binaries/src/fasta34/Makefile.sgi

   1 #
   2 # makefile for fasta3, fasta3_t.  Use makefile.pvm for pvcompxx.
   3 #
   4 # for more information on FASTA on SGI's, see:
   5 #
   6 #       http://www.sgi.com/chembio/resources/fasta/index.html
   7 #
   8 # use -DBIG_LIB64 to generate 64-bit offsets in map_db .xin files.  This
   9 # only works on SGI's with the -64 option.
  10
  11 CC= cc -w -64 -mips4 -O2 -TENV:X=3 -DSGI_BUG -Wl,-multigot -DIRIX
  12 #CC= cc -64 -mips4 -g -DSGI_BUG -DDEBUG -DIRIX
  13
  14 HFLAGS= -64 -mips4 -o
  15 NFLAGS= -64 -mips4 -o
  16
  17 #CC= cc -g
  18 #HFLAGS= -o
  19 #NFLAGS= -o
  20
  21 LIB_M= -lm
  22 # For R2000/R3000 MIPS Processors, use -mips1
  23 #
  24 #CC= cc -mips1 -O2
  25 #HFLAGS= -mips1 -o
  26 #NFLAGS= -mips1 -o
  27 #
  28 # For R4000 MIPS Processors, use -mips2:
  29 #
  30 #CC = cc -mips2 -O2
  31 #HFLAGS= -mips2 -o
  32 #NFLAGS= -mips2 -o
  33 #
  34
  35 CFLAGS= -DSHOWSIM -DUNIX -DTIMES -DHZ=100 -DBIGMEM -DSFCHAR="':'" -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"crick.med.virginia.edu/fasta/cgi"' -DIS_BIG_ENDIAN -DUSE_MMAP -DBIG_LIB64 -DHAS_INTTYPES -DSAMP_STATS -DPGM_DOC
  36
  37 THR_SUBS = pthr_subs2
  38 THR_LIBS = -lpthread
  39 THR_CC =
  40
  41 XDIR = /seqprg/slib/bin
  42
  43 DROPNFA_O = drop_nfa.o
  44 DROPGSW_O = dropgsw.o
  45 DROPRSS_O = dropnsw.o
  46 DROPTFA_O = drop_tfa.o
  47
  48 # renamed (fasta34)  programs
  49 include Makefile34m.common
  50 # conventional (fasta3) names
  51 # include Makefile.common