new IOException(\r
-                    "InstantiationException while creating AEDesc: " +\r
-                    ie.getMessage());\r
-            } finally {\r
-                aeDesc = null; // Encourage it to get disposed if it was created\r
-                browser = null; // Ditto\r
-            }\r
-\r
-            break;\r
-\r
-        case MRJ_2_1:\r
-            Runtime.getRuntime().exec(new String[] { (String) browser, url });\r
-\r
-            break;\r
-\r
-        case MRJ_3_0:\r
-\r
-            int[] instance = new int[1];\r
-            int result = ICStart(instance, 0);\r
-\r
-            if (result == 0) {\r
-                int[] selectionStart = new int[] { 0 };\r
-                byte[] urlBytes = url.getBytes();\r
-                int[] selectionEnd = new int[] { urlBytes.length };\r
-                result = ICLaunchURL(instance[0], new byte[] { 0 }, urlBytes,\r
-                        urlBytes.length, selectionStart, selectionEnd);\r
-\r
-                if (result == 0) {\r
-                    // Ignore the return value; the URL was launched successfully\r
-                    // regardless of what happens here.\r
-                    ICStop(instance);\r
-                } else {\r
-                    throw new IOException("Unable to launch URL: " + result);\r
-                }\r
-            } else {\r
-                throw new IOException(\r
-                    "Unable to create an Internet Config instance: " + result);\r
-            }\r
-\r
-            break;\r
-\r
-        case MRJ_3_1:\r
-\r
-            try {\r
-                openURL.invoke(null, new Object[] { url });\r
-            } catch (InvocationTargetException ite) {\r
-                throw new IOException(\r
-                    "InvocationTargetException while calling openURL: " +\r
-                    ite.getMessage());\r
-            } catch (IllegalAccessException iae) {\r
-                throw new IOException(\r
-                    "IllegalAccessException while calling openURL: " +\r
-                    iae.getMessage());\r
-            }\r
-\r
-            break;\r
-\r
-        case WINDOWS_NT:\r
-        case WINDOWS_9x:\r
-\r
-            // Add quotes around the URL to allow ampersands and other special\r
-            // characters to work.\r
-            Process process = Runtime.getRuntime().exec(new String[] {\r
-                        (String) browser, FIRST_WINDOWS_PARAMETER,\r
-                        SECOND_WINDOWS_PARAMETER, THIRD_WINDOWS_PARAMETER,\r
-                        '"' + url + '"'\r
-                    });\r
-\r
-            // This avoids a memory leak on some versions of Java on Windows.\r
-            // That's hinted at in <http://developer.java.sun.com/developer/qow/archive/68/>.\r
-            try {\r
-                process.waitFor();\r
-                process.exitValue();\r
-            } catch (InterruptedException ie) {\r
-                throw new IOException(\r
-                    "InterruptedException while launching browser: " +\r
-                    ie.getMessage());\r
-            }\r
-\r
-            break;\r
-\r
-        case OTHER:\r
-\r
-            // Assume that we're on Unix and that Netscape (actually Firefox) is installed\r
-            // First, attempt to open the URL in a currently running session of Netscape\r
-            // JBPNote log debug\r
-\r
-            /* System.out.println("Executing : "+browser+" "+
-                                                                                                    NETSCAPE_REMOTE_PARAMETER+" "+
-                                                                                                    NETSCAPE_OPEN_PARAMETER_START +
-                                                                                                    url +
-                                                                                                    NETSCAPE_OPEN_NEW_WINDOW +
-                                                                                                    NETSCAPE_OPEN_PARAMETER_END);
- */\r
-            process = Runtime.getRuntime().exec(new String[] {\r
-                        (String) browser, NETSCAPE_REMOTE_PARAMETER,\r
-                        \r
-                    NETSCAPE_OPEN_PARAMETER_START + url +\r
-                        NETSCAPE_OPEN_NEW_WINDOW + NETSCAPE_OPEN_PARAMETER_END\r
-                    });\r
-\r
-            try {\r
-                int exitCode = process.waitFor();\r
-\r
-                if (exitCode != 0) { // if Netscape was not open\r
-                    Runtime.getRuntime().exec(new String[] { (String) browser, url });\r
-                }\r
-            } catch (InterruptedException ie) {\r
-                throw new IOException(\r
-                    "InterruptedException while launching browser: " +\r
-                    ie.getMessage());\r
-            }\r
-\r
-            break;\r
-\r
-        default:\r
-\r
-            // This should never occur, but if it does, we'll try the simplest thing possible\r
-            Runtime.getRuntime().exec(new String[] { (String) browser, url });\r
-\r
-            break;\r
-        }\r
-    }\r
-\r
-    /**
- * Methods required for Mac OS X.  The presence of native methods does not cause
- * any problems on other platforms.
- */\r
-    private native static int ICStart(int[] instance, int signature);\r
-\r
-    private native static int ICStop(int[] instance);\r
-\r
-    private native static int ICLaunchURL(int instance, byte[] hint,\r
-        byte[] data, int len, int[] selectionStart, int[] selectionEnd);\r
-}\r
+ */
+public class BrowserLauncher
+{
+  /**
+   * The Java virtual machine that we are running on. Actually, in most cases we
+   * only care about the operating system, but some operating systems require us
+   * to switch on the VM.
+   */
+  private static int jvm;
+
+  /** The browser for the system */
+  private static Object browser;
+
+  /**
+   * Caches whether any classes, methods, and fields that are not part of the
+   * JDK and need to be dynamically loaded at runtime loaded successfully.
+   * <p>
+   * Note that if this is <code>false</code>, <code>openURL()</code> will always
+   * return an IOException.
+   */
+  private static boolean loadedWithoutErrors;
+
+  /** The com.apple.mrj.MRJFileUtils class */
+  private static Class mrjFileUtilsClass;
+
+  /** The com.apple.mrj.MRJOSType class */
+  private static Class mrjOSTypeClass;
+
+  /** The com.apple.MacOS.AEDesc class */
+  private static Class aeDescClass;
+
+  /** The &lt;init&gt;(int) method of com.apple.MacOS.AETarget */
+  private static Constructor aeTargetConstructor;
+
+  /** The &lt;init&gt;(int, int, int) method of com.apple.MacOS.AppleEvent */
+  private static Constructor appleEventConstructor;
+
+  /** The &lt;init&gt;(String) method of com.apple.MacOS.AEDesc */
+  private static Constructor aeDescConstructor;
+
+  /** The findFolder method of com.apple.mrj.MRJFileUtils */
+  private static Method findFolder;
+
+  /** The getFileCreator method of com.apple.mrj.MRJFileUtils */
+  private static Method getFileCreator;
+
+  /** The getFileType method of com.apple.mrj.MRJFileUtils */
+  private static Method getFileType;
+
+  /** The openURL method of com.apple.mrj.MRJFileUtils */
+  private static Method openURL;
+
+  /** The makeOSType method of com.apple.MacOS.OSUtils */
+  private static Method makeOSType;
+
+  /** The putParameter method of com.apple.MacOS.AppleEvent */
+  private static Method putParameter;
+
+  /** The sendNoReply method of com.apple.MacOS.AppleEvent */
+  private static Method sendNoReply;
+
+  /** Actually an MRJOSType pointing to the System Folder on a Macintosh */
+  private static Object kSystemFolderType;
+
+  /** The keyDirectObject AppleEvent parameter type */
+  private static Integer keyDirectObject;
+
+  /** The kAutoGenerateReturnID AppleEvent code */
+  private static Integer kAutoGenerateReturnID;
+
+  /** The kAnyTransactionID AppleEvent code */
+  private static Integer kAnyTransactionID;
+
+  /** The linkage object required for JDirect 3 on Mac OS X. */
+  private static Object linkage;
+
+  /** The framework to reference on Mac OS X */
+  private static final String JDirect_MacOSX = "/System/Library/Frameworks/Carbon.framework/Frameworks/HIToolbox.framework/HIToolbox";
+
+  /** JVM constant for MRJ 2.0 */
+  private static final int MRJ_2_0 = 0;
+
+  /** JVM constant for MRJ 2.1 or later */
+  private static final int MRJ_2_1 = 1;
+
+  /** JVM constant for Java on Mac OS X 10.0 (MRJ 3.0) */
+  private static final int MRJ_3_0 = 3;
+
+  /** JVM constant for MRJ 3.1 */
+  private static final int MRJ_3_1 = 4;
+
+  /** JVM constant for any Windows NT JVM */
+  private static final int WINDOWS_NT = 5;
+
+  /** JVM constant for any Windows 9x JVM */
+  private static final int WINDOWS_9x = 6;
+
+  /** JVM constant for any other platform */
+  private static final int OTHER = -1;
+
+  /**
+   * The file type of the Finder on a Macintosh. Hardcoding "Finder" would keep
+   * non-U.S. English systems from working properly.
+   */
+  private static final String FINDER_TYPE = "FNDR";
+
+  /**
+   * The creator code of the Finder on a Macintosh, which is needed to send
+   * AppleEvents to the application.
+   */
+  private static final String FINDER_CREATOR = "MACS";
+
+  /** The name for the AppleEvent type corresponding to a GetURL event. */
+  private static final String GURL_EVENT = "GURL";
+
+  /**
+   * The first parameter that needs to be passed into Runtime.exec() to open the
+   * default web browser on Windows.
+   */
+  private static final String FIRST_WINDOWS_PARAMETER = "/c";
+
+  /** The second parameter for Runtime.exec() on Windows. */
+  private static final String SECOND_WINDOWS_PARAMETER = "start";
+
+  /**
+   * The third parameter for Runtime.exec() on Windows. This is a "title"
+   * parameter that the command line expects. Setting this parameter allows URLs
+   * containing spaces to work.
+   */
+  private static final String THIRD_WINDOWS_PARAMETER = "\"\"";
+
+  /**
+   * The shell parameters for Netscape that opens a given URL in an already-open
+   * copy of Netscape on many command-line systems.
+   */
+  private static final String NETSCAPE_REMOTE_PARAMETER = "-remote";
+
+  private static final String NETSCAPE_OPEN_PARAMETER_START = "openURL(";
+
+  private static final String NETSCAPE_OPEN_NEW_WINDOW = ", new-window";
+
+  private static final String NETSCAPE_OPEN_PARAMETER_END = ")";
+
+  /**
+   * The message from any exception thrown throughout the initialization
+   * process.
+   */
+  private static String errorMessage;
+
+  /**
+   * An initialization block that determines the operating system and loads the
+   * necessary runtime data.
+   */
+  static
+  {
+    loadedWithoutErrors = true;
+
+    String osName = System.getProperty("os.name");
+
+    if (osName.startsWith("Mac OS"))
+    {
+      String mrjVersion = System.getProperty("mrj.version");
+      String majorMRJVersion;
+      if (mrjVersion == null)
+      {
+        // must be on some later build with mrj support
+        majorMRJVersion = "3.1";
+      }
+      else
+      {
+        majorMRJVersion = mrjVersion.substring(0, 3);
+      }
+
+      try
+      {
+        double version = Double.valueOf(majorMRJVersion).doubleValue();
+
+        if (version == 2)
+        {
+          jvm = MRJ_2_0;
+        }
+        else if ((version >= 2.1) && (version < 3))
+        {
+          // Assume that all 2.x versions of MRJ work the same. MRJ 2.1 actually
+          // works via Runtime.exec() and 2.2 supports that but has an openURL()
+          // method
+          // as well that we currently ignore.
+          jvm = MRJ_2_1;
+        }
+        else if (version == 3.0)
+        {
+          jvm = MRJ_3_0;
+        }
+        else if (version >= 3.1)
+        {
+          // Assume that all 3.1 and later versions of MRJ work the same.
+          jvm = MRJ_3_1;
+        }
+        else
+        {
+          loadedWithoutErrors = false;
+          errorMessage = "Unsupported MRJ version: " + version;
+        }
+      } catch (NumberFormatException nfe)
+      {
+        loadedWithoutErrors = false;
+        errorMessage = "Invalid MRJ version: " + mrjVersion;
+      }
+    }
+    else if (osName.startsWith("Windows"))
+    {
+      if (osName.indexOf("9") != -1)
+      {
+        jvm = WINDOWS_9x;
+      }
+      else
+      {
+        jvm = WINDOWS_NT;
+      }
+    }
+    else
+    {
+      jvm = OTHER;
+    }
+
+    if (loadedWithoutErrors)
+    { // if we haven't hit any errors yet
+      loadedWithoutErrors = loadClasses();
+    }
+  }
+
+  /**
+   * This class should be never be instantiated; this just ensures so.
+   */
+  private BrowserLauncher()
+  {
+  }
+
+  /**
+   * Called by a static initializer to load any classes, fields, and methods
+   * required at runtime to locate the user's web browser.
+   * 
+   * @return <code>true</code> if all intialization succeeded <code>false</code>
+   *         if any portion of the initialization failed
+   */
+  private static boolean loadClasses()
+  {
+    switch (jvm)
+    {
+    case MRJ_2_0:
+
+      try
+      {
+        Class aeTargetClass = Class.forName("com.apple.MacOS.AETarget");
+        Class osUtilsClass = Class.forName("com.apple.MacOS.OSUtils");
+        Class appleEventClass = Class.forName("com.apple.MacOS.AppleEvent");
+        Class aeClass = Class.forName("com.apple.MacOS.ae");
+        aeDescClass = Class.forName("com.apple.MacOS.AEDesc");
+
+        aeTargetConstructor = aeTargetClass
+                .getDeclaredConstructor(new Class[]
+                { int.class });
+        appleEventConstructor = appleEventClass
+                .getDeclaredConstructor(new Class[]
+                { int.class, int.class, aeTargetClass, int.class, int.class });
+        aeDescConstructor = aeDescClass.getDeclaredConstructor(new Class[]
+        { String.class });
+
+        makeOSType = osUtilsClass.getDeclaredMethod("makeOSType",
+                new Class[]
+                { String.class });
+        putParameter = appleEventClass.getDeclaredMethod("putParameter",
+                new Class[]
+                { int.class, aeDescClass });
+        sendNoReply = appleEventClass.getDeclaredMethod("sendNoReply",
+                new Class[]
+                {});
+
+        Field keyDirectObjectField = aeClass
+                .getDeclaredField("keyDirectObject");
+        keyDirectObject = (Integer) keyDirectObjectField.get(null);
+
+        Field autoGenerateReturnIDField = appleEventClass
+                .getDeclaredField("kAutoGenerateReturnID");
+        kAutoGenerateReturnID = (Integer) autoGenerateReturnIDField
+                .get(null);
+
+        Field anyTransactionIDField = appleEventClass
+                .getDeclaredField("kAnyTransactionID");
+        kAnyTransactionID = (Integer) anyTransactionIDField.get(null);
+      } catch (ClassNotFoundException cnfe)
+      {
+        errorMessage = cnfe.getMessage();
+
+        return false;
+      } catch (NoSuchMethodException nsme)
+      {
+        errorMessage = nsme.getMessage();
+
+        return false;
+      } catch (NoSuchFieldException nsfe)
+      {
+        errorMessage = nsfe.getMessage();
+
+        return false;
+      } catch (IllegalAccessException iae)
+      {
+        errorMessage = iae.getMessage();
+
+        return false;
+      }
+
+      break;
+
+    case MRJ_2_1:
+
+      try
+      {
+        mrjFileUtilsClass = Class.forName("com.apple.mrj.MRJFileUtils");
+        mrjOSTypeClass = Class.forName("com.apple.mrj.MRJOSType");
+
+        Field systemFolderField = mrjFileUtilsClass
+                .getDeclaredField("kSystemFolderType");
+        kSystemFolderType = systemFolderField.get(null);
+        findFolder = mrjFileUtilsClass.getDeclaredMethod("findFolder",
+                new Class[]
+                { mrjOSTypeClass });
+        getFileCreator = mrjFileUtilsClass.getDeclaredMethod(
+                "getFileCreator", new Class[]
+                { File.class });
+        getFileType = mrjFileUtilsClass.getDeclaredMethod("getFileType",
+                new Class[]
+                { File.class });
+      } catch (ClassNotFoundException cnfe)
+      {
+        errorMessage = cnfe.getMessage();
+
+        return false;
+      } catch (NoSuchFieldException nsfe)
+      {
+        errorMessage = nsfe.getMessage();
+
+        return false;
+      } catch (NoSuchMethodException nsme)
+      {
+        errorMessage = nsme.getMessage();
+
+        return false;
+      } catch (SecurityException se)
+      {
+        errorMessage = se.getMessage();
+
+        return false;
+      } catch (IllegalAccessException iae)
+      {
+        errorMessage = iae.getMessage();
+
+        return false;
+      }
+
+      break;
+
+    case MRJ_3_0:
+
+      try
+      {
+        Class linker = Class.forName("com.apple.mrj.jdirect.Linker");
+        Constructor constructor = linker.getConstructor(new Class[]
+        { Class.class });
+        linkage = constructor.newInstance(new Object[]
+        { BrowserLauncher.class });
+      } catch (ClassNotFoundException cnfe)
+      {
+        errorMessage = cnfe.getMessage();
+
+        return false;
+      } catch (NoSuchMethodException nsme)
+      {
+        errorMessage = nsme.getMessage();
+
+        return false;
+      } catch (InvocationTargetException ite)
+      {
+        errorMessage = ite.getMessage();
+
+        return false;
+      } catch (InstantiationException ie)
+      {
+        errorMessage = ie.getMessage();
+
+        return false;
+      } catch (IllegalAccessException iae)
+      {
+        errorMessage = iae.getMessage();
+
+        return false;
+      }
+
+      break;
+
+    case MRJ_3_1:
+
+      try
+      {
+        mrjFileUtilsClass = Class.forName("com.apple.mrj.MRJFileUtils");
+        openURL = mrjFileUtilsClass.getDeclaredMethod("openURL",
+                new Class[]
+                { String.class });
+      } catch (ClassNotFoundException cnfe)
+      {
+        errorMessage = cnfe.getMessage();
+
+        return false;
+      } catch (NoSuchMethodException nsme)
+      {
+        errorMessage = nsme.getMessage();
+
+        return false;
+      }
+
+      break;
+
+    default:
+      break;
+    }
+
+    return true;
+  }
+
+  /**
+   * Attempts to locate the default web browser on the local system. s results
+   * so it only locates the browser once for each use of this class per JVM
+   * instance.
+   * 
+   * @return The browser for the system. Note that this may not be what you
+   *         would consider to be a standard web browser; instead, it's the
+   *         application that gets called to open the default web browser. In
+   *         some cases, this will be a non-String object that provides the
+   *         means of calling the default browser.
+   */
+  private static Object locateBrowser()
+  {
+    if (browser != null)
+    {
+      return browser;
+    }
+
+    switch (jvm)
+    {
+    case MRJ_2_0:
+
+      try
+      {
+        Integer finderCreatorCode = (Integer) makeOSType.invoke(null,
+                new Object[]
+                { FINDER_CREATOR });
+        Object aeTarget = aeTargetConstructor.newInstance(new Object[]
+        { finderCreatorCode });
+        Integer gurlType = (Integer) makeOSType.invoke(null, new Object[]
+        { GURL_EVENT });
+        Object appleEvent = appleEventConstructor.newInstance(new Object[]
+        { gurlType, gurlType, aeTarget, kAutoGenerateReturnID,
+            kAnyTransactionID });
+
+        // Don't set browser = appleEvent because then the next time we call
+        // locateBrowser(), we'll get the same AppleEvent, to which we'll
+        // already have
+        // added the relevant parameter. Instead, regenerate the AppleEvent
+        // every time.
+        // There's probably a way to do this better; if any has any ideas,
+        // please let
+        // me know.
+        return appleEvent;
+      } catch (IllegalAccessException iae)
+      {
+        browser = null;
+        errorMessage = iae.getMessage();
+
+        return browser;
+      } catch (InstantiationException ie)
+      {
+        browser = null;
+        errorMessage = ie.getMessage();
+
+        return browser;
+      } catch (InvocationTargetException ite)
+      {
+        browser = null;
+        errorMessage = ite.getMessage();
+
+        return browser;
+      }
+
+    case MRJ_2_1:
+
+      File systemFolder;
+
+      try
+      {
+        systemFolder = (File) findFolder.invoke(null, new Object[]
+        { kSystemFolderType });
+      } catch (IllegalArgumentException iare)
+      {
+        browser = null;
+        errorMessage = iare.getMessage();
+
+        return browser;
+      } catch (IllegalAccessException iae)
+      {
+        browser = null;
+        errorMessage = iae.getMessage();
+
+        return browser;
+      } catch (InvocationTargetException ite)
+      {
+        browser = null;
+        errorMessage = ite.getTargetException().getClass() + ": "
+                + ite.getTargetException().getMessage();
+
+        return browser;
+      }
+
+      String[] systemFolderFiles = systemFolder.list();
+
+      // Avoid a FilenameFilter because that can't be stopped mid-list
+      for (int i = 0; i < systemFolderFiles.length; i++)
+      {
+        try
+        {
+          File file = new File(systemFolder, systemFolderFiles[i]);
+
+          if (!file.isFile())
+          {
+            continue;
+          }
+
+          // We're looking for a file with a creator code of 'MACS' and
+          // a type of 'FNDR'. Only requiring the type results in non-Finder
+          // applications being picked up on certain Mac OS 9 systems,
+          // especially German ones, and sending a GURL event to those
+          // applications results in a logout under Multiple Users.
+          Object fileType = getFileType.invoke(null, new Object[]
+          { file });
+
+          if (FINDER_TYPE.equals(fileType.toString()))
+          {
+            Object fileCreator = getFileCreator.invoke(null, new Object[]
+            { file });
+
+            if (FINDER_CREATOR.equals(fileCreator.toString()))
+            {
+              browser = file.toString(); // Actually the Finder, but that's OK
+
+              return browser;
+            }
+          }
+        } catch (IllegalArgumentException iare)
+        {
+          errorMessage = iare.getMessage();
+
+          return null;
+        } catch (IllegalAccessException iae)
+        {
+          browser = null;
+          errorMessage = iae.getMessage();
+
+          return browser;
+        } catch (InvocationTargetException ite)
+        {
+          browser = null;
+          errorMessage = ite.getTargetException().getClass() + ": "
+                  + ite.getTargetException().getMessage();
+
+          return browser;
+        }
+      }
+
+      browser = null;
+
+      break;
+
+    case MRJ_3_0:
+    case MRJ_3_1:
+      browser = ""; // Return something non-null
+
+      break;
+
+    case WINDOWS_NT:
+      browser = "cmd.exe";
+
+      break;
+
+    case WINDOWS_9x:
+      browser = "command.com";
+
+      break;
+
+    case OTHER:
+    default:
+      browser = jalview.bin.Cache.getDefault("DEFAULT_BROWSER", "firefox");
+
+      break;
+    }
+
+    return browser;
+  }
+
+  /**
+   * used to ensure that browser is up-to-date after a configuration change
+   * (Unix DEFAULT_BROWSER property change).
+   */
+  public static void resetBrowser()
+  {
+    browser = null;
+  }
+
+  /**
+   * Attempts to open the default web browser to the given URL.
+   * 
+   * @param url
+   *          The URL to open
+   * @throws IOException
+   *           If the web browser could not be located or does not run
+   */
+  public static void openURL(String url) throws IOException
+  {
+    if (!loadedWithoutErrors)
+    {
+      throw new IOException("Exception in finding browser: " + errorMessage);
+    }
+
+    Object browser = locateBrowser();
+
+    if (browser == null)
+    {
+      throw new IOException("Unable to locate browser: " + errorMessage);
+    }
+
+    switch (jvm)
+    {
+    case MRJ_2_0:
+
+      Object aeDesc = null;
+
+      try
+      {
+        aeDesc = aeDescConstructor.newInstance(new Object[]
+        { url });
+        putParameter.invoke(browser, new Object[]
+        { keyDirectObject, aeDesc });
+        sendNoReply.invoke(browser, new Object[]
+        {});
+      } catch (InvocationTargetException ite)
+      {
+        throw new IOException(
+                "InvocationTargetException while creating AEDesc: "
+                        + ite.getMessage());
+      } catch (IllegalAccessException iae)
+      {
+        throw new IOException(
+                "IllegalAccessException while building AppleEvent: "
+                        + iae.getMessage());
+      } catch (InstantiationException ie)
+      {
+        throw new IOException(
+                "InstantiationException while creating AEDesc: "
+                        + ie.getMessage());
+      } finally
+      {
+        aeDesc = null; // Encourage it to get disposed if it was created
+        browser = null; // Ditto
+      }
+
+      break;
+
+    case MRJ_2_1:
+      Runtime.getRuntime().exec(new String[]
+      { (String) browser, url });
+
+      break;
+
+    case MRJ_3_0:
+
+      int[] instance = new int[1];
+      int result = ICStart(instance, 0);
+
+      if (result == 0)
+      {
+        int[] selectionStart = new int[]
+        { 0 };
+        byte[] urlBytes = url.getBytes();
+        int[] selectionEnd = new int[]
+        { urlBytes.length };
+        result = ICLaunchURL(instance[0], new byte[]
+        { 0 }, urlBytes, urlBytes.length, selectionStart, selectionEnd);
+
+        if (result == 0)
+        {
+          // Ignore the return value; the URL was launched successfully
+          // regardless of what happens here.
+          ICStop(instance);
+        }
+        else
+        {
+          throw new IOException("Unable to launch URL: " + result);
+        }
+      }
+      else
+      {
+        throw new IOException(
+                "Unable to create an Internet Config instance: " + result);
+      }
+
+      break;
+
+    case MRJ_3_1:
+
+      try
+      {
+        openURL.invoke(null, new Object[]
+        { url });
+      } catch (InvocationTargetException ite)
+      {
+        throw new IOException(
+                "InvocationTargetException while calling openURL: "
+                        + ite.getMessage());
+      } catch (IllegalAccessException iae)
+      {
+        throw new IOException(
+                "IllegalAccessException while calling openURL: "
+                        + iae.getMessage());
+      }
+
+      break;
+
+    case WINDOWS_NT:
+    case WINDOWS_9x:
+
+      // Add quotes around the URL to allow ampersands and other special
+      // characters to work.
+      Process process = Runtime.getRuntime().exec(
+              new String[]
+              { (String) browser, FIRST_WINDOWS_PARAMETER,
+                  SECOND_WINDOWS_PARAMETER, THIRD_WINDOWS_PARAMETER,
+                  '"' + url + '"' });
+
+      // This avoids a memory leak on some versions of Java on Windows.
+      // That's hinted at in
+      // <http://developer.java.sun.com/developer/qow/archive/68/>.
+      try
+      {
+        process.waitFor();
+        process.exitValue();
+      } catch (InterruptedException ie)
+      {
+        throw new IOException(
+                "InterruptedException while launching browser: "
+                        + ie.getMessage());
+      }
+
+      break;
+
+    case OTHER:
+
+      // Assume that we're on Unix and that Netscape (actually Firefox) is
+      // installed
+      // First, attempt to open the URL in a currently running session of
+      // Netscape
+      // JBPNote log debug
+
+      /*
+       * System.out.println("Executing : "+browser+" "+
+       * NETSCAPE_REMOTE_PARAMETER+" "+ NETSCAPE_OPEN_PARAMETER_START + url +
+       * NETSCAPE_OPEN_NEW_WINDOW + NETSCAPE_OPEN_PARAMETER_END);
+       */
+      process = Runtime.getRuntime().exec(
+              new String[]
+              {
+                  (String) browser,
+                  NETSCAPE_REMOTE_PARAMETER,
+
+                  NETSCAPE_OPEN_PARAMETER_START + url
+                          + NETSCAPE_OPEN_NEW_WINDOW
+                          + NETSCAPE_OPEN_PARAMETER_END });
+
+      try
+      {
+        int exitCode = process.waitFor();
+
+        if (exitCode != 0)
+        { // if Netscape was not open
+          Runtime.getRuntime().exec(new String[]
+          { (String) browser, url });
+        }
+      } catch (InterruptedException ie)
+      {
+        throw new IOException(
+                "InterruptedException while launching browser: "
+                        + ie.getMessage());
+      }
+
+      break;
+
+    default:
+
+      // This should never occur, but if it does, we'll try the simplest thing
+      // possible
+      Runtime.getRuntime().exec(new String[]
+      { (String) browser, url });
+
+      break;
+    }
+  }
+
+  /**
+   * Methods required for Mac OS X. The presence of native methods does not
+   * cause any problems on other platforms.
+   */
+  private native static int ICStart(int[] instance, int signature);
+
+  private native static int ICStop(int[] instance);
+
+  private native static int ICLaunchURL(int instance, byte[] hint,
+          byte[] data, int len, int[] selectionStart, int[] selectionEnd);
+}