binaries/src/clustalw/config.status

   1 #! /bin/sh
   2 # Generated by configure.
   3 # Run this file to recreate the current configuration.
   4 # Compiler output produced by configure, useful for debugging
   5 # configure, is in config.log if it exists.
   6
   7 debug=false
   8 ac_cs_recheck=false
   9 ac_cs_silent=false
  10 SHELL=${CONFIG_SHELL-/bin/sh}
  11 ## --------------------- ##
  12 ## M4sh Initialization.  ##
  13 ## --------------------- ##
  14
  15 # Be more Bourne compatible
  16 DUALCASE=1; export DUALCASE # for MKS sh
  17 if test -n "${ZSH_VERSION+set}" && (emulate sh) >/dev/null 2>&1; then
  18   emulate sh
  19   NULLCMD=:
  20   # Pre-4.2 versions of Zsh do word splitting on ${1+"$@"}, which
  21   # is contrary to our usage.  Disable this feature.
  22   alias -g '${1+"$@"}'='"$@"'
  23   setopt NO_GLOB_SUBST
  24 else
  25   case `(set -o) 2>/dev/null` in
  26   *posix*) set -o posix ;;
  27 esac
  28
  29 fi
  30
  31
  32
  33
  34 # PATH needs CR
  35 # Avoid depending upon Character Ranges.
  36 as_cr_letters='abcdefghijklmnopqrstuvwxyz'
  37 as_cr_LETTERS='ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ'
  38 as_cr_Letters=$as_cr_letters$as_cr_LETTERS
  39 as_cr_digits='0123456789'
  40 as_cr_alnum=$as_cr_Letters$as_cr_digits
  41
  42 as_nl='
  43 '
  44 export as_nl
  45 # Printing a long string crashes Solaris 7 /usr/bin/printf.
  46 as_echo='\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\\'
  47 as_echo=$as_echo$as_echo$as_echo$as_echo$as_echo
  48 as_echo=$as_echo$as_echo$as_echo$as_echo$as_echo$as_echo
  49 if (test "X`printf %s $as_echo`" = "X$as_echo") 2>/dev/null; then
  50   as_echo='printf %s\n'
  51   as_echo_n='printf %s'
  52 else
  53   if test "X`(/usr/ucb/echo -n -n $as_echo) 2>/dev/null`" = "X-n $as_echo"; then
  54     as_echo_body='eval /usr/ucb/echo -n "$1$as_nl"'
  55     as_echo_n='/usr/ucb/echo -n'
  56   else
  57     as_echo_body='eval expr "X$1" : "X\\(.*\\)"'
  58     as_echo_n_body='eval
  59       arg=$1;
  60       case $arg in
  61       *"$as_nl"*)
  62         expr "X$arg" : "X\\(.*\\)$as_nl";
  63         arg=`expr "X$arg" : ".*$as_nl\\(.*\\)"`;;
  64       esac;
  65       expr "X$arg" : "X\\(.*\\)" | tr -d "$as_nl"
  66     '
  67     export as_echo_n_body
  68     as_echo_n='sh -c $as_echo_n_body as_echo'
  69   fi
  70   export as_echo_body
  71   as_echo='sh -c $as_echo_body as_echo'
  72 fi
  73
  74 # The user is always right.
  75 if test "${PATH_SEPARATOR+set}" != set; then
  76   PATH_SEPARATOR=:
  77   (PATH='/bin;/bin'; FPATH=$PATH; sh -c :) >/dev/null 2>&1 && {
  78     (PATH='/bin:/bin'; FPATH=$PATH; sh -c :) >/dev/null 2>&1 ||
  79       PATH_SEPARATOR=';'
  80   }
  81 fi
  82
  83 # Support unset when possible.
  84 if ( (MAIL=60; unset MAIL) || exit) >/dev/null 2>&1; then
  85   as_unset=unset
  86 else
  87   as_unset=false
  88 fi
  89
  90
  91 # IFS
  92 # We need space, tab and new line, in precisely that order.  Quoting is
  93 # there to prevent editors from complaining about space-tab.
  94 # (If _AS_PATH_WALK were called with IFS unset, it would disable word
  95 # splitting by setting IFS to empty value.)
  96 IFS=" ""        $as_nl"
  97
  98 # Find who we are.  Look in the path if we contain no directory separator.
  99 case $0 in
 100   *[\\/]* ) as_myself=$0 ;;
 101   *) as_save_IFS=$IFS; IFS=$PATH_SEPARATOR
 102 for as_dir in $PATH
 103 do
 104   IFS=$as_save_IFS
 105   test -z "$as_dir" && as_dir=.
 106   test -r "$as_dir/$0" && as_myself=$as_dir/$0 && break
 107 done
 108 IFS=$as_save_IFS
 109
 110      ;;
 111 esac
 112 # We did not find ourselves, most probably we were run as `sh COMMAND'
 113 # in which case we are not to be found in the path.
 114 if test "x$as_myself" = x; then
 115   as_myself=$0
 116 fi
 117 if test ! -f "$as_myself"; then
 118   $as_echo "$as_myself: error: cannot find myself; rerun with an absolute file name" >&2
 119   { (exit 1); exit 1; }
 120 fi
 121
 122 # Work around bugs in pre-3.0 UWIN ksh.
 123 for as_var in ENV MAIL MAILPATH
 124 do ($as_unset $as_var) >/dev/null 2>&1 && $as_unset $as_var
 125 done
 126 PS1='$ '
 127 PS2='> '
 128 PS4='+ '
 129
 130 # NLS nuisances.
 131 LC_ALL=C
 132 export LC_ALL
 133 LANGUAGE=C
 134 export LANGUAGE
 135
 136 # Required to use basename.
 137 if expr a : '\(a\)' >/dev/null 2>&1 &&
 138    test "X`expr 00001 : '.*\(...\)'`" = X001; then
 139   as_expr=expr
 140 else
 141   as_expr=false
 142 fi
 143
 144 if (basename -- /) >/dev/null 2>&1 && test "X`basename -- / 2>&1`" = "X/"; then
 145   as_basename=basename
 146 else
 147   as_basename=false
 148 fi
 149
 150
 151 # Name of the executable.
 152 as_me=`$as_basename -- "$0" ||
 153 $as_expr X/"$0" : '.*/\([^/][^/]*\)/*$' \| \
 154          X"$0" : 'X\(//\)$' \| \
 155          X"$0" : 'X\(/\)' \| . 2>/dev/null ||
 156 $as_echo X/"$0" |
 157     sed '/^.*\/\([^/][^/]*\)\/*$/{
 158             s//\1/
 159             q
 160           }
 161           /^X\/\(\/\/\)$/{
 162             s//\1/
 163             q
 164           }
 165           /^X\/\(\/\).*/{
 166             s//\1/
 167             q
 168           }
 169           s/.*/./; q'`
 170
 171 # CDPATH.
 172 $as_unset CDPATH
 173
 174
 175
 176   as_lineno_1=$LINENO
 177   as_lineno_2=$LINENO
 178   test "x$as_lineno_1" != "x$as_lineno_2" &&
 179   test "x`expr $as_lineno_1 + 1`" = "x$as_lineno_2" || {
 180
 181   # Create $as_me.lineno as a copy of $as_myself, but with $LINENO
 182   # uniformly replaced by the line number.  The first 'sed' inserts a
 183   # line-number line after each line using $LINENO; the second 'sed'
 184   # does the real work.  The second script uses 'N' to pair each
 185   # line-number line with the line containing $LINENO, and appends
 186   # trailing '-' during substitution so that $LINENO is not a special
 187   # case at line end.
 188   # (Raja R Harinath suggested sed '=', and Paul Eggert wrote the
 189   # scripts with optimization help from Paolo Bonzini.  Blame Lee
 190   # E. McMahon (1931-1989) for sed's syntax.  :-)
 191   sed -n '
 192     p
 193     /[$]LINENO/=
 194   ' <$as_myself |
 195     sed '
 196       s/[$]LINENO.*/&-/
 197       t lineno
 198       b
 199       :lineno
 200       N
 201       :loop
 202       s/[$]LINENO\([^'$as_cr_alnum'_].*\n\)\(.*\)/\2\1\2/
 203       t loop
 204       s/-\n.*//
 205     ' >$as_me.lineno &&
 206   chmod +x "$as_me.lineno" ||
 207     { $as_echo "$as_me: error: cannot create $as_me.lineno; rerun with a POSIX shell" >&2
 208    { (exit 1); exit 1; }; }
 209
 210   # Don't try to exec as it changes $[0], causing all sort of problems
 211   # (the dirname of $[0] is not the place where we might find the
 212   # original and so on.  Autoconf is especially sensitive to this).
 213   . "./$as_me.lineno"
 214   # Exit status is that of the last command.
 215   exit
 216 }
 217
 218
 219 if (as_dir=`dirname -- /` && test "X$as_dir" = X/) >/dev/null 2>&1; then
 220   as_dirname=dirname
 221 else
 222   as_dirname=false
 223 fi
 224
 225 ECHO_C= ECHO_N= ECHO_T=
 226 case `echo -n x` in
 227 -n*)
 228   case `echo 'x\c'` in
 229   *c*) ECHO_T=' ';;     # ECHO_T is single tab character.
 230   *)   ECHO_C='\c';;
 231   esac;;
 232 *)
 233   ECHO_N='-n';;
 234 esac
 235 if expr a : '\(a\)' >/dev/null 2>&1 &&
 236    test "X`expr 00001 : '.*\(...\)'`" = X001; then
 237   as_expr=expr
 238 else
 239   as_expr=false
 240 fi
 241
 242 rm -f conf$$ conf$$.exe conf$$.file
 243 if test -d conf$$.dir; then
 244   rm -f conf$$.dir/conf$$.file
 245 else
 246   rm -f conf$$.dir
 247   mkdir conf$$.dir 2>/dev/null
 248 fi
 249 if (echo >conf$$.file) 2>/dev/null; then
 250   if ln -s conf$$.file conf$$ 2>/dev/null; then
 251     as_ln_s='ln -s'
 252     # ... but there are two gotchas:
 253     # 1) On MSYS, both `ln -s file dir' and `ln file dir' fail.
 254     # 2) DJGPP < 2.04 has no symlinks; `ln -s' creates a wrapper executable.
 255     # In both cases, we have to default to `cp -p'.
 256     ln -s conf$$.file conf$$.dir 2>/dev/null && test ! -f conf$$.exe ||
 257       as_ln_s='cp -p'
 258   elif ln conf$$.file conf$$ 2>/dev/null; then
 259     as_ln_s=ln
 260   else
 261     as_ln_s='cp -p'
 262   fi
 263 else
 264   as_ln_s='cp -p'
 265 fi
 266 rm -f conf$$ conf$$.exe conf$$.dir/conf$$.file conf$$.file
 267 rmdir conf$$.dir 2>/dev/null
 268
 269 if mkdir -p . 2>/dev/null; then
 270   as_mkdir_p=:
 271 else
 272   test -d ./-p && rmdir ./-p
 273   as_mkdir_p=false
 274 fi
 275
 276 if test -x / >/dev/null 2>&1; then
 277   as_test_x='test -x'
 278 else
 279   if ls -dL / >/dev/null 2>&1; then
 280     as_ls_L_option=L
 281   else
 282     as_ls_L_option=
 283   fi
 284   as_test_x='
 285     eval sh -c '\''
 286       if test -d "$1"; then
 287         test -d "$1/.";
 288       else
 289         case $1 in
 290         -*)set "./$1";;
 291         esac;
 292         case `ls -ld'$as_ls_L_option' "$1" 2>/dev/null` in
 293         ???[sx]*):;;*)false;;esac;fi
 294     '\'' sh
 295   '
 296 fi
 297 as_executable_p=$as_test_x
 298
 299 # Sed expression to map a string onto a valid CPP name.
 300 as_tr_cpp="eval sed 'y%*$as_cr_letters%P$as_cr_LETTERS%;s%[^_$as_cr_alnum]%_%g'"
 301
 302 # Sed expression to map a string onto a valid variable name.
 303 as_tr_sh="eval sed 'y%*+%pp%;s%[^_$as_cr_alnum]%_%g'"
 304
 305
 306 exec 6>&1
 307
 308 # Save the log message, to keep $[0] and so on meaningful, and to
 309 # report actual input values of CONFIG_FILES etc. instead of their
 310 # values after options handling.
 311 ac_log="
 312 This file was extended by clustalw $as_me 2.0.12, which was
 313 generated by GNU Autoconf 2.63.  Invocation command line was
 314
 315   CONFIG_FILES    = $CONFIG_FILES
 316   CONFIG_HEADERS  = $CONFIG_HEADERS
 317   CONFIG_LINKS    = $CONFIG_LINKS
 318   CONFIG_COMMANDS = $CONFIG_COMMANDS
 319   $ $0 $@
 320
 321 on `(hostname || uname -n) 2>/dev/null | sed 1q`
 322 "
 323
 324 # Files that config.status was made for.
 325 config_files=" Makefile m4/Makefile src/Makefile src/clustalw_version.h"
 326 config_headers=" src/config.h"
 327 config_commands=" depfiles"
 328
 329 ac_cs_usage="\
 330 \`$as_me' instantiates files from templates according to the
 331 current configuration.
 332
 333 Usage: $0 [OPTION]... [FILE]...
 334
 335   -h, --help       print this help, then exit
 336   -V, --version    print version number and configuration settings, then exit
 337   -q, --quiet, --silent
 338                    do not print progress messages
 339   -d, --debug      don't remove temporary files
 340       --recheck    update $as_me by reconfiguring in the same conditions
 341       --file=FILE[:TEMPLATE]
 342                    instantiate the configuration file FILE
 343       --header=FILE[:TEMPLATE]
 344                    instantiate the configuration header FILE
 345
 346 Configuration files:
 347 $config_files
 348
 349 Configuration headers:
 350 $config_headers
 351
 352 Configuration commands:
 353 $config_commands
 354
 355 Report bugs to <bug-autoconf@gnu.org>."
 356
 357 ac_cs_version="\
 358 clustalw config.status 2.0.12
 359 configured by ./configure, generated by GNU Autoconf 2.63,
 360   with options \"\"
 361
 362 Copyright (C) 2008 Free Software Foundation, Inc.
 363 This config.status script is free software; the Free Software Foundation
 364 gives unlimited permission to copy, distribute and modify it."
 365
 366 ac_pwd='/homes/pvtroshin/workspace/clustengine/binaries/src/clustalw'
 367 srcdir='.'
 368 INSTALL='/usr/bin/install -c'
 369 MKDIR_P='/bin/mkdir -p'
 370 AWK='gawk'
 371 test -n "$AWK" || AWK=awk
 372 # The default lists apply if the user does not specify any file.
 373 ac_need_defaults=:
 374 while test $# != 0
 375 do
 376   case $1 in
 377   --*=*)
 378     ac_option=`expr "X$1" : 'X\([^=]*\)='`
 379     ac_optarg=`expr "X$1" : 'X[^=]*=\(.*\)'`
 380     ac_shift=:
 381     ;;
 382   *)
 383     ac_option=$1
 384     ac_optarg=$2
 385     ac_shift=shift
 386     ;;
 387   esac
 388
 389   case $ac_option in
 390   # Handling of the options.
 391   -recheck | --recheck | --rechec | --reche | --rech | --rec | --re | --r)
 392     ac_cs_recheck=: ;;
 393   --version | --versio | --versi | --vers | --ver | --ve | --v | -V )
 394     $as_echo "$ac_cs_version"; exit ;;
 395   --debug | --debu | --deb | --de | --d | -d )
 396     debug=: ;;
 397   --file | --fil | --fi | --f )
 398     $ac_shift
 399     case $ac_optarg in
 400     *\'*) ac_optarg=`$as_echo "$ac_optarg" | sed "s/'/'\\\\\\\\''/g"` ;;
 401     esac
 402     CONFIG_FILES="$CONFIG_FILES '$ac_optarg'"
 403     ac_need_defaults=false;;
 404   --header | --heade | --head | --hea )
 405     $ac_shift
 406     case $ac_optarg in
 407     *\'*) ac_optarg=`$as_echo "$ac_optarg" | sed "s/'/'\\\\\\\\''/g"` ;;
 408     esac
 409     CONFIG_HEADERS="$CONFIG_HEADERS '$ac_optarg'"
 410     ac_need_defaults=false;;
 411   --he | --h)
 412     # Conflict between --help and --header
 413     { $as_echo "$as_me: error: ambiguous option: $1
 414 Try \`$0 --help' for more information." >&2
 415    { (exit 1); exit 1; }; };;
 416   --help | --hel | -h )
 417     $as_echo "$ac_cs_usage"; exit ;;
 418   -q | -quiet | --quiet | --quie | --qui | --qu | --q \
 419   | -silent | --silent | --silen | --sile | --sil | --si | --s)
 420     ac_cs_silent=: ;;
 421
 422   # This is an error.
 423   -*) { $as_echo "$as_me: error: unrecognized option: $1
 424 Try \`$0 --help' for more information." >&2
 425    { (exit 1); exit 1; }; } ;;
 426
 427   *) ac_config_targets="$ac_config_targets $1"
 428      ac_need_defaults=false ;;
 429
 430   esac
 431   shift
 432 done
 433
 434 ac_configure_extra_args=
 435
 436 if $ac_cs_silent; then
 437   exec 6>/dev/null
 438   ac_configure_extra_args="$ac_configure_extra_args --silent"
 439 fi
 440
 441 if $ac_cs_recheck; then
 442   set X '/bin/sh' './configure'  $ac_configure_extra_args --no-create --no-recursion
 443   shift
 444   $as_echo "running CONFIG_SHELL=/bin/sh $*" >&6
 445   CONFIG_SHELL='/bin/sh'
 446   export CONFIG_SHELL
 447   exec "$@"
 448 fi
 449
 450 exec 5>>config.log
 451 {
 452   echo
 453   sed 'h;s/./-/g;s/^.../## /;s/...$/ ##/;p;x;p;x' <<_ASBOX
 454 ## Running $as_me. ##
 455 _ASBOX
 456   $as_echo "$ac_log"
 457 } >&5
 458
 459 #
 460 # INIT-COMMANDS
 461 #
 462 AMDEP_TRUE="" ac_aux_dir="."
 463
 464
 465 # Handling of arguments.
 466 for ac_config_target in $ac_config_targets
 467 do
 468   case $ac_config_target in
 469     "depfiles") CONFIG_COMMANDS="$CONFIG_COMMANDS depfiles" ;;
 470     "src/config.h") CONFIG_HEADERS="$CONFIG_HEADERS src/config.h" ;;
 471     "Makefile") CONFIG_FILES="$CONFIG_FILES Makefile" ;;
 472     "m4/Makefile") CONFIG_FILES="$CONFIG_FILES m4/Makefile" ;;
 473     "src/Makefile") CONFIG_FILES="$CONFIG_FILES src/Makefile" ;;
 474     "src/clustalw_version.h") CONFIG_FILES="$CONFIG_FILES src/clustalw_version.h" ;;
 475
 476   *) { { $as_echo "$as_me:$LINENO: error: invalid argument: $ac_config_target" >&5
 477 $as_echo "$as_me: error: invalid argument: $ac_config_target" >&2;}
 478    { (exit 1); exit 1; }; };;
 479   esac
 480 done
 481
 482
 483 # If the user did not use the arguments to specify the items to instantiate,
 484 # then the envvar interface is used.  Set only those that are not.
 485 # We use the long form for the default assignment because of an extremely
 486 # bizarre bug on SunOS 4.1.3.
 487 if $ac_need_defaults; then
 488   test "${CONFIG_FILES+set}" = set || CONFIG_FILES=$config_files
 489   test "${CONFIG_HEADERS+set}" = set || CONFIG_HEADERS=$config_headers
 490   test "${CONFIG_COMMANDS+set}" = set || CONFIG_COMMANDS=$config_commands
 491 fi
 492
 493 # Have a temporary directory for convenience.  Make it in the build tree
 494 # simply because there is no reason against having it here, and in addition,
 495 # creating and moving files from /tmp can sometimes cause problems.
 496 # Hook for its removal unless debugging.
 497 # Note that there is a small window in which the directory will not be cleaned:
 498 # after its creation but before its name has been assigned to `$tmp'.
 499 $debug ||
 500 {
 501   tmp=
 502   trap 'exit_status=$?
 503   { test -z "$tmp" || test ! -d "$tmp" || rm -fr "$tmp"; } && exit $exit_status
 504 ' 0
 505   trap '{ (exit 1); exit 1; }' 1 2 13 15
 506 }
 507 # Create a (secure) tmp directory for tmp files.
 508
 509 {
 510   tmp=`(umask 077 && mktemp -d "./confXXXXXX") 2>/dev/null` &&
 511   test -n "$tmp" && test -d "$tmp"
 512 }  ||
 513 {
 514   tmp=./conf$$-$RANDOM
 515   (umask 077 && mkdir "$tmp")
 516 } ||
 517 {
 518    $as_echo "$as_me: cannot create a temporary directory in ." >&2
 519    { (exit 1); exit 1; }
 520 }
 521
 522 # Set up the scripts for CONFIG_FILES section.
 523 # No need to generate them if there are no CONFIG_FILES.
 524 # This happens for instance with `./config.status config.h'.
 525 if test -n "$CONFIG_FILES"; then
 526
 527
 528 ac_cr='\r'
 529 ac_cs_awk_cr=`$AWK 'BEGIN { print "a\rb" }' </dev/null 2>/dev/null`
 530 if test "$ac_cs_awk_cr" = "a${ac_cr}b"; then
 531   ac_cs_awk_cr='\\r'
 532 else
 533   ac_cs_awk_cr=$ac_cr
 534 fi
 535
 536 echo 'BEGIN {' >"$tmp/subs1.awk" &&
 537 cat >>"$tmp/subs1.awk" <<\_ACAWK &&
 538 S["LTLIBOBJS"]=""
 539 S["LIBOBJS"]=""
 540 S["EGREP"]="/bin/grep -E"
 541 S["GREP"]="/bin/grep"
 542 S["CXXCPP"]="g++ -E"
 543 S["RANLIB"]="ranlib"
 544 S["am__fastdepCXX_FALSE"]="#"
 545 S["am__fastdepCXX_TRUE"]=""
 546 S["CXXDEPMODE"]="depmode=gcc3"
 547 S["ac_ct_CXX"]="g++"
 548 S["CXXFLAGS"]="-g -O2"
 549 S["CXX"]="g++"
 550 S["am__fastdepCC_FALSE"]="#"
 551 S["am__fastdepCC_TRUE"]=""
 552 S["CCDEPMODE"]="depmode=gcc3"
 553 S["AMDEPBACKSLASH"]="\\"
 554 S["AMDEP_FALSE"]="#"
 555 S["AMDEP_TRUE"]=""
 556 S["am__quote"]=""
 557 S["am__include"]="include"
 558 S["DEPDIR"]=".deps"
 559 S["OBJEXT"]="o"
 560 S["EXEEXT"]=""
 561 S["ac_ct_CC"]="gcc"
 562 S["CPPFLAGS"]=""
 563 S["LDFLAGS"]=""
 564 S["CFLAGS"]="-g -O2"
 565 S["CC"]="gcc"
 566 S["am__untar"]="${AMTAR} xf -"
 567 S["am__tar"]="${AMTAR} chof - \"$$tardir\""
 568 S["AMTAR"]="${SHELL} /homes/pvtroshin/workspace/clustengine/binaries/src/clustalw/missing --run tar"
 569 S["am__leading_dot"]="."
 570 S["SET_MAKE"]=""
 571 S["AWK"]="gawk"
 572 S["mkdir_p"]="/bin/mkdir -p"
 573 S["MKDIR_P"]="/bin/mkdir -p"
 574 S["INSTALL_STRIP_PROGRAM"]="$(install_sh) -c -s"
 575 S["STRIP"]=""
 576 S["install_sh"]="$(SHELL) /homes/pvtroshin/workspace/clustengine/binaries/src/clustalw/install-sh"
 577 S["MAKEINFO"]="${SHELL} /homes/pvtroshin/workspace/clustengine/binaries/src/clustalw/missing --run makeinfo"
 578 S["AUTOHEADER"]="${SHELL} /homes/pvtroshin/workspace/clustengine/binaries/src/clustalw/missing --run autoheader"
 579 S["AUTOMAKE"]="${SHELL} /homes/pvtroshin/workspace/clustengine/binaries/src/clustalw/missing --run automake-1.10"
 580 S["AUTOCONF"]="${SHELL} /homes/pvtroshin/workspace/clustengine/binaries/src/clustalw/missing --run autoconf"
 581 S["ACLOCAL"]="${SHELL} /homes/pvtroshin/workspace/clustengine/binaries/src/clustalw/missing --run aclocal-1.10"
 582 S["VERSION"]="2.0.12"
 583 S["PACKAGE"]="clustalw"
 584 S["CYGPATH_W"]="echo"
 585 S["am__isrc"]=""
 586 S["INSTALL_DATA"]="${INSTALL} -m 644"
 587 S["INSTALL_SCRIPT"]="${INSTALL}"
 588 S["INSTALL_PROGRAM"]="${INSTALL}"
 589 S["CLUSTALW_NAME"]="ClustalW"
 590 S["CLUSTALW_VERSION"]="2.0.12"
 591 S["target_os"]="linux-gnu"
 592 S["target_vendor"]="unknown"
 593 S["target_cpu"]="x86_64"
 594 S["target"]="x86_64-unknown-linux-gnu"
 595 S["host_os"]="linux-gnu"
 596 S["host_vendor"]="unknown"
 597 S["host_cpu"]="x86_64"
 598 S["host"]="x86_64-unknown-linux-gnu"
 599 S["build_os"]="linux-gnu"
 600 S["build_vendor"]="unknown"
 601 S["build_cpu"]="x86_64"
 602 S["build"]="x86_64-unknown-linux-gnu"
 603 S["target_alias"]=""
 604 S["host_alias"]=""
 605 S["build_alias"]=""
 606 S["LIBS"]=""
 607 S["ECHO_T"]=""
 608 S["ECHO_N"]="-n"
 609 S["ECHO_C"]=""
 610 S["DEFS"]="-DHAVE_CONFIG_H"
 611 S["mandir"]="${datarootdir}/man"
 612 S["localedir"]="${datarootdir}/locale"
 613 S["libdir"]="${exec_prefix}/lib"
 614 S["psdir"]="${docdir}"
 615 S["pdfdir"]="${docdir}"
 616 S["dvidir"]="${docdir}"
 617 S["htmldir"]="${docdir}"
 618 S["infodir"]="${datarootdir}/info"
 619 S["docdir"]="${datarootdir}/doc/${PACKAGE_TARNAME}"
 620 S["oldincludedir"]="/usr/include"
 621 S["includedir"]="${prefix}/include"
 622 S["localstatedir"]="${prefix}/var"
 623 S["sharedstatedir"]="${prefix}/com"
 624 S["sysconfdir"]="${prefix}/etc"
 625 S["datadir"]="${datarootdir}"
 626 S["datarootdir"]="${prefix}/share"
 627 S["libexecdir"]="${exec_prefix}/libexec"
 628 S["sbindir"]="${exec_prefix}/sbin"
 629 S["bindir"]="${exec_prefix}/bin"
 630 S["program_transform_name"]="s,x,x,"
 631 S["prefix"]="/usr/local"
 632 S["exec_prefix"]="${prefix}"
 633 S["PACKAGE_BUGREPORT"]="clustalw@ucd.ie"
 634 S["PACKAGE_STRING"]="clustalw 2.0.12"
 635 S["PACKAGE_VERSION"]="2.0.12"
 636 S["PACKAGE_TARNAME"]="clustalw"
 637 S["PACKAGE_NAME"]="clustalw"
 638 S["PATH_SEPARATOR"]=":"
 639 S["SHELL"]="/bin/sh"
 640 _ACAWK
 641 cat >>"$tmp/subs1.awk" <<_ACAWK &&
 642   for (key in S) S_is_set[key] = 1
 643   FS = "\a"
 644
 645 }
 646 {
 647   line = $ 0
 648   nfields = split(line, field, "@")
 649   substed = 0
 650   len = length(field[1])
 651   for (i = 2; i < nfields; i++) {
 652     key = field[i]
 653     keylen = length(key)
 654     if (S_is_set[key]) {
 655       value = S[key]
 656       line = substr(line, 1, len) "" value "" substr(line, len + keylen + 3)
 657       len += length(value) + length(field[++i])
 658       substed = 1
 659     } else
 660       len += 1 + keylen
 661   }
 662
 663   print line
 664 }
 665
 666 _ACAWK
 667 if sed "s/$ac_cr//" < /dev/null > /dev/null 2>&1; then
 668   sed "s/$ac_cr\$//; s/$ac_cr/$ac_cs_awk_cr/g"
 669 else
 670   cat
 671 fi < "$tmp/subs1.awk" > "$tmp/subs.awk" \
 672   || { { $as_echo "$as_me:$LINENO: error: could not setup config files machinery" >&5
 673 $as_echo "$as_me: error: could not setup config files machinery" >&2;}
 674    { (exit 1); exit 1; }; }
 675 fi # test -n "$CONFIG_FILES"
 676
 677 # Set up the scripts for CONFIG_HEADERS section.
 678 # No need to generate them if there are no CONFIG_HEADERS.
 679 # This happens for instance with `./config.status Makefile'.
 680 if test -n "$CONFIG_HEADERS"; then
 681 cat >"$tmp/defines.awk" <<\_ACAWK ||
 682 BEGIN {
 683 D["PACKAGE_NAME"]=" \"clustalw\""
 684 D["PACKAGE_TARNAME"]=" \"clustalw\""
 685 D["PACKAGE_VERSION"]=" \"2.0.12\""
 686 D["PACKAGE_STRING"]=" \"clustalw 2.0.12\""
 687 D["PACKAGE_BUGREPORT"]=" \"clustalw@ucd.ie\""
 688 D["OS_UNIX"]=" 1"
 689 D["PACKAGE"]=" \"clustalw\""
 690 D["VERSION"]=" \"2.0.12\""
 691 D["STDC_HEADERS"]=" 1"
 692 D["HAVE_SYS_TYPES_H"]=" 1"
 693 D["HAVE_SYS_STAT_H"]=" 1"
 694 D["HAVE_STDLIB_H"]=" 1"
 695 D["HAVE_STRING_H"]=" 1"
 696 D["HAVE_MEMORY_H"]=" 1"
 697 D["HAVE_STRINGS_H"]=" 1"
 698 D["HAVE_INTTYPES_H"]=" 1"
 699 D["HAVE_STDINT_H"]=" 1"
 700 D["HAVE_UNISTD_H"]=" 1"
 701 D["HAVE_STDBOOL_H"]=" 1"
 702 D["HAVE_STDLIB_H"]=" 1"
 703 D["HAVE_MALLOC"]=" 1"
 704   for (key in D) D_is_set[key] = 1
 705   FS = "\a"
 706 }
 707 /^[\t ]*#[\t ]*(define|undef)[\t ]+[_abcdefghijklmnopqrstuvwxyzABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ][_abcdefghijklmnopqrstuvwxyzABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ0123456789]*([\t (]|$)/ {
 708   line = $ 0
 709   split(line, arg, " ")
 710   if (arg[1] == "#") {
 711     defundef = arg[2]
 712     mac1 = arg[3]
 713   } else {
 714     defundef = substr(arg[1], 2)
 715     mac1 = arg[2]
 716   }
 717   split(mac1, mac2, "(") #)
 718   macro = mac2[1]
 719   prefix = substr(line, 1, index(line, defundef) - 1)
 720   if (D_is_set[macro]) {
 721     # Preserve the white space surrounding the "#".
 722     print prefix "define", macro P[macro] D[macro]
 723     next
 724   } else {
 725     # Replace #undef with comments.  This is necessary, for example,
 726     # in the case of _POSIX_SOURCE, which is predefined and required
 727     # on some systems where configure will not decide to define it.
 728     if (defundef == "undef") {
 729       print "/*", prefix defundef, macro, "*/"
 730       next
 731     }
 732   }
 733 }
 734 { print }
 735 _ACAWK
 736   { { $as_echo "$as_me:$LINENO: error: could not setup config headers machinery" >&5
 737 $as_echo "$as_me: error: could not setup config headers machinery" >&2;}
 738    { (exit 1); exit 1; }; }
 739 fi # test -n "$CONFIG_HEADERS"
 740
 741
 742 eval set X "  :F $CONFIG_FILES  :H $CONFIG_HEADERS    :C $CONFIG_COMMANDS"
 743 shift
 744 for ac_tag
 745 do
 746   case $ac_tag in
 747   :[FHLC]) ac_mode=$ac_tag; continue;;
 748   esac
 749   case $ac_mode$ac_tag in
 750   :[FHL]*:*);;
 751   :L* | :C*:*) { { $as_echo "$as_me:$LINENO: error: invalid tag $ac_tag" >&5
 752 $as_echo "$as_me: error: invalid tag $ac_tag" >&2;}
 753    { (exit 1); exit 1; }; };;
 754   :[FH]-) ac_tag=-:-;;
 755   :[FH]*) ac_tag=$ac_tag:$ac_tag.in;;
 756   esac
 757   ac_save_IFS=$IFS
 758   IFS=:
 759   set x $ac_tag
 760   IFS=$ac_save_IFS
 761   shift
 762   ac_file=$1
 763   shift
 764
 765   case $ac_mode in
 766   :L) ac_source=$1;;
 767   :[FH])
 768     ac_file_inputs=
 769     for ac_f
 770     do
 771       case $ac_f in
 772       -) ac_f="$tmp/stdin";;
 773       *) # Look for the file first in the build tree, then in the source tree
 774          # (if the path is not absolute).  The absolute path cannot be DOS-style,
 775          # because $ac_f cannot contain `:'.
 776          test -f "$ac_f" ||
 777            case $ac_f in
 778            [\\/$]*) false;;
 779            *) test -f "$srcdir/$ac_f" && ac_f="$srcdir/$ac_f";;
 780            esac ||
 781            { { $as_echo "$as_me:$LINENO: error: cannot find input file: $ac_f" >&5
 782 $as_echo "$as_me: error: cannot find input file: $ac_f" >&2;}
 783    { (exit 1); exit 1; }; };;
 784       esac
 785       case $ac_f in *\'*) ac_f=`$as_echo "$ac_f" | sed "s/'/'\\\\\\\\''/g"`;; esac
 786       ac_file_inputs="$ac_file_inputs '$ac_f'"
 787     done
 788
 789     # Let's still pretend it is `configure' which instantiates (i.e., don't
 790     # use $as_me), people would be surprised to read:
 791     #    /* config.h.  Generated by config.status.  */
 792     configure_input='Generated from '`
 793           $as_echo "$*" | sed 's|^[^:]*/||;s|:[^:]*/|, |g'
 794         `' by configure.'
 795     if test x"$ac_file" != x-; then
 796       configure_input="$ac_file.  $configure_input"
 797       { $as_echo "$as_me:$LINENO: creating $ac_file" >&5
 798 $as_echo "$as_me: creating $ac_file" >&6;}
 799     fi
 800     # Neutralize special characters interpreted by sed in replacement strings.
 801     case $configure_input in #(
 802     *\&* | *\|* | *\\* )
 803        ac_sed_conf_input=`$as_echo "$configure_input" |
 804        sed 's/[\\\\&|]/\\\\&/g'`;; #(
 805     *) ac_sed_conf_input=$configure_input;;
 806     esac
 807
 808     case $ac_tag in
 809     *:-:* | *:-) cat >"$tmp/stdin" \
 810       || { { $as_echo "$as_me:$LINENO: error: could not create $ac_file" >&5
 811 $as_echo "$as_me: error: could not create $ac_file" >&2;}
 812    { (exit 1); exit 1; }; } ;;
 813     esac
 814     ;;
 815   esac
 816
 817   ac_dir=`$as_dirname -- "$ac_file" ||
 818 $as_expr X"$ac_file" : 'X\(.*[^/]\)//*[^/][^/]*/*$' \| \
 819          X"$ac_file" : 'X\(//\)[^/]' \| \
 820          X"$ac_file" : 'X\(//\)$' \| \
 821          X"$ac_file" : 'X\(/\)' \| . 2>/dev/null ||
 822 $as_echo X"$ac_file" |
 823     sed '/^X\(.*[^/]\)\/\/*[^/][^/]*\/*$/{
 824             s//\1/
 825             q
 826           }
 827           /^X\(\/\/\)[^/].*/{
 828             s//\1/
 829             q
 830           }
 831           /^X\(\/\/\)$/{
 832             s//\1/
 833             q
 834           }
 835           /^X\(\/\).*/{
 836             s//\1/
 837             q
 838           }
 839           s/.*/./; q'`
 840   { as_dir="$ac_dir"
 841   case $as_dir in #(
 842   -*) as_dir=./$as_dir;;
 843   esac
 844   test -d "$as_dir" || { $as_mkdir_p && mkdir -p "$as_dir"; } || {
 845     as_dirs=
 846     while :; do
 847       case $as_dir in #(
 848       *\'*) as_qdir=`$as_echo "$as_dir" | sed "s/'/'\\\\\\\\''/g"`;; #'(
 849       *) as_qdir=$as_dir;;
 850       esac
 851       as_dirs="'$as_qdir' $as_dirs"
 852       as_dir=`$as_dirname -- "$as_dir" ||
 853 $as_expr X"$as_dir" : 'X\(.*[^/]\)//*[^/][^/]*/*$' \| \
 854          X"$as_dir" : 'X\(//\)[^/]' \| \
 855          X"$as_dir" : 'X\(//\)$' \| \
 856          X"$as_dir" : 'X\(/\)' \| . 2>/dev/null ||
 857 $as_echo X"$as_dir" |
 858     sed '/^X\(.*[^/]\)\/\/*[^/][^/]*\/*$/{
 859             s//\1/
 860             q
 861           }
 862           /^X\(\/\/\)[^/].*/{
 863             s//\1/
 864             q
 865           }
 866           /^X\(\/\/\)$/{
 867             s//\1/
 868             q
 869           }
 870           /^X\(\/\).*/{
 871             s//\1/
 872             q
 873           }
 874           s/.*/./; q'`
 875       test -d "$as_dir" && break
 876     done
 877     test -z "$as_dirs" || eval "mkdir $as_dirs"
 878   } || test -d "$as_dir" || { { $as_echo "$as_me:$LINENO: error: cannot create directory $as_dir" >&5
 879 $as_echo "$as_me: error: cannot create directory $as_dir" >&2;}
 880    { (exit 1); exit 1; }; }; }
 881   ac_builddir=.
 882
 883 case "$ac_dir" in
 884 .) ac_dir_suffix= ac_top_builddir_sub=. ac_top_build_prefix= ;;
 885 *)
 886   ac_dir_suffix=/`$as_echo "$ac_dir" | sed 's|^\.[\\/]||'`
 887   # A ".." for each directory in $ac_dir_suffix.
 888   ac_top_builddir_sub=`$as_echo "$ac_dir_suffix" | sed 's|/[^\\/]*|/..|g;s|/||'`
 889   case $ac_top_builddir_sub in
 890   "") ac_top_builddir_sub=. ac_top_build_prefix= ;;
 891   *)  ac_top_build_prefix=$ac_top_builddir_sub/ ;;
 892   esac ;;
 893 esac
 894 ac_abs_top_builddir=$ac_pwd
 895 ac_abs_builddir=$ac_pwd$ac_dir_suffix
 896 # for backward compatibility:
 897 ac_top_builddir=$ac_top_build_prefix
 898
 899 case $srcdir in
 900   .)  # We are building in place.
 901     ac_srcdir=.
 902     ac_top_srcdir=$ac_top_builddir_sub
 903     ac_abs_top_srcdir=$ac_pwd ;;
 904   [\\/]* | ?:[\\/]* )  # Absolute name.
 905     ac_srcdir=$srcdir$ac_dir_suffix;
 906     ac_top_srcdir=$srcdir
 907     ac_abs_top_srcdir=$srcdir ;;
 908   *) # Relative name.
 909     ac_srcdir=$ac_top_build_prefix$srcdir$ac_dir_suffix
 910     ac_top_srcdir=$ac_top_build_prefix$srcdir
 911     ac_abs_top_srcdir=$ac_pwd/$srcdir ;;
 912 esac
 913 ac_abs_srcdir=$ac_abs_top_srcdir$ac_dir_suffix
 914
 915
 916   case $ac_mode in
 917   :F)
 918   #
 919   # CONFIG_FILE
 920   #
 921
 922   case $INSTALL in
 923   [\\/$]* | ?:[\\/]* ) ac_INSTALL=$INSTALL ;;
 924   *) ac_INSTALL=$ac_top_build_prefix$INSTALL ;;
 925   esac
 926   ac_MKDIR_P=$MKDIR_P
 927   case $MKDIR_P in
 928   [\\/$]* | ?:[\\/]* ) ;;
 929   */*) ac_MKDIR_P=$ac_top_build_prefix$MKDIR_P ;;
 930   esac
 931 # If the template does not know about datarootdir, expand it.
 932 # FIXME: This hack should be removed a few years after 2.60.
 933 ac_datarootdir_hack=; ac_datarootdir_seen=
 934
 935 ac_sed_dataroot='
 936 /datarootdir/ {
 937   p
 938   q
 939 }
 940 /@datadir@/p
 941 /@docdir@/p
 942 /@infodir@/p
 943 /@localedir@/p
 944 /@mandir@/p
 945 '
 946 case `eval "sed -n \"\$ac_sed_dataroot\" $ac_file_inputs"` in
 947 *datarootdir*) ac_datarootdir_seen=yes;;
 948 *@datadir@*|*@docdir@*|*@infodir@*|*@localedir@*|*@mandir@*)
 949   { $as_echo "$as_me:$LINENO: WARNING: $ac_file_inputs seems to ignore the --datarootdir setting" >&5
 950 $as_echo "$as_me: WARNING: $ac_file_inputs seems to ignore the --datarootdir setting" >&2;}
 951   ac_datarootdir_hack='
 952   s&@datadir@&${datarootdir}&g
 953   s&@docdir@&${datarootdir}/doc/${PACKAGE_TARNAME}&g
 954   s&@infodir@&${datarootdir}/info&g
 955   s&@localedir@&${datarootdir}/locale&g
 956   s&@mandir@&${datarootdir}/man&g
 957     s&\${datarootdir}&${prefix}/share&g' ;;
 958 esac
 959 ac_sed_extra="/^[        ]*VPATH[        ]*=/{
 960 s/:*\$(srcdir):*/:/
 961 s/:*\${srcdir}:*/:/
 962 s/:*@srcdir@:*/:/
 963 s/^\([^=]*=[     ]*\):*/\1/
 964 s/:*$//
 965 s/^[^=]*=[       ]*$//
 966 }
 967
 968 :t
 969 /@[a-zA-Z_][a-zA-Z_0-9]*@/!b
 970 s|@configure_input@|$ac_sed_conf_input|;t t
 971 s&@top_builddir@&$ac_top_builddir_sub&;t t
 972 s&@top_build_prefix@&$ac_top_build_prefix&;t t
 973 s&@srcdir@&$ac_srcdir&;t t
 974 s&@abs_srcdir@&$ac_abs_srcdir&;t t
 975 s&@top_srcdir@&$ac_top_srcdir&;t t
 976 s&@abs_top_srcdir@&$ac_abs_top_srcdir&;t t
 977 s&@builddir@&$ac_builddir&;t t
 978 s&@abs_builddir@&$ac_abs_builddir&;t t
 979 s&@abs_top_builddir@&$ac_abs_top_builddir&;t t
 980 s&@INSTALL@&$ac_INSTALL&;t t
 981 s&@MKDIR_P@&$ac_MKDIR_P&;t t
 982 $ac_datarootdir_hack
 983 "
 984 eval sed \"\$ac_sed_extra\" "$ac_file_inputs" | $AWK -f "$tmp/subs.awk" >$tmp/out \
 985   || { { $as_echo "$as_me:$LINENO: error: could not create $ac_file" >&5
 986 $as_echo "$as_me: error: could not create $ac_file" >&2;}
 987    { (exit 1); exit 1; }; }
 988
 989 test -z "$ac_datarootdir_hack$ac_datarootdir_seen" &&
 990   { ac_out=`sed -n '/\${datarootdir}/p' "$tmp/out"`; test -n "$ac_out"; } &&
 991   { ac_out=`sed -n '/^[  ]*datarootdir[  ]*:*=/p' "$tmp/out"`; test -z "$ac_out"; } &&
 992   { $as_echo "$as_me:$LINENO: WARNING: $ac_file contains a reference to the variable \`datarootdir'
 993 which seems to be undefined.  Please make sure it is defined." >&5
 994 $as_echo "$as_me: WARNING: $ac_file contains a reference to the variable \`datarootdir'
 995 which seems to be undefined.  Please make sure it is defined." >&2;}
 996
 997   rm -f "$tmp/stdin"
 998   case $ac_file in
 999   -) cat "$tmp/out" && rm -f "$tmp/out";;
1000   *) rm -f "$ac_file" && mv "$tmp/out" "$ac_file";;
1001   esac \
1002   || { { $as_echo "$as_me:$LINENO: error: could not create $ac_file" >&5
1003 $as_echo "$as_me: error: could not create $ac_file" >&2;}
1004    { (exit 1); exit 1; }; }
1005  ;;
1006   :H)
1007   #
1008   # CONFIG_HEADER
1009   #
1010   if test x"$ac_file" != x-; then
1011     {
1012       $as_echo "/* $configure_input  */" \
1013       && eval '$AWK -f "$tmp/defines.awk"' "$ac_file_inputs"
1014     } >"$tmp/config.h" \
1015       || { { $as_echo "$as_me:$LINENO: error: could not create $ac_file" >&5
1016 $as_echo "$as_me: error: could not create $ac_file" >&2;}
1017    { (exit 1); exit 1; }; }
1018     if diff "$ac_file" "$tmp/config.h" >/dev/null 2>&1; then
1019       { $as_echo "$as_me:$LINENO: $ac_file is unchanged" >&5
1020 $as_echo "$as_me: $ac_file is unchanged" >&6;}
1021     else
1022       rm -f "$ac_file"
1023       mv "$tmp/config.h" "$ac_file" \
1024         || { { $as_echo "$as_me:$LINENO: error: could not create $ac_file" >&5
1025 $as_echo "$as_me: error: could not create $ac_file" >&2;}
1026    { (exit 1); exit 1; }; }
1027     fi
1028   else
1029     $as_echo "/* $configure_input  */" \
1030       && eval '$AWK -f "$tmp/defines.awk"' "$ac_file_inputs" \
1031       || { { $as_echo "$as_me:$LINENO: error: could not create -" >&5
1032 $as_echo "$as_me: error: could not create -" >&2;}
1033    { (exit 1); exit 1; }; }
1034   fi
1035 # Compute "$ac_file"'s index in $config_headers.
1036 _am_arg="$ac_file"
1037 _am_stamp_count=1
1038 for _am_header in $config_headers :; do
1039   case $_am_header in
1040     $_am_arg | $_am_arg:* )
1041       break ;;
1042     * )
1043       _am_stamp_count=`expr $_am_stamp_count + 1` ;;
1044   esac
1045 done
1046 echo "timestamp for $_am_arg" >`$as_dirname -- "$_am_arg" ||
1047 $as_expr X"$_am_arg" : 'X\(.*[^/]\)//*[^/][^/]*/*$' \| \
1048          X"$_am_arg" : 'X\(//\)[^/]' \| \
1049          X"$_am_arg" : 'X\(//\)$' \| \
1050          X"$_am_arg" : 'X\(/\)' \| . 2>/dev/null ||
1051 $as_echo X"$_am_arg" |
1052     sed '/^X\(.*[^/]\)\/\/*[^/][^/]*\/*$/{
1053             s//\1/
1054             q
1055           }
1056           /^X\(\/\/\)[^/].*/{
1057             s//\1/
1058             q
1059           }
1060           /^X\(\/\/\)$/{
1061             s//\1/
1062             q
1063           }
1064           /^X\(\/\).*/{
1065             s//\1/
1066             q
1067           }
1068           s/.*/./; q'`/stamp-h$_am_stamp_count
1069  ;;
1070
1071   :C)  { $as_echo "$as_me:$LINENO: executing $ac_file commands" >&5
1072 $as_echo "$as_me: executing $ac_file commands" >&6;}
1073  ;;
1074   esac
1075
1076
1077   case $ac_file$ac_mode in
1078     "depfiles":C) test x"$AMDEP_TRUE" != x"" || {
1079   # Autoconf 2.62 quotes --file arguments for eval, but not when files
1080   # are listed without --file.  Let's play safe and only enable the eval
1081   # if we detect the quoting.
1082   case $CONFIG_FILES in
1083   *\'*) eval set x "$CONFIG_FILES" ;;
1084   *)   set x $CONFIG_FILES ;;
1085   esac
1086   shift
1087   for mf
1088   do
1089     # Strip MF so we end up with the name of the file.
1090     mf=`echo "$mf" | sed -e 's/:.*$//'`
1091     # Check whether this is an Automake generated Makefile or not.
1092     # We used to match only the files named `Makefile.in', but
1093     # some people rename them; so instead we look at the file content.
1094     # Grep'ing the first line is not enough: some people post-process
1095     # each Makefile.in and add a new line on top of each file to say so.
1096     # Grep'ing the whole file is not good either: AIX grep has a line
1097     # limit of 2048, but all sed's we know have understand at least 4000.
1098     if sed -n 's,^#.*generated by automake.*,X,p' "$mf" | grep X >/dev/null 2>&1; then
1099       dirpart=`$as_dirname -- "$mf" ||
1100 $as_expr X"$mf" : 'X\(.*[^/]\)//*[^/][^/]*/*$' \| \
1101          X"$mf" : 'X\(//\)[^/]' \| \
1102          X"$mf" : 'X\(//\)$' \| \
1103          X"$mf" : 'X\(/\)' \| . 2>/dev/null ||
1104 $as_echo X"$mf" |
1105     sed '/^X\(.*[^/]\)\/\/*[^/][^/]*\/*$/{
1106             s//\1/
1107             q
1108           }
1109           /^X\(\/\/\)[^/].*/{
1110             s//\1/
1111             q
1112           }
1113           /^X\(\/\/\)$/{
1114             s//\1/
1115             q
1116           }
1117           /^X\(\/\).*/{
1118             s//\1/
1119             q
1120           }
1121           s/.*/./; q'`
1122     else
1123       continue
1124     fi
1125     # Extract the definition of DEPDIR, am__include, and am__quote
1126     # from the Makefile without running `make'.
1127     DEPDIR=`sed -n 's/^DEPDIR = //p' < "$mf"`
1128     test -z "$DEPDIR" && continue
1129     am__include=`sed -n 's/^am__include = //p' < "$mf"`
1130     test -z "am__include" && continue
1131     am__quote=`sed -n 's/^am__quote = //p' < "$mf"`
1132     # When using ansi2knr, U may be empty or an underscore; expand it
1133     U=`sed -n 's/^U = //p' < "$mf"`
1134     # Find all dependency output files, they are included files with
1135     # $(DEPDIR) in their names.  We invoke sed twice because it is the
1136     # simplest approach to changing $(DEPDIR) to its actual value in the
1137     # expansion.
1138     for file in `sed -n "
1139       s/^$am__include $am__quote\(.*(DEPDIR).*\)$am__quote"'$/\1/p' <"$mf" | \
1140          sed -e 's/\$(DEPDIR)/'"$DEPDIR"'/g' -e 's/\$U/'"$U"'/g'`; do
1141       # Make sure the directory exists.
1142       test -f "$dirpart/$file" && continue
1143       fdir=`$as_dirname -- "$file" ||
1144 $as_expr X"$file" : 'X\(.*[^/]\)//*[^/][^/]*/*$' \| \
1145          X"$file" : 'X\(//\)[^/]' \| \
1146          X"$file" : 'X\(//\)$' \| \
1147          X"$file" : 'X\(/\)' \| . 2>/dev/null ||
1148 $as_echo X"$file" |
1149     sed '/^X\(.*[^/]\)\/\/*[^/][^/]*\/*$/{
1150             s//\1/
1151             q
1152           }
1153           /^X\(\/\/\)[^/].*/{
1154             s//\1/
1155             q
1156           }
1157           /^X\(\/\/\)$/{
1158             s//\1/
1159             q
1160           }
1161           /^X\(\/\).*/{
1162             s//\1/
1163             q
1164           }
1165           s/.*/./; q'`
1166       { as_dir=$dirpart/$fdir
1167   case $as_dir in #(
1168   -*) as_dir=./$as_dir;;
1169   esac
1170   test -d "$as_dir" || { $as_mkdir_p && mkdir -p "$as_dir"; } || {
1171     as_dirs=
1172     while :; do
1173       case $as_dir in #(
1174       *\'*) as_qdir=`$as_echo "$as_dir" | sed "s/'/'\\\\\\\\''/g"`;; #'(
1175       *) as_qdir=$as_dir;;
1176       esac
1177       as_dirs="'$as_qdir' $as_dirs"
1178       as_dir=`$as_dirname -- "$as_dir" ||
1179 $as_expr X"$as_dir" : 'X\(.*[^/]\)//*[^/][^/]*/*$' \| \
1180          X"$as_dir" : 'X\(//\)[^/]' \| \
1181          X"$as_dir" : 'X\(//\)$' \| \
1182          X"$as_dir" : 'X\(/\)' \| . 2>/dev/null ||
1183 $as_echo X"$as_dir" |
1184     sed '/^X\(.*[^/]\)\/\/*[^/][^/]*\/*$/{
1185             s//\1/
1186             q
1187           }
1188           /^X\(\/\/\)[^/].*/{
1189             s//\1/
1190             q
1191           }
1192           /^X\(\/\/\)$/{
1193             s//\1/
1194             q
1195           }
1196           /^X\(\/\).*/{
1197             s//\1/
1198             q
1199           }
1200           s/.*/./; q'`
1201       test -d "$as_dir" && break
1202     done
1203     test -z "$as_dirs" || eval "mkdir $as_dirs"
1204   } || test -d "$as_dir" || { { $as_echo "$as_me:$LINENO: error: cannot create directory $as_dir" >&5
1205 $as_echo "$as_me: error: cannot create directory $as_dir" >&2;}
1206    { (exit 1); exit 1; }; }; }
1207       # echo "creating $dirpart/$file"
1208       echo '# dummy' > "$dirpart/$file"
1209     done
1210   done
1211 }
1212  ;;
1213
1214   esac
1215 done # for ac_tag
1216
1217
1218 { (exit 0); exit 0; }