JAL-1424 removed unused and duplicated message keys
authorgmungoc <g.m.carstairs@dundee.ac.uk>
Wed, 24 Aug 2016 13:31:37 +0000 (14:31 +0100)
committergmungoc <g.m.carstairs@dundee.ac.uk>
Wed, 24 Aug 2016 13:31:37 +0000 (14:31 +0100)
resources/lang/Messages.properties
resources/lang/Messages_es.properties
src/jalview/appletgui/APopupMenu.java
src/jalview/appletgui/FeatureRenderer.java
src/jalview/datamodel/AlignmentView.java
src/jalview/gui/DasSourceBrowser.java
src/jalview/gui/FeatureRenderer.java

index ac665e3..1e91f35 100644 (file)
@@ -38,7 +38,6 @@ action.cancel = Cancel
 action.create = Create
 action.update = Update
 action.delete = Delete
-action.snapshot = Snapshot
 action.clear = Clear
 action.accept = Accept
 action.select_ddbb = --- Select Database ---
@@ -121,7 +120,6 @@ action.save_as_default = Save as default
 action.save_as = Save as...
 action.save = Save
 action.cancel_fetch = Cancel Fetch
-action.save_omit_hidden_columns = Save / Omit Hidden Regions
 action.change_font = Change Font
 action.change_font_tree_panel = Change Font (Tree Panel)
 action.colour = Colour
@@ -137,21 +135,22 @@ action.show_group = Show Group
 action.fetch_db_references = Fetch DB References
 action.view_flanking_regions = Show flanking regions
 label.view_flanking_regions = Show sequence data either side of the subsequences involved in this alignment
-label.str = Str:
-label.seq = Seq:
 label.structures_manager = Structures Manager
 label.nickname = Nickname:
 label.url = URL:
 label.input_file_url = Enter URL or Input File
-label.select_feature = Select feature:
+label.select_feature = Select feature
 label.name = Name
+label.name\: = Name:
 label.name_param = Name: {0}
 label.group = Group
+label.group\: = Group:
 label.group_name = Group Name
 label.group_description = Group Description
 label.edit_group_name_description = Edit Group Name/Description
 label.colour = Colour:
-label.description = Description:
+label.description = Description
+label.description\: = Description:
 label.start = Start:
 label.end = End:
 label.current_parameter_set_name = Current parameter set name:
@@ -240,7 +239,6 @@ label.except_selected_sequences = All except selected sequences
 label.all_but_selected_region = All but Selected Region (Shift+Ctrl+H)
 label.selected_region = Selected Region
 label.all_sequences_columns = All Sequences and Columns
-label.hide_insertions = Hide columns gapped for selection
 label.hide_selected_annotations = Hide selected annotations
 label.show_selected_annotations = Show selected annotations
 label.group_consensus = Group Consensus
@@ -365,7 +363,6 @@ label.example = Example
 label.example_param = Example: {0}
 label.select_file_format_before_saving = You must select a file format before saving!
 label.file_format_not_specified = File format not specified
-label.alignment_contains_hidden_columns = The Alignment contains hidden regions (hidden sequences/columns).\nDo you want to save only the visible alignment?
 label.couldnt_save_file = Couldn't save file: {0}
 label.error_saving_file = Error Saving File
 label.remove_from_default_list = Remove from default list?
@@ -467,7 +464,6 @@ label.no_features_added_to_this_alignment = No Features added to this alignment!
 label.features_can_be_added_from_searches_1 = (Features can be added from searches or
 label.features_can_be_added_from_searches_2 = from Jalview / GFF features files)
 label.calculating_pca= Calculating PCA
-label.reveal_columns = Reveal Columns
 label.jalview_cannot_open_file = Jalview can't open file
 label.jalview_applet = Jalview applet
 label.loading_data = Loading data
@@ -475,7 +471,6 @@ label.memory_stats = Total Free Memory: {0} MB; Max Memory: {1} MB; {2} %
 label.calculating_tree = Calculating tree
 label.state_queueing = queuing
 label.state_running = running
-label.state_complete = complete
 label.state_completed = finished
 label.state_job_cancelled = job cancelled!!
 label.state_job_error = job error!
@@ -501,7 +496,6 @@ label.jmol_help = Jmol Help
 label.chimera_help = Chimera Help
 label.close_viewer = Close Viewer
 label.confirm_close_chimera = This will close Jalview''s connection to {0}.<br>Do you want to close the Chimera window as well?
-label.chimera_help = Chimera Help
 label.all = All
 label.sort_by = Sort alignment by
 label.sort_by_score = Sort by Score
@@ -529,7 +523,6 @@ label.toggle_absolute_relative_display_threshold = Toggle between absolute and r
 label.display_features_same_type_different_label_using_different_colour = Display features of the same type with a different label using a different colour. (e.g. domain features)
 label.select_colour_minimum_value = Select Colour for Minimum Value
 label.select_colour_maximum_value = Select Colour for Maximum Value
-label.open_new_jmol_view_with_all_structures_associated_current_selection_superimpose_using_alignment = Open a new structure viewer with all structures associated with the current selection and superimpose them using the alignment.
 label.open_url_param = Open URL {0}
 label.open_url_seqs_param = Open URL ({0}..) ({1} seqs)
 label.load_pdb_file_associate_with_sequence = Load a PDB file and associate it with sequence {0}
@@ -584,8 +577,8 @@ label.histogram = Histogram
 label.logo = Logo
 label.non_positional_features = List Non-positional Features
 label.database_references = List Database References
-label.share_selection_across_views = Share selection across views
-label.scroll_highlighted_regions = Scroll to highlighted regions
+#label.share_selection_across_views = Share selection across views
+#label.scroll_highlighted_regions = Scroll to highlighted regions
 label.gap_symbol = Gap Symbol
 label.prot_alignment_colour = Protein Alignment Colour
 label.nuc_alignment_colour = Nucleotide Alignment Colour
@@ -668,20 +661,12 @@ label.cut_paste = Cut'n'Paste
 label.adjusting_parameters_for_calculation = Adjusting parameters for existing Calculation
 label.2d_rna_structure_line = 2D RNA {0} (alignment)
 label.2d_rna_sequence_name = 2D RNA - {0}
-label.edit_name_and_description_current_group = Edit name and description of current group.
-label.view_structure_for = View structure for {0}
-label.view_all_structures = View all {0} structures.
-label.view_all_representative_structures = View all {0} representative structures.
-label.open_new_jmol_view_with_all_representative_structures_associated_current_selection_superimpose_using_alignment = Opens a new structure viewer with all representative structures\nassociated with the current selection\nsuperimposed with the current alignment.
-label.associate_structure_with_sequence = Associate Structure with Sequence
+label.edit_name_and_description_current_group = Edit name and description of current group
 label.from_file = From File
 label.enter_pdb_id = Enter PDB Id (or pdbid:chaincode)
-label.discover_pdb_ids = Discover PDB IDs
 label.text_colour = Text Colour
 action.set_text_colour = Text Colour...
 label.structure = Structure
-label.view_structure = View Structure
-label.view_protein_structure = View Protein Structure
 label.show_pdbstruct_dialog = 3D Structure Data...
 label.view_rna_structure = VARNA 2D Structure
 label.clustalx_colours = Clustalx colours
@@ -709,7 +694,6 @@ label.translate_cDNA = Translate as cDNA
 label.reverse = Reverse
 label.reverse_complement = Reverse Complement
 label.linked_view_title = Linked CDS and protein view
-label.align = Align
 label.extract_scores = Extract Scores
 label.get_cross_refs = Get Cross-References
 label.sort_alignment_new_tree = Sort Alignment With New Tree
@@ -721,7 +705,6 @@ label.use_registry = Use Registry
 label.add_local_source = Add Local Source
 label.set_as_default = Set as Default
 label.show_labels = Show labels
-label.background_colour = Background Colour
 action.background_colour = Background Colour...
 label.associate_nodes_with = Associate Nodes With
 label.jalview_pca_calculation = Jalview PCA Calculation
@@ -814,7 +797,6 @@ label.services_at = Services at {0}
 label.rest_client_submit = {0} using {1}
 label.fetch_retrieve_from =Retrieve from {0}</html>
 label.fetch_retrieve_from_all_sources = Retrieve from all {0} sources in {1}<br>First is :{2}<html> 
-#label.feature_settings_click_drag = <html>Click/drag feature types up or down to change render order.<br/>Double click to select columns containing feature in alignment/current selection<br/>Pressing Alt will select columns outside features rather than inside<br/>Pressing Shift to modify current selection (rather than clear current selection)<br/>Press CTRL or Command/Meta to toggle columns in/outside features<br/></html>
 label.feature_settings_click_drag = Drag up or down to change render order.<br/>Double click to select columns containing feature.
 label.transparency_tip = Adjust transparency to 'see through' feature colours.
 label.opt_and_params_further_details = see further details by right-clicking
@@ -830,17 +812,10 @@ label.user_preset = User Preset
 label.service_preset = Service Preset
 label.run_with_preset = Run {0} with preset
 label.view_service_doc_url = <html>View <a href="{0}">{1}</a></html>
-label.submit_sequence = <html>Submit {0} {1} {2} {3} to<br/>{4}</html>
 action.by_title_param = By {0}
-label.alignment = Alignment
-label.secondary_structure_prediction = Secondary Structure Prediction
-label.sequence_database_search = Sequence Database Search
-label.analysis = Analysis
-label.protein_disorder = Protein Disorder 
 label.source_from_db_source = Sources from {0}
 label.from_msname = from {0}
 label.superpose_with = Superpose with
-action.do = Do
 label.scale_label_to_column = Scale Label to Column
 label.add_new_row = Add New Row
 label.edit_label_description = Edit Label/Description
@@ -900,7 +875,6 @@ label.save_vamsas_document_archive = Save Vamsas Document Archive
 label.saving_vamsas_doc = Saving VAMSAS Document to {0}
 label.load_feature_colours = Load Feature Colours
 label.save_feature_colours = Save Feature Colour Scheme
-label.dataset_for = {0} Dataset for {1}
 label.select_startup_file = Select startup file
 label.select_default_browser = Select default web browser
 label.save_tree_as_newick = Save tree as newick file
@@ -929,14 +903,8 @@ error.implementation_error_sortbyfeature = Implementation Error - sortByFeature
 error.not_yet_implemented = Not yet implemented
 error.unknown_type_dna_or_pep = Unknown Type {0} - dna or pep are the only allowed values.
 error.implementation_error_dont_know_thereshold_annotationcolourgradient = Implementation error: don't know about threshold setting for current AnnotationColourGradient.
-error.implementation_error_embeddedpopup_not_null = Implementation error - embeddedPopup must be non-null
-error.invalid_colour_for_mycheckbox = Invalid color for MyCheckBox
-error.implementation_error_unrecognised_render_object_for_features_type = Implementation Error: Unrecognised render object {0} for features of type {1}
-error.implementation_error_unsupported_feature_colour_object = Implementation error: Unsupported feature colour object.
 error.invalid_separator_parameter = Invalid separator parameter - must be non-zero length
 error.alignment_cigararray_not_implemented = Alignment(CigarArray) not yet implemented
-error.weak_sequencei_equivalence_not_yet_implemented = Weak sequenceI equivalence not yet implemented.
-error.implementation_error_can_only_make_alignmnet_from_cigararray = Implementation Error - can only make an alignment view from a CigarArray of sequences.
 error.empty_view_cannot_be_updated = empty view cannot be updated.
 error.mismatch_between_number_of_sequences_in_block = Mismatch between number of sequences in block {0} ({1}) and the original view ({2})
 error.padding_not_yet_implemented = Padding not yet implemented
@@ -958,12 +926,10 @@ error.not_yet_implemented_cigar_object_from_cigar_string = NOT YET Implemented:
 error.implementation_bug_cigar_operation = Implementation Bug. Cigar Operation {0} {1} not one of {2}, {3}, or {4}.
 error.implementation_error_for_new_cigar = Implementation error for new Cigar(SequenceI)
 error.implementation_error_cigar_seq_no_operations = Implementation error: {0}th sequence Cigar has no operations.
-error.implementation_error_jmol_getting_data = Implementation error - Jmol seems to be still working on getting its data - report at http://issues.jalview.org/browse/JAL-1016
 error.implementation_error_no_pdbentry_from_index = Implementation error - no corresponding pdbentry (for index {0}) to add sequences mappings to
 error.jmol_version_not_compatible_with_jalview_version = Jmol version {0} is not compatible with this version of Jalview. Report this problem at issues.jalview.org
 error.not_implemented_remove = Remove: Not implemented
 error.not_implemented_clone = Clone: Not implemented
-error.implementation_error_chimera_getting_data = Implementation error - Chimera seems to be still working on getting its data - report at http://issues.jalview.org/browse/JAL-1016
 error.call_setprogressbar_before_registering_handler = call setProgressBar before registering the progress bar's handler.
 label.cancelled_params = Cancelled {0}
 error.implementation_error_cannot_show_view_alignment_frame = Implementation error: cannot show a view from another alignment in an AlignFrame.
@@ -986,7 +952,6 @@ error.setstatus_called_non_existent_job_pane = setStatus called for non-existent
 error.implementation_error_cannot_find_marshaller_for_param_set =Implementation error: Can't find a marshaller for the parameter set
 error.implementation_error_old_jalview_object_not_bound =IMPLEMENTATION ERROR: old jalview object is not bound ! ({0})
 error.implementation_error_vamsas_doc_class_should_bind_to_type = Implementation Error: Vamsas Document Class {0} should bind to a {1} (found a {2})
-error.implementation_error_jalview_class_should_bind_to_type = Implementation Error: Jalview Class {0} should bind to a {1} (found a {2})
 error.invalid_vamsas_rangetype_cannot_resolve_lists = Invalid vamsas RangeType - cannot resolve both lists of Pos and Seg from choice!
 error.implementation_error_maplist_is_null = Implementation error. MapList is null for initMapType.
 error.implementation_error_cannot_have_null_alignment = Implementation error: Cannot have null alignment property key
@@ -1033,7 +998,6 @@ label.toggled = Toggled
 label.marked = Marked
 label.containing = containing
 label.not_containing = not containing
-label.not = not
 label.no_feature_of_type_found = No features of type {0} found.
 label.submission_params = Submission {0}
 label.empty_alignment_job = Empty Alignment Job
@@ -1063,7 +1027,6 @@ exception.mismatched_unseen_closing_char = Mismatched (unseen) closing character
 exception.mismatched_closing_char = Mismatched closing character {0}
 exception.mismatched_opening_char = Mismatched opening character {0} at {1}
 exception.invalid_datasource_couldnt_obtain_reader = Invalid datasource. Could not obtain Reader
-exception.index_value_not_in_range = {0}: Index value {1} not in range [0..{2}]
 exception.unterminated_cigar_string = Unterminated cigar string
 exception.unexpected_operation_cigar_string_pos = Unexpected operation {0} in cigar string (position {1} in {2}
 exception.couldnt_parse_responde_from_annotated3d_server = Couldn't parse response from Annotate3d server
@@ -1091,7 +1054,6 @@ exception.ranml_problem_parsing_data = Problem parsing data as RNAML ({0})
 exception.pfam_no_sequences_found = No sequences found (PFAM input)
 exception.stockholm_invalid_format = This file is not in valid STOCKHOLM format: First line does not contain '# STOCKHOLM'
 exception.couldnt_parse_sequence_line = Could not parse sequence line: {0}
-exception.error_parsing_line = Error parsing {0}
 exception.unknown_annotation_detected = Unknown annotation detected: {0} {1}
 exception.couldnt_store_sequence_mappings = Couldn't store sequence mappings for {0}
 exception.matrix_too_many_iteration = Too many iterations in {0} (max is {1})
@@ -1099,7 +1061,6 @@ exception.browser_not_found = Exception in finding browser: {0}
 exception.browser_unable_to_locate = Unable to locate browser: {0}
 exception.invocation_target_exception_creating_aedesc = InvocationTargetException while creating AEDesc: {0}
 exception.illegal_access_building_apple_evt= IllegalAccessException while building AppleEvent: {0}
-exception.instantiation_creating_aedesc = InstantiationException while creating AEDesc: {0}
 exception.unable_to_launch_url = Unable to launch URL: {0}
 exception.unable_to_create_internet_config = Unable to create an Internet Config instance: {0}
 exception.invocation_target_calling_url = InvocationTargetException while calling openURL: {0}
@@ -1108,8 +1069,6 @@ exception.interrupted_launching_browser = InterruptedException while launching b
 exception.das_source_doesnt_support_sequence_command = Source {0} does not support the sequence command.
 exception.invalid_das_source = Invalid das source: {0}
 exception.ebiembl_retrieval_failed_on = EBI EMBL XML retrieval failed on {0}:{1}
-label.no_embl_record_found = # No EMBL record retrieved for {0}:{1}
-label.embl_successfully_parsed = # Successfully parsed the {0} queries into an Alignment
 exception.no_pdb_records_for_chain = No PDB Records for {0} chain {1}
 exception.unexpected_handling_rnaml_translation_for_pdb = Unexpected exception when handling RNAML translation of PDB data
 exception.couldnt_recover_sequence_properties_for_alignment = Couldn't recover sequence properties for alignment
@@ -1222,28 +1181,23 @@ label.no_colour_selection_in_scheme = Please make a colour selection before appl
 label.no_colour_selection_warn = Error saving colour scheme
 label.open_split_window? = Would you like to open as a split window, with cDNA and protein linked?
 label.open_split_window = Open split window
-label.no_mappings = No mappings found
 action.no = No
 action.yes = Yes
 label.for = for
 label.select_by_annotation = Select/Hide Columns by Annotation
 action.select_by_annotation = Select/Hide Columns by Annotation...
 label.threshold_filter =  Threshold Filter
-action.hide = Hide
-action.select = Select
 label.alpha_helix = Alpha Helix
 label.beta_strand = Beta Strand
 label.turn = Turn
 label.select_all = Select All
 label.structures_filter = Structures Filter
 label.search_filter = Search Filter
-label.description = Description
 label.include_description= Include Description
 action.back = Back
 label.hide_insertions = Hide Insertions
 label.mark_as_representative = Mark as representative
 label.open_jabaws_web_page = Open JABAWS web page
-label.opens_the_jabaws_server_homepage = Opens the JABAWS server's homepage in web browser
 label.pdb_sequence_fetcher = PDB Sequence Fetcher
 label.result = result
 label.results = results
@@ -1311,6 +1265,5 @@ status.obtaining_mapping_with_sifts = Obtaining mapping with SIFTS
 status.obtaining_mapping_with_nw_alignment = Obtaining mapping with NW alignment
 status.exporting_alignment_as_x_file = Exporting alignment as {0} file
 label.column = Column
-label.sequence = Sequence
 label.cant_map_cds = Unable to map CDS to protein\nCDS missing or incomplete
 label.operation_failed = Operation failed
index 92d4d78..4738440 100644 (file)
@@ -38,7 +38,6 @@ action.cancel = Cancelar
 action.create = Crear
 action.update = Actualizar
 action.delete = Borrar
-action.snapshot = Imagen
 action.clear = Limpiar
 action.accept = Aceptar
 action.select_ddbb = --- Seleccionar base de datos ---
@@ -118,7 +117,6 @@ action.save_as_default = Guardar como por defecto
 action.save_as = Guardar como
 action.save = Guardar
 action.cancel_fetch = Cancelar búsqueda
-action.save_omit_hidden_columns = Guardar / Omitir las columnas ocultas
 action.change_font = Cambiar Fuente
 action.change_font_tree_panel = Cambiar fuente (panel del árbol)
 action.colour = Color
@@ -134,21 +132,22 @@ action.show_group = Mostrar grupo
 action.fetch_db_references = Recuperar referencias a base de datos
 action.view_flanking_regions = Mostrar flancos
 label.view_flanking_regions = Mostrar los datos de la secuencia a ambos lados de las subsecuencias implicadas en este alineamiento
-label.str = Str: 
-label.seq = Seq: 
 label.structures_manager = Administrar estructuras
 label.nickname = Sobrenombre:
 label.url = URL: 
 label.input_file_url = Introducir URL en el fichero de entrada
-label.select_feature = Seleccionar función:
-label.name = Nombre:
+label.select_feature = Seleccionar característica
+label.name = Nombre
+label.name\: = Nombre:
 label.name_param = Nombre: {0}
-label.group = Grupo:
+label.group = Grupo
+label.group\: = Grupo:
 label.group_name = Nombre del grupo
 label.group_description = Descripción del grupo
 label.edit_group_name_description = Editar nombre/descripción del grupo
 label.colour = Color:
-label.description = Descripción:
+label.description = Descripción
+label.description\: = Descripción:
 label.start = Comenzar:
 label.end = Terminar:
 label.current_parameter_set_name = Nombre actual del conjunto de parámetros:
@@ -217,7 +216,6 @@ label.documentation = Documentaci
 label.about = Acerca de...
 label.show_sequence_limits = Mostrar los límites de la secuencia
 label.feature_settings = Ajustar funciones...
-label.sequence_features = Funciones de la secuencia
 label.all_columns = Todas las columnas
 label.all_sequences = Todas las secuencias
 label.selected_columns = Columnas seleccionadas
@@ -315,8 +313,6 @@ label.blog_item_published_on_date = {0} {1}
 label.select_das_service_from_table = Seleccionar servicio DAS de la tabla para leer una descripción completa aquí.
 label.session_update = Actualizar sesión
 label.new_vamsas_session = Nueva sesión Vamsas
-label.load_vamsas_session = Cargar sesión Vamsas
-label.save_vamsas_session = Guardar sesión Vamsas
 action.save_vamsas_session = Guardar Sesión Vamsas
 label.select_vamsas_session_opened_as_new_vamsas_session= Selecciones una sesión vamsas para abrirla como una nueva sesión.
 label.open_saved_vamsas_session = Abrir una sesión VAMSAS guardada
@@ -336,7 +332,6 @@ label.example = Ejemplo
 label.example_param = Ejemplo: {0}
 label.select_file_format_before_saving = Debe seleccionar un formato de fichero antes de guardar!
 label.file_format_not_specified = Formato de fichero no especificado
-label.alignment_contains_hidden_columns = El alineamiento contiene columnas ocultas.\nQuieres guardar s\u00F3lo el alineamiento visible?
 label.couldnt_save_file = No se pudo guardar el fichero: {0}
 label.error_saving_file = Error guardando el fichero
 label.remove_from_default_list = eliminar de la lista de defectuosos?
@@ -436,7 +431,6 @@ label.no_features_added_to_this_alignment = No hay funciones asociadas a este al
 label.features_can_be_added_from_searches_1 = (Las funciones pueden ser añadidas de búsquedas o
 label.features_can_be_added_from_searches_2 = de ficheros de funciones Jalview / GFF)
 label.calculating_pca= Calculando PCA
-label.reveal_columns = Mostrar Columnas
 label.jalview_cannot_open_file = Jalview no puede abrir el fichero
 label.jalview_applet = Aplicación Jalview  
 label.loading_data = Cargando datos
@@ -444,7 +438,6 @@ label.memory_stats = Memoria libre total: {0} MB; Memoria m
 label.calculating_tree = Calculando árbol
 label.state_queueing = En cola 
 label.state_running = Procesando
-label.state_complete = Completar
 label.state_completed = Finalizado
 label.state_job_cancelled = ¡Trabajo cancelado!
 label.state_job_error = Error del trabajo!
@@ -458,8 +451,6 @@ label.load_associated_tree = Cargar 
 label.load_features_annotations = Cargar características/anotaciones ...
 label.export_features = Exportar características...
 label.export_annotations = Exportar anotaciones ...
-label.jalview_copy = Copiar (sólo Jalview)
-label.jalview_cut = Cortar (sólo Jalview)
 label.to_upper_case = Pasar a mayúsculas
 label.to_lower_case = Pasar a minúsculas
 label.toggle_case = Alternar mayúsculas y minúsculas
@@ -494,7 +485,6 @@ label.toggle_absolute_relative_display_threshold = Cambiar entre mostrar el umbr
 label.display_features_same_type_different_label_using_different_colour = Mostrar las características del mismo tipo con una etiqueta diferente y empleando un color distinto (p.e. características del dominio)
 label.select_colour_minimum_value = Seleccionar el color para el valor mínimo
 label.select_colour_maximum_value = Seleccionar el color para el valor máximo
-label.open_new_jmol_view_with_all_structures_associated_current_selection_superimpose_using_alignment = Abrir una nueva vista Jmol con todas las estructuras asociadas con la selección acxtual y superponer las utilizando el alineamiento.
 label.open_url_param = Abrir URL {0}
 label.open_url_seqs_param = Abrir URL ({0}..) ({1} secuencias)
 label.load_pdb_file_associate_with_sequence = Cargar un fichero PDB y asociarlo con la secuencia {0}
@@ -545,10 +535,9 @@ label.histogram = Histograma
 label.logo = Logo
 label.non_positional_features = Características no posicionales
 label.database_references = Referencias a base de datos
-label.share_selection_across_views = Compartir la selección en todas las vistas
-label.scroll_highlighted_regions = Desplazarse hasta las regiones resaltadas
+#label.share_selection_across_views = Compartir la selección en todas las vistas
+#label.scroll_highlighted_regions = Desplazarse hasta las regiones resaltadas
 label.gap_symbol = Símbolo del hueco
-label.alignment_colour = Color del alineamiento
 label.address = Dirección
 label.port = Puerto
 label.default_browser_unix = Navegador por defecto (Unix)
@@ -627,18 +616,11 @@ label.cut_paste = Cortar y pegar
 label.adjusting_parameters_for_calculation = Ajustar los parámetros para el cálculo existente
 label.2d_rna_structure_line = 2D RNA {0}
 label.2d_rna_sequence_name = 2D RNA - {0}
-label.edit_name_and_description_current_group = Editar el nombre y la descripción del grupo actual.
-label.view_structure_for = Visualizar la estructura para {0}
-label.view_all_structures = Visualizar todas las {0} estructuras.
-label.view_all_representative_structures = Visualizar todas las {0} estructuras representativas.
-label.open_new_jmol_view_with_all_representative_structures_associated_current_selection_superimpose_using_alignment = Abrir una nueva vista de Jmol con todas las estructuras representativas\nasociadas con la selecci\u00F3n actual\nsuperpuesta con el alineamiento actual.
-label.associate_structure_with_sequence = Asociar estructura con la secuencia
+label.edit_name_and_description_current_group = Editar el nombre y la descripción del grupo actual
 label.from_file = desde fichero
 label.enter_pdb_id = Introducir PDB Id
-label.discover_pdb_ids = Buscar PDB ids
 label.text_colour = Color del texto
 label.structure = Estructura
-label.view_structure = Visualizar estructura
 label.clustalx_colours = Colores de Clustalx
 label.above_identity_percentage = Sobre % identidad
 label.create_sequence_details_report_annotation_for = Anotación para {0}
@@ -671,7 +653,6 @@ label.use_registry = Utilizar el registro
 label.add_local_source = Añadir fuente local
 label.set_as_default = Establecer por defecto
 label.show_labels = Mostrar etiquetas
-label.background_colour = Color de fondo
 label.associate_nodes_with = Asociar nodos con
 label.jalview_pca_calculation = Cálculo del PCA por Jalview
 label.link_name = Nombre del enalce
@@ -764,17 +745,10 @@ label.user_preset = Preselecci
 label.service_preset = Preselección del servicio
 label.run_with_preset = Ejecutar {0} con preselección
 label.view_service_doc_url = Visualizar <a href="{0}">{1}</a></html>
-label.submit_sequence = Enviar {0} {1} {2} {3} a<br/>{4}</html>
 action.by_title_param = por {0}
-label.alignment = Alineamiento
-label.secondary_structure_prediction = Predicción de la estructura secundaria
-label.sequence_database_search = Búsqueda en base de datos de secuencias
-label.analysis = Análisis
-label.protein_disorder = Desorden en la proteína 
 label.source_from_db_source = Fuentes de {0}
 label.from_msname = de {0}
 label.superpose_with = Superponer con...
-action.do = Hacer
 label.scale_label_to_column = Ajustar la etiqueta a la columna
 label.add_new_row = Añadir nuevo fila
 label.edit_label_description = Editar etiqueta/descripción
@@ -834,7 +808,6 @@ label.save_vamsas_document_archive = Guardar el archivo de documento Vamsas
 label.saving_vamsas_doc = Guardando el documento VAMSAS en {0}
 label.load_feature_colours = Cargar colores de características
 label.save_feature_colours = Guardar esquema cromático de características
-label.dataset_for = {0} conjunto de datos para {1}
 label.select_startup_file = Seleccionar fichero de arranque
 label.select_default_browser = Seleccionar navegador web por defecto
 label.save_tree_as_newick = Guardar árbol como fichero newick
@@ -863,14 +836,8 @@ error.implementation_error_sortbyfeature = Error de implementaci
 error.not_yet_implemented = No se ha implementado todavía
 error.unknown_type_dna_or_pep = Tipo desconocido {0} - dna o pep son los únicos valores permitidos
 error.implementation_error_dont_know_thereshold_annotationcolourgradient = Error de implementación: no se conoce el valor umbral para el AnnotationColourGradient actual.
-error.implementation_error_embeddedpopup_not_null = Error de implementación - embeddedPopup debe ser no nulo.
-error.invalid_colour_for_mycheckbox = Color no válido para MyCheckBox
-error.implementation_error_unrecognised_render_object_for_features_type = Error de implementación: no se reconoce el objeto de representación {0} para las características de tipo {1}
-error.implementation_error_unsupported_feature_colour_object = Error de implementación: objeto de color de características no soportado.
 error.invalid_separator_parameter = Separador de parámetros no válido - debe tener longitud mayor que cero
 error.alignment_cigararray_not_implemented = Alignment(CigarArray) no se ha implementado todavía
-error.weak_sequencei_equivalence_not_yet_implemented = Equivalencia débil sequenceI no se ha implementado todavía.
-error.implementation_error_can_only_make_alignmnet_from_cigararray = Error de implementación - sólo se puede construir un vista de alineamiento a partir de una CigarArray de secuencias.
 error.empty_view_cannot_be_updated = una vista vacía no se puede actualizar.
 error.mismatch_between_number_of_sequences_in_block = No hay coincidencia entre el número de secuencias en el bloque {0} ({1}) y la vista original ({2})
 error.padding_not_yet_implemented = El relleno no se ha implementado todavía
@@ -892,12 +859,10 @@ error.not_yet_implemented_cigar_object_from_cigar_string = No implementado todav
 error.implementation_bug_cigar_operation = Bug de implementación. La operación Cigar {0} {1} no es ni {2}, ni {3} ni {4}.
 error.implementation_error_for_new_cigar = Error de implementación en new Cigar(SequenceI)
 error.implementation_error_cigar_seq_no_operations = Error de implementación: la {0}a secuencia Cigar no tiene operaciones.
-error.implementation_error_jmol_getting_data = Error de implementación - Jmol parece estar todavía intentando recuperar sus datos - informe de ello en http://issues.jalview.org/browse/JAL-1016
 error.implementation_error_no_pdbentry_from_index = Error de implementación - no existe la correspondiente entrada pdb (para el índice {0}) para añadir el mapeo de secuencias a
 error.jmol_version_not_compatible_with_jalview_version = La versión {0} de Jmol no es compatible con esta versión de Jalview. Informe de este problema en http://issues.jalview.org
 error.not_implemented_remove = Borrar: no implementado
 error.not_implemented_clone = Clonar: no implementado
-error.implementation_error_chimera_getting_data = Error de implementación - Chimera parece estar todavía intentando recuperar sus datos - informe de ello en http://issues.jalview.org/browse/JAL-1016
 error.call_setprogressbar_before_registering_handler = llamada a setProgressBar antes de registrar el manejador de la barra de estado
 label.cancelled_params = {0} cancelado
 error.implementation_error_cannot_show_view_alignment_frame = Error de implementación: no es posible mostrar una vista de otro alineamiento en un AlignFrame.
@@ -920,7 +885,6 @@ error.setstatus_called_non_existent_job_pane = se lllamado a setStatus para el p
 error.implementation_error_cannot_find_marshaller_for_param_set =Error de implementación: no puede encontrar un marshaller para el conjunto de parámetros
 error.implementation_error_old_jalview_object_not_bound =Error de implementación: ¡el objeto Jalview antiguo no está enlazado! ({0})
 error.implementation_error_vamsas_doc_class_should_bind_to_type = Error de implementación: la clase de documento VAMSAS {0} debe enlazar a {1} (pero se ha encontrado que lo está a {2})
-error.implementation_error_jalview_class_should_bind_to_type = Error de implementación: la clase Jalview {0} debe enlazar a {1} (pero se ha encontrado que lo está a {2})
 error.invalid_vamsas_rangetype_cannot_resolve_lists = RangeType VAMSAS no válido - ¡no es posible resolver ambas listas de Pos y Seg con los valores elegidos!
 error.implementation_error_maplist_is_null = Error de implementación. MapList es nulo en initMapType.
 error.implementation_error_cannot_have_null_alignment = Error de implementación: no es posible tener una clave nula en el alineamiento
@@ -967,7 +931,6 @@ label.toggled = Invertida
 label.marked = Marcada
 label.containing = conteniendo
 label.not_containing = no conteniendo
-label.not = no
 label.no_feature_of_type_found = No se han encontrado características del tipo {0}.
 label.submission_params = Envío {0}
 label.empty_alignment_job = Trabajo de alineamiento vacío
@@ -997,7 +960,6 @@ exception.mismatched_unseen_closing_char = Discordancia (no vista) en el car
 exception.mismatched_closing_char = Carácter de cierre discordante {0}
 exception.mismatched_opening_char = Carácter de apertura discordante {0} en {1}
 exception.invalid_datasource_couldnt_obtain_reader = Fuente de datos no válida. No es posible obtener el Reader
-exception.index_value_not_in_range = {0}: el valor del índice {1} en se encuentra en el rango [0..{2}]
 exception.unterminated_cigar_string = Cadena cigar sin terminar
 exception.unexpected_operation_cigar_string_pos = Operación no esperada {0} en una cadena cigar (posición {1} en {2})
 exception.couldnt_parse_responde_from_annotated3d_server = No es posible parsear la respuesta procedente del servidor Annotate3d 
@@ -1025,7 +987,6 @@ exception.ranml_problem_parsing_data = Problema parseando los datos como RNAML (
 exception.pfam_no_sequences_found = No se han encontrado secuencias (entrada PFAM)
 exception.stockholm_invalid_format = Este fichero no es tiene un formato STOCKHOLM válido: la primera línea no contiene '# STOCKHOLM'
 exception.couldnt_parse_sequence_line = No es posible parse la línea de secuencia: {0}
-exception.error_parsing_line = Error parseando {0}
 exception.unknown_annotation_detected = Anotación desconocida detectada: {0} {1}
 exception.couldnt_store_sequence_mappings = No es posible almacenar los mapeos de secuencia para {0}
 exception.matrix_too_many_iteration = Demasiadas iteraciones en {0} (el máximo es {1})
@@ -1033,7 +994,6 @@ exception.browser_not_found = Excepci
 exception.browser_unable_to_locate = Imposible encontrar el navegador: {0}
 exception.invocation_target_exception_creating_aedesc = InvocationTargetException mientras se creaba AEDesc: {0}
 exception.illegal_access_building_apple_evt= IllegalAccessException mientras se construía AppleEvent: {0}
-exception.instantiation_creating_aedesc = InstantiationException mientras se creaba AEDesc: {0}
 exception.unable_to_launch_url = Imposible lanzar la URL: {0}
 exception.unable_to_create_internet_config = Imposible crear una instancia de configuración de Internet: {0}
 exception.invocation_target_calling_url = InvocationTargetException mientras se invocaba openURL: {0}
@@ -1042,8 +1002,6 @@ exception.interrupted_launching_browser = InterruptedException mientras se lanza
 exception.das_source_doesnt_support_sequence_command = La fuente {0} no soporta el comando sequence.
 exception.invalid_das_source = Fuente DAS no válida: {0}
 exception.ebiembl_retrieval_failed_on = La recuperación de datos EBI EMBL XML ha fallado en {0}:{1}
-label.no_embl_record_found = # No se ha recuperado ningún registro EMBL de {0}:{1}
-label.embl_successfully_parsed = # Se han parseado con éxito las consultas {0} en un alineamiento
 exception.no_pdb_records_for_chain = No se han encontrado registros {0} para la cadena {1}
 exception.unexpected_handling_rnaml_translation_for_pdb = Excepcion inesperada cuando se traducían a RNAML los datos PDB
 exception.couldnt_recover_sequence_properties_for_alignment = No es posible recuperar las propiedades de la secuencia para el alineamiento
@@ -1146,7 +1104,6 @@ action.feature_settings=Ajustes de caracter
 info.invalid_msa_notenough=No suficientes datos de sequencia para alinear
 label.result=resultado
 label.results=resultados
-label.no_mappings=No hay mapeados encontrados
 label.struct_from_pdb=Procesar la estructura secundaria PDB
 label.hide_selected_annotations=Ocultar anotaciones seleccionados
 info.select_annotation_row=Seleccionar Fila de Anotaciones
@@ -1170,7 +1127,6 @@ action.no=No
 action.yes=Sí
 label.export_settings=Exportar Ajustes
 label.linked_view_title=Vista vinculada de cDNA y proteína
-label.view_protein_structure=Ver Estructura Proteica
 label.couldnt_read_data=No se pudo leer los datos
 status.opening_file=abriendo fichero
 label.except_selected_sequences=Todo excepto secuencias seleccionadas
@@ -1215,7 +1171,6 @@ action.select_by_annotation=Seleccionar/Ocultar Columnas por Anotaci
 action.export_features=Exportar Características
 error.invalid_regex=Expresión regular inválida
 label.autoadd_temp=Añadir anotación factor de temperatura al alineamiento
-tooltip.rnalifold_settings=Modificar la configuración de la predicción RNAAlifold. Úselo para ocultar o mostrar resultados del cálculo de RNA, o cambiar parámetros de el plegado de RNA.
 label.chimera_path_tip=Jalview intentará primero las rutas introducidas aquí, Y si no las rutas usuales de instalación
 label.structure_chooser=Selector de Estructuras
 label.structure_chooser_manual_association=Selector de Estructuras - asociación manual
@@ -1231,9 +1186,7 @@ label.colour_with_chimera=Colorear con Chimera
 label.show_pdbstruct_dialog=Datos de Estructura 3D...
 label.hide_all=Ocultar todos
 label.invert=Invertir
-label.pdb_sequence_getcher=Buscador de Secuencias PDB
 tooltip.aacon_settings=Cambiar ajustes para cálculos AACon
-label.align=Alinear
 label.mark_as_representative=Marcar como representativa
 label.include_description=Incluir Descripción
 label.for=para
@@ -1249,15 +1202,13 @@ info.associate_wit_sequence=Asociar con secuencia
 label.protein=Proteína
 warn.oneseq_msainput_selection=La selección actual sólo contiene una única secuencia. ¿Quieres enviar todas las secuencias para la alineación en su lugar?
 label.use_rnaview=Usar RNAView para estructura secondaria
-label.opens_the_jabaws_server_homepage=Abre la página de inicio del servidor JABAWS en navegador
 label.search_all=Introducir uno o más valores de búsqueda separados por punto y coma ";" (Nota: buscará en toda la base de datos PDB)
 label.confirm_close_chimera=Cerrará la conexión de Jalview a {0}.<br>¿Quieres cerrar la ventana Chimera también?
 tooltip.rnalifold_calculations=Se calcularán predicciones de estructura secondaria de RNA para el alineaminento, y se actualizarán si se efectuan cambios
-Calcular predicciónes de estructura secondaria para el alineamiento
+tooltip.rnalifold_settings=Modificar la configuración de la predicción RNAAlifold. Úselo para ocultar o mostrar resultados del cálculo de RNA, o cambiar parámetros de el plegado de RNA.
 label.show_selected_annotations=Mostrar anotaciones seleccionadas
 status.colouring_chimera=Coloreando Chimera
 label.configure_displayed_columns=Configurar Columnas Mostradas
-exception.pdb_server_error=Error desde el servidor PDB
 exception.resource_not_be_found=El recurso solicitado no se ha encontrado
 label.aacon_calculations=cálculos AACon
 label.pdb_web-service_error=Error de servicio web PDB
@@ -1266,10 +1217,8 @@ label.chimera_path=Ruta de acceso a programa Chimera
 warn.delete_all=<html>Borrar todas las secuencias cerrará la ventana del alineamiento.<br>Confirmar o Cancelar.
 label.select_all=Seleccionar Todos
 label.alpha_helix=Hélice Alfa
-label.sequence_details_for=Detalles de secuencia para {0}
 label.chimera_help=Ayuda para Chimera
 label.find_tip=Buscar alineamiento, selección o IDs de secuencia para una subsecuencia (sin huecos)
-exception.pdb_server_unreachable=Jalview no puede conectar con el servidor PDBE Solr.\nPor favor, asegúrese de que está conectado a Internet y vuelva a intentarlo.
 label.structure_viewer=Visualizador de estructura for defecto
 label.embbed_biojson=Incrustar BioJSON al exportar HTML
 label.transparency_tip=Ajustar la transparencia a "ver a través" los colores de las características.
@@ -1282,7 +1231,6 @@ info.select_filter_option=Escoger Opci
 info.invalid_msa_input_mininfo=Necesita por lo menos dos secuencias con al menos 3 residuos cada una, sin regiones ocultas entre ellas.
 label.chimera_missing=Visualizador de estructura Chimera no encontrado.<br/>Por favor, introduzca la ruta de Chimera,<br/>o descargar e instalar la UCSF Chimera.
 label.save_as_biojs_html=Guardar como HTML BioJs
-exception.pdb_rest_service_no_longer_available=Servicios Rest PDB ya no están disponibles!
 exception.fts_server_unreachable=Jalview no puede conectar con el servidor {0}. \nPor favor asegúrese de que está conectado a Internet y vuelva a intentarlo.
 exception.outofmemory_loading_mmcif_file=Sin memoria al cargar el fichero mmCIF
 label.hide_columns_not_containing=Ocultar las columnas que no contengan
@@ -1318,6 +1266,5 @@ status.fetching_dbrefs_for_sequences_without_valid_refs=Buscando referencias par
 status.obtaining_mapping_with_nw_alignment=Obteniendo mapeo por alineamiento Needleman y Wunsch
 status.exporting_alignment_as_x_file = Exportando alineamiento como fichero tipo {0}
 label.column = Columna
-label.sequence = Secuencia
 label.cant_map_cds = No se pudo mapear CDS a proteína\nDatos CDS faltantes o incompletos
 label.operation_failed = Operación fallada
index b6cc7c0..ec7cd25 100644 (file)
@@ -964,7 +964,7 @@ public class APopupMenu extends java.awt.PopupMenu implements
             "label.represent_group_with", new Object[] { "" }));
     revealAll.setLabel(MessageManager.getString("action.reveal_all"));
     revealSeq.setLabel(MessageManager.getString("action.reveal_sequences"));
-    menu1.setLabel(MessageManager.getString("label.group") + ":");
+    menu1.setLabel(MessageManager.getString("label.group:"));
     add(groupMenu);
     this.add(seqMenu);
     this.add(hideSeqs);
index 81d8ef5..82736d7 100644 (file)
@@ -251,23 +251,24 @@ public class FeatureRenderer extends
 
     tmp = new Panel();
     panel.add(tmp);
-    tmp.add(new Label("Name: ", Label.RIGHT));
+    tmp.add(new Label(MessageManager.getString("label.name:"), Label.RIGHT));
     tmp.add(name);
 
     tmp = new Panel();
     panel.add(tmp);
-    tmp.add(new Label("Group: ", Label.RIGHT));
+    tmp.add(new Label(MessageManager.getString("label.group:"), Label.RIGHT));
     tmp.add(source);
 
     tmp = new Panel();
     panel.add(tmp);
-    tmp.add(new Label("Colour: ", Label.RIGHT));
+    tmp.add(new Label(MessageManager.getString("label.colour"), Label.RIGHT));
     tmp.add(colourPanel);
 
     bigPanel.add(panel, BorderLayout.NORTH);
 
     panel = new Panel();
-    panel.add(new Label("Description: ", Label.RIGHT));
+    panel.add(new Label(MessageManager.getString("label.description:"),
+            Label.RIGHT));
     panel.add(new ScrollPane().add(description));
 
     if (!newFeatures)
@@ -275,9 +276,11 @@ public class FeatureRenderer extends
       bigPanel.add(panel, BorderLayout.SOUTH);
 
       panel = new Panel();
-      panel.add(new Label(" Start:", Label.RIGHT));
+      panel.add(new Label(MessageManager.getString("label.start"),
+              Label.RIGHT));
       panel.add(start);
-      panel.add(new Label("  End:", Label.RIGHT));
+      panel.add(new Label(MessageManager.getString("label.end"),
+              Label.RIGHT));
       panel.add(end);
       bigPanel.add(panel, BorderLayout.CENTER);
     }
index fa72e80..9db9f38 100644 (file)
@@ -277,8 +277,7 @@ public class AlignmentView
     if (!seqcigararray.isSeqCigarArray())
     {
       throw new Error(
-              MessageManager
-                      .getString("error.implementation_error_can_only_make_alignmnet_from_cigararray"));
+              "Implementation Error - can only make an alignment view from a CigarArray of sequences.");
     }
     // contigs = seqcigararray.applyDeletions();
     contigs = seqcigararray.getDeletedRegions();
index b176672..e677084 100644 (file)
@@ -448,7 +448,7 @@ public class DasSourceBrowser extends GDasSourceBrowser implements
     seqs.setSelected(seqsrc);
     JPanel panel = new JPanel(new BorderLayout());
     JPanel pane12 = new JPanel(new BorderLayout());
-    pane12.add(new JLabel(MessageManager.getString("label.name")),
+    pane12.add(new JLabel(MessageManager.getString("label.name:")),
             BorderLayout.CENTER);
     pane12.add(nametf, BorderLayout.EAST);
     panel.add(pane12, BorderLayout.NORTH);
index 727c13b..426ea32 100644 (file)
@@ -173,7 +173,8 @@ public class FeatureRenderer extends
     {
       panel = new JPanel(new GridLayout(4, 1));
       tmp = new JPanel();
-      tmp.add(new JLabel(MessageManager.getString("label.select_feature")));
+      tmp.add(new JLabel(MessageManager.getString("label.select_feature")
+              + ":"));
       overlaps = new JComboBox();
       for (int i = 0; i < features.length; i++)
       {
@@ -224,12 +225,13 @@ public class FeatureRenderer extends
 
     tmp = new JPanel();
     panel.add(tmp);
-    tmp.add(new JLabel(MessageManager.getString("label.name"), JLabel.RIGHT));
+    tmp.add(new JLabel(MessageManager.getString("label.name:"),
+            JLabel.RIGHT));
     tmp.add(name);
 
     tmp = new JPanel();
     panel.add(tmp);
-    tmp.add(new JLabel(MessageManager.getString("label.group") + ":",
+    tmp.add(new JLabel(MessageManager.getString("label.group:"),
             JLabel.RIGHT));
     tmp.add(source);
 
@@ -248,7 +250,7 @@ public class FeatureRenderer extends
     bigPanel.add(panel, BorderLayout.NORTH);
 
     panel = new JPanel();
-    panel.add(new JLabel(MessageManager.getString("label.description"),
+    panel.add(new JLabel(MessageManager.getString("label.description:"),
             JLabel.RIGHT));
     description.setFont(JvSwingUtils.getTextAreaFont());
     description.setLineWrap(true);