binaries/src/fasta34/Makefile.mpi4_sql

   1 #
   2 # $Name: fa_34_26_5 $ - $Id: Makefile.mpi4_sql,v 1.19 2004/11/19 15:28:26 wrp Exp $
   3 #
   4 # 21 July, 2000
   5 #
   6 # Makefile for MPI versions of the parallel library comparison programs.
   7 # this file is derived from Makefile.pvm, with only a few differences:
   8 # (1) -DMPI_SRC instead of -DPVM_SRC
   9 # (2) programs are mp34comp*, ms34comp*, and mu34comp* rather than pv34comp*, etc.
  10 # (3) MPI does not require/allow a "worker" program, thus no c3.work*
  11 #
  12
  13 CC= mpicc -g -O
  14 NCC= mpicc -O
  15 LCC= mpicc -O
  16
  17 #ARCH   =       ALPHAMP  (get from $ARCH)
  18
  19 #MPI_ROOT = /opt/share/mpi
  20 #PLIB    =       -L${MPI_ROOT}/lib -lmpich
  21 #XDIR    =       /seqprg/pvm3/bin/LINUX
  22 XDIR    =       ${HOME}/pvm3/bin/LINUX
  23 SDIR    =       .
  24
  25 CFLAGS= -DMPI_SRC -DUNIX -DPCOMPLIB -DBFR=1200 -I${MPI_ROOT}/include -DSRAND=srand -DRAND=random -c -DHAS_INTTYPES -DSAMP_STATS -DMYSQL_DB -I/usr/include/mysql -DPGSQL_DB -I/usr/include/pgsql
  26 # -DMYSQL_DB -I/usr/include/mysql
  27 # -DSFCHAR="'|'" -DSUPERFAMNUM
  28
  29 # standard nxgetaa, no memory mapping for 0 - 6
  30 #LGETLIB=getseq.o lgetlib.o
  31 #NGETLIB=nmgetlib
  32
  33 # memory mapping for 0FASTA, 5PIRVMS, 6GCGBIN
  34 LGETLIB=getseq.o lgetlib.o lgetaa_m.o
  35 NGETLIB=nmgetlib
  36
  37 NRAND=nrandom
  38
  39 SHOWBESTC = mshowbest.c
  40 SHOWALIGN = mshowalign
  41 MWH = p_mw.h
  42 MWHP = p_mw.h w_mw.h
  43
  44 NCBL_LIB=ncbl2_mlib.o mysql_lib.o
  45 #NCBL_LIB=ncbl2_mlib.o
  46 LIB_M= -L/usr/lib/mysql -lmysqlclient -lz -lm -L/usr/lib/pgsql -lpq -lcrypt -lssl
  47 #LIB_M= -lm
  48
  49 LFLAGS= -o
  50
  51 DROPGSW_O = dropgsw.o
  52 DROPNFA_O = drop_nfa.o
  53
  54 include Makefile.mpcom
  55
  56 include Makefile.fcom
  57