binaries/src/fasta34/Makefile.pvm4

   1 #
   2 # $Name: fa_34_26_5 $ - $Id: Makefile.pvm4,v 1.35 2006/12/06 16:53:12 wrp Exp $
   3 #
   4 # tested with pvm3.4.beta7 and pvm3.3.11.  Tested on DEC Alpha, x86
   5 # and Alpha LINUX for DEC/Compaq Alpha/LINUX
   6 #
   7
   8 #CC=/opt/parasoft/bin.linux2/insure -g -DDEBUG
   9 #CC= cc -O -ggdb -DDEBUG
  10 CC= cc -ggdb -O3 -falign-loops=32 -mcpu=7450 -DMacOSX -faltivec -DSW_ALTIVEC
  11
  12
  13 #NCC= cc -O3 -ggdb
  14 NCC= cc -g -falign-loops=32 -O3 -mcpu=7450 -DMacOSX -faltivec -DSW_ALTIVEC
  15
  16 #ARCH   =       NETBSDPOWERPC
  17
  18 PLIB    =       ${PVM_ROOT}/lib/$(ARCH)/libpvm3.a
  19 XDIR    =       /home/slib/pvm3/bin/$(ARCH)
  20 #XDIR    =       /wrpx00.p0/users/wrp/pvm3/bin/$(ARCH)
  21 SDIR    =       .
  22 PVMSRC  =       ${PVM_ROOT}/src
  23
  24 CFLAGS= -DPVM_SRC -DUNIX -DPCOMPLIB -DBFR=1200 -I${PVM_ROOT}/include -DSRAND=srandom -DRAND=random -c -DHAS_INTTYPES  -DSAMP_STATS -DSHOWSIM
  25
  26 HFLAGS= -o
  27 NFLAGS= -o
  28
  29 #NCBL_LIB=ncbl2_mlib.o mysql_lib.o
  30 NCBL_LIB=ncbl2_mlib.o
  31 #LIB_M= -L/usr/lib/mysql -lmysqlclient -lm -lz
  32 LIB_M=  -lm
  33 LIB_WM= -lm
  34
  35 # standard nxgetaa, no memory mapping for 0 - 6
  36 #LGETLIB=lgetlib.o
  37 #NGETLIB=nmgetlib
  38
  39 # memory mapping for 0FASTA, 5PIRVMS, 6GCGBIN
  40 LGETLIB=lgetlib.o lgetaa_m.o
  41 NGETLIB=nmgetlib
  42
  43 NRAND=nrandom
  44
  45 DROPGSW_O = dropgsw.o smith_waterman_altivec.o
  46 DROPNFA_O = drop_nfa.o
  47
  48 # common pv34comp programs
  49 include Makefile.pvcom
  50
  51 # common *.o files for all environments
  52 include Makefile.fcom