binaries/src/fasta34/Makefile.pvm4_sql

   1 #
   2 # $Name: fa_34_26_5 $ - $Id: Makefile.pvm4_sql,v 1.26 2006/05/19 16:29:45 wrp Exp $
   3 #
   4 # tested with pvm3.4.beta7 and pvm3.3.11.  Tested on DEC Alpha, x86
   5 # and Alpha LINUX for DEC/Compaq Alpha/LINUX
   6 #
   7
   8 #CC=/opt/parasoft/bin.linux2/insure -g -DDEBUG
   9 CC= cc -g
  10 NCC= cc -O -g
  11
  12 #ARCH   =       NETBSDPOWERPC
  13
  14 PLIB    =       ${PVM_ROOT}/lib/$(ARCH)/libpvm3.a
  15 XDIR    =       /seqprg/pvm3/bin/$(ARCH)
  16 #XDIR    =       /wrpx00.p0/users/wrp/pvm3/bin/$(ARCH)
  17 SDIR    =       .
  18 PVMSRC  =       ${PVM_ROOT}/src
  19
  20 CFLAGS= -DPVM_SRC -DUNIX -DPCOMPLIB -DBFR=1200 -DBIGMEM -I${PVM_ROOT}/include -DSRAND=srandom -DRAND=random -c -DHAS_INTTYPES  -DSAMP_STATS -DMYSQL_DB -I/usr/include/mysql -DM10_CONS  -DSHOWSIM
  21 # -DSFCHAR="'|'" -DSUPERFAMNUM
  22
  23 HFLAGS= -o
  24 NFLAGS= -o
  25
  26 NCBL_LIB=ncbl2_mlib.o mysql_lib.o
  27 #  pgsql_lib.o
  28 #NCBL_LIB=ncbl2_mlib.o
  29 LIB_M= -L/usr/lib/mysql -lmysqlclient -lm
  30 #LIB_M=  -lm
  31 LIB_WM= -lm
  32
  33 # standard nxgetaa, no memory mapping for 0 - 6
  34 #LGETLIB=lgetlib.o
  35 #NGETLIB=nmgetlib
  36
  37 # memory mapping for 0FASTA, 5PIRVMS, 6GCGBIN
  38 LGETLIB=lgetlib.o lgetaa_m.o
  39 NGETLIB=nmgetlib
  40
  41 NRAND=nrandom
  42
  43 # non-ALTIVEC versions
  44 DROPGSW_O = dropgsw.o
  45 DROPNFA_O = drop_nfa.o
  46
  47 # common pv34comp programs
  48 include Makefile.pvcom
  49
  50 # common *.o files for all environments
  51 include Makefile.fcom
  52